299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_R0030 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_R0030  tRNA-Glu  100 
 
 		 78 bp  155  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.454772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0050  tRNA-Glu  92.31 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.517089  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna16  tRNA-Glu  92.31 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna14  tRNA-Glu  92.31 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.875319  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0047  tRNA-Glu  92.31 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.374148  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0017  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.299641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0045  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0510305  normal  0.152428 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0059  tRNA-Glu  91.03 
 
 		 76 bp  93.7  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000917431  normal  0.553022 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0026  tRNA-Glu  91.03 
 
 		 76 bp  93.7  6e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.197245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0046  tRNA-Glu  91.03 
 
 		 76 bp  93.7  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118448  normal  0.0335348 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0049  tRNA-Glu  91.03 
 
 		 76 bp  93.7  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000939786  normal  0.015549 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0022  tRNA-Glu  91.03 
 
 		 76 bp  93.7  6e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.777286  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0028  tRNA-Glu  91.03 
 
 		 76 bp  93.7  6e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0945817  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0028  tRNA-Glu  91.03 
 
 		 76 bp  93.7  6e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0022  tRNA-Glu  91.03 
 
 		 76 bp  93.7  6e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0055  tRNA-Glu  91.03 
 
 		 76 bp  93.7  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101693  normal  0.730333 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0057  tRNA-Glu  91.03 
 
 		 76 bp  93.7  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000756674  normal  0.548722 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0065  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363336 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0040  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0070  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198719 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0023  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0274454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0026  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0141321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0019  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.39609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0039  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.554845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0043  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0062  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0068  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.196442 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0037  tRNA-Glu  89.74 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0115757  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0026  tRNA-Glu  89.74 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.307498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0026  tRNA-Glu  89.74 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.062518  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0045  tRNA-Glu  89.74 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0001  tRNA-Glu  89.74 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0034  tRNA-Glu  89.74 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.224261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tGlu01  tRNA-Glu  89.74 
 
 		 79 bp  85.7  0.000000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.484379  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tGlu02  tRNA-Glu  89.74 
 
 		 79 bp  85.7  0.000000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tGlu03  tRNA-Glu  89.74 
 
 		 79 bp  85.7  0.000000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0038  tRNA-Glu  89.74 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.012292  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0030  tRNA-Glu  89.74 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0002  tRNA-Glu  88.46 
 
 		 78 bp  83.8  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.9841800000000004e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0004  tRNA-Glu  88.46 
 
 		 78 bp  83.8  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.0060400000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0022  tRNA-Glu  88.46 
 
 		 78 bp  83.8  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150409  hitchhiker  0.00052092 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0031  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0047  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.00000000000669443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0031  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000000347346  normal  0.220713 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0018  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00000128898  normal  0.570463 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0057  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203047  normal  0.241015 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0025  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000296278  hitchhiker  0.00778031 
 
 
-
 
NC_003295  RS04526  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000165609  normal  0.307347 
 
 
-
 
NC_003295  RS04527  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000178572  normal  0.319269 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Glu-3  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000216886  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0026  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  unclonable  0.00000000000157015  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0029  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000000000053193  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2622  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00008673  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2624  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000121359  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0053  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000584224  normal  0.231331 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0055  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000192747  normal  0.233868 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1986  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000534255  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1988  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000480253  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0042  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119208  normal  0.0515471 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0044  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000025462  normal  0.0504095 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0028  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000039203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0031  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000481726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0093  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000098404  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0095  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000570772  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0097  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000337615  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0053  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000314245  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0055  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000384652  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0057  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000000345066  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0051  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149028  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0053  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000275234  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0055  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211677  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0053  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000534013  normal  0.360789 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0055  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000108915  normal  0.346684 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0033  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000357048  normal  0.208315 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0057  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000163741  normal  0.479813 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2100  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000590087  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0049  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.00000000000656103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0052  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.925449 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3213  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000104569  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2483  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.000000000000121548  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2485  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.000000000000126526  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2537  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00245562  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2539  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00809573  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1373  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.000000000880968  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0027  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.00000000012811  hitchhiker  0.00448856 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0015  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  0.000000000183317  normal  0.335079 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0034  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00296097  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0029  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000000039615  normal  0.441106 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0043  tRNA-Glu  88.46 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  7.66398e-18  hitchhiker  0.000611065 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0053  tRNA-Glu  88.46 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.646689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0045  tRNA-Glu  88.46 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000328054  normal  0.0346347 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0055  tRNA-Glu  88.46 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.380229  normal  0.600027 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0053  tRNA-Glu  88.46 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000330135  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0054  tRNA-Glu  88.46 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000364712  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0055  tRNA-Glu  88.46 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000000537124  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0052  tRNA-Glu  87.18 
 
 		 78 bp  75.8  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0061  tRNA-Glu  91.23 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000386077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0063  tRNA-Glu  91.23 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000853208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0065  tRNA-Glu  91.23 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.000000000000208338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0018  tRNA-Glu  88.16 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.159981  normal  0.105667 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>