169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1876 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1876  hypothetical protein  100 
 
 		 372 aa  751    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.425514  normal  0.686194 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3415  metalloprotease-like protein  53.38 
 
 		 353 aa  318  1e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.154601  normal  0.658534 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0662  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  34.98 
 
 		 324 aa  152  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6735  metalloprotease-like protein  31.97 
 
 		 287 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.331634  normal  0.274801 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4326  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  32.1 
 
 		 331 aa  130  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2920  hypothetical protein  30.16 
 
 		 322 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2919  metalloprotease  29.79 
 
 		 319 aa  127  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0930  metalloprotease-like protein  30.93 
 
 		 341 aa  122  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52614  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4325  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  28.33 
 
 		 319 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0858  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  36.36 
 
 		 347 aa  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0459016  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4616  metalloprotease-like protein  30.96 
 
 		 258 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.839032  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06840  predicted metalloprotease  33.18 
 
 		 319 aa  106  6e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.219653  normal  0.038026 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10350  predicted metalloprotease  31.6 
 
 		 322 aa  106  8e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.996596  normal  0.0302489 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0857  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  34.12 
 
 		 302 aa  103  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18507  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1467  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  30.4 
 
 		 358 aa  98.2  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2971  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  29.77 
 
 		 289 aa  97.8  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.489852 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1250  metalloprotease-like protein  28.97 
 
 		 289 aa  97.1  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1366  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  28.97 
 
 		 289 aa  97.1  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6736  metalloprotease-like protein  27.73 
 
 		 259 aa  96.3  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.550772  normal  0.186259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4034  metalloprotease-like protein  31.34 
 
 		 266 aa  95.9  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.096293  normal  0.0588825 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2852  zinc protease  30.19 
 
 		 287 aa  95.9  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3136  hypothetical protein  28.5 
 
 		 288 aa  95.5  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02367  hypothetical protein  28.77 
 
 		 287 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1194  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  28.77 
 
 		 287 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2719  zinc protease  29.72 
 
 		 287 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.884525  normal  0.479872 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02329  hypothetical protein  28.77 
 
 		 287 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2631  zinc protease  29.72 
 
 		 287 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3697  hypothetical protein  28.77 
 
 		 287 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2745  zinc protease  29.72 
 
 		 287 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.592779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2606  hypothetical protein  28.77 
 
 		 287 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1201  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  28.77 
 
 		 287 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2622  hypothetical protein  28.77 
 
 		 287 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2847  hypothetical protein  28.1 
 
 		 287 aa  94  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2679  zinc protease  29.72 
 
 		 287 aa  93.6  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2755  hypothetical protein  28.3 
 
 		 287 aa  94  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3115  hypothetical protein  27.57 
 
 		 299 aa  92  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0633629  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2367  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  29.09 
 
 		 294 aa  90.1  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39378  normal  0.55814 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1259  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  26.39 
 
 		 311 aa  88.6  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.109389  normal  0.980751 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2771  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  29.19 
 
 		 295 aa  88.6  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1681  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  27.46 
 
 		 310 aa  87.8  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.713078  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3506  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  28.57 
 
 		 288 aa  87.4  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1643  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  29.41 
 
 		 285 aa  87.4  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.18536  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4077  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  29.35 
 
 		 279 aa  87  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.813823  normal  0.846843 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2503  hypothetical protein  30.46 
 
 		 295 aa  87  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0194422 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1219  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  33.01 
 
 		 305 aa  86.7  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25770  predicted metalloprotease  29.15 
 
 		 312 aa  86.3  8e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1485  hypothetical protein  29 
 
 		 308 aa  85.5  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1749  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  31.34 
 
 		 284 aa  84.3  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.639669  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2846  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  26.38 
 
 		 517 aa  84.3  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1074  hypothetical protein  30.39 
 
 		 303 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.737672  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4615  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  27.63 
 
 		 301 aa  83.2  0.000000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.237842 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4245  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  27.63 
 
 		 301 aa  83.2  0.000000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.162984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2086  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  27.1 
 
 		 289 aa  82.8  0.000000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.10483  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1201  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  29.9 
 
 		 319 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1265  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  27.92 
 
 		 300 aa  81.3  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.496917 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0910  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  30.6 
 
 		 279 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0387284 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1207  hypothetical protein  27.36 
 
 		 294 aa  79.7  0.00000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3868  zinc metallopeptidase putative  28.77 
 
 		 283 aa  79  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2333  hypothetical protein  28.92 
 
 		 281 aa  79  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2115  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  26.53 
 
 		 285 aa  78.2  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2970  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  28.75 
 
 		 306 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0222761 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2264  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  28.91 
 
 		 293 aa  78.2  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.503847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4913  hypothetical protein  26.96 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0109468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3563  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  29.72 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3535  hypothetical protein  33.33 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.995239 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3224  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  27.94 
 
 		 307 aa  77  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4616  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  27.51 
 
 		 282 aa  77  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16102 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2040  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  27.01 
 
 		 284 aa  77  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2711  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  28.57 
 
 		 306 aa  76.6  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1251  zinc protease  26.67 
 
 		 292 aa  76.6  0.0000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00055946  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3482  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  26.98 
 
 		 288 aa  76.3  0.0000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4041  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  29.44 
 
 		 302 aa  76.3  0.0000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000295256 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2602  hypothetical protein  28.43 
 
 		 308 aa  75.9  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.529546  normal  0.220369 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4765  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  27.65 
 
 		 301 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0442  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  27.01 
 
 		 300 aa  75.5  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.893193 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4365  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  27.94 
 
 		 308 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155164  normal  0.0204916 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2331  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  27.46 
 
 		 295 aa  74.3  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.88553 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4250  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  24.75 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1914  metalloprotease  26.98 
 
 		 429 aa  72.4  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3871  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  30.94 
 
 		 284 aa  72.4  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.198703 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0438  hypothetical protein  29.52 
 
 		 292 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11530  predicted metalloprotease  26.61 
 
 		 315 aa  72.4  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0775973  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4019  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  30.19 
 
 		 292 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5419  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  26 
 
 		 297 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.893358  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4657  zinc metallopeptidase, putative  27.92 
 
 		 296 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4289  hypothetical protein  26.9 
 
 		 296 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2726  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  27.7 
 
 		 284 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07770  zinc metallopeptidase  29.44 
 
 		 284 aa  71.6  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0466  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  29.25 
 
 		 293 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8759  hypothetical protein  25.96 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2312  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  26.32 
 
 		 292 aa  71.6  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000120651  normal  0.307835 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3879  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  28.23 
 
 		 295 aa  72  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0936  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  30.29 
 
 		 302 aa  71.2  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.367422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1850  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  24.89 
 
 		 274 aa  71.2  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000303807 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1761  metalloprotease  27.83 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.451117  normal  0.0302656 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3823  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  29.72 
 
 		 292 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1324  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  27.43 
 
 		 306 aa  70.1  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6074  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  27.06 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3451  hypothetical protein  27.14 
 
 		 286 aa  70.1  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0462  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  29.25 
 
 		 292 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.938869 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>