31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2194 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2194  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 		 129 aa  256  6e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6487  putative carboxymuconolactone decarboxylase  59.09 
 
 		 127 aa  73.9  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4958  carboxymuconolactone decarboxylase  32.22 
 
 		 146 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.268542  normal  0.217933 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4575  carboxymuconolactone decarboxylase  32.22 
 
 		 146 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4663  carboxymuconolactone decarboxylase  32.22 
 
 		 146 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.173189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1906  carboxymuconolactone decarboxylase  33.75 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528731  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10786  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.22 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.898844 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0343  carboxymuconolactone decarboxylase  31.25 
 
 		 269 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  0.441011 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0322  carboxymuconolactone decarboxylase  31.25 
 
 		 269 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0333  carboxymuconolactone decarboxylase  31.25 
 
 		 269 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1603  carboxymuconolactone decarboxylase  32.94 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5154  carboxymuconolactone decarboxylase  30.95 
 
 		 152 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3850  Carboxymuconolactone decarboxylase  37.96 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3284  carboxymuconolactone decarboxylase  29.27 
 
 		 198 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3396  carboxymuconolactone decarboxylase  28.75 
 
 		 266 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.346548  normal  0.629357 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2865  4-carboxymuconolactone decarboxylase, putative  32.93 
 
 		 262 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133043  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1438  carboxymuconolactone decarboxylase  32.53 
 
 		 308 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3222  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.17 
 
 		 248 aa  45.1  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.02067  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0843  carboxymuconolactone decarboxylase  31.4 
 
 		 259 aa  44.7  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.536951  normal  0.096524 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2114  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.65 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000414856 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4219  carboxymuconolactone decarboxylase  28.44 
 
 		 252 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.40327 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3042  Alpha/beta hydrolase  40 
 
 		 380 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4453  carboxymuconolactone decarboxylase  29.11 
 
 		 396 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0765828  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2018  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  34.88 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0370669  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2039  4-carboxymuconolactone decarboxylase  30.84 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.202589  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4122  Carboxymuconolactone decarboxylase  35.9 
 
 		 107 aa  42  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.847034 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6127  4-carboxymuconolactone decarboxylase  27.59 
 
 		 136 aa  41.2  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0655  Carboxymuconolactone decarboxylase  33.8 
 
 		 398 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47766  normal  0.236933 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0302  carboxymuconolactone decarboxylase  29 
 
 		 389 aa  40.4  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0830882  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2527  carboxymuconolactone decarboxylase  29.31 
 
 		 132 aa  40.8  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7078  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.88 
 
 		 134 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0342158  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>