36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0271 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0271  hypothetical protein  100 
 
 		 337 aa  697    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000357372  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0294  TPR repeat-containing protein  46.01 
 
 		 339 aa  294  2e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.033214  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2454  TPR repeat-containing protein  39.94 
 
 		 326 aa  252  6e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0869299  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1974  hypothetical protein  41.85 
 
 		 317 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.260801  normal  0.0442943 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2157  hypothetical protein  40.87 
 
 		 332 aa  243  5e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.97673  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0089  hypothetical protein  43.79 
 
 		 342 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28150  hypothetical protein  42.71 
 
 		 292 aa  236  6e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0121186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1110  TPR repeat-containing protein  47.35 
 
 		 312 aa  232  8.000000000000001e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.166102  normal  0.864016 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0530  tetratricopeptide TPR_4  39.67 
 
 		 314 aa  229  4e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.491525  normal  0.49371 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1828  TPR repeat-containing protein  38.31 
 
 		 310 aa  217  2e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2524  peptidase C39, bacteriocin processing  42.09 
 
 		 317 aa  210  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.497952  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4194  hypothetical protein  35.11 
 
 		 347 aa  186  4e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1043  hypothetical protein  34.58 
 
 		 322 aa  184  3e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1288  hypothetical protein  38.11 
 
 		 330 aa  175  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000550461 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03118  FOG: TPR repeat 2396 protein  30.77 
 
 		 308 aa  151  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20370  hypothetical protein  43.37 
 
 		 172 aa  139  7.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2693  hypothetical protein  31.82 
 
 		 231 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3703  hypothetical protein  31.51 
 
 		 224 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3525  hypothetical protein  31.53 
 
 		 244 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.675078  normal  0.214556 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1948  hypothetical protein  31.25 
 
 		 267 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.168356  hitchhiker  0.000258843 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3246  hypothetical protein  31.07 
 
 		 244 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.310754  normal  0.875608 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2447  hypothetical protein  31.55 
 
 		 244 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.779936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2426  hypothetical protein  31.02 
 
 		 231 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.909088  normal  0.197222 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0637  hypothetical protein  32.29 
 
 		 188 aa  96.3  7e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.323019  normal  0.918011 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1104  hypothetical protein  31.32 
 
 		 223 aa  90.5  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0738368 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0719  peptidase C39 bacteriocin processing  31.11 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0958  peptidase C39 bacteriocin processing  25.37 
 
 		 164 aa  58.2  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000835793  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  29.51 
 
 		 1764 aa  47.8  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  31.76 
 
 		 722 aa  47  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  24.53 
 
 		 1252 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1468  TPR repeat-containing protein  23.1 
 
 		 368 aa  44.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 1297 aa  44.7  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  24.53 
 
 		 1252 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2550  TPR repeat-containing protein  23.84 
 
 		 670 aa  43.9  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.507483  normal  0.0818134 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3268  TPR repeat-containing protein  29.25 
 
 		 441 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2853  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.25 
 
 		 441 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0260503 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>