31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1331 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1331  hypothetical protein  100 
 
 		 47 aa  97.4  6e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  89.29 
 
 		 988 aa  55.8  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  89.29 
 
 		 988 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  89.29 
 
 		 988 aa  56.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  89.29 
 
 		 964 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  89.29 
 
 		 988 aa  56.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  89.29 
 
 		 988 aa  56.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  85.71 
 
 		 988 aa  55.1  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  85.71 
 
 		 988 aa  54.3  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  85.71 
 
 		 988 aa  53.9  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  82.14 
 
 		 988 aa  53.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  82.14 
 
 		 988 aa  53.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  85.71 
 
 		 988 aa  52.8  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  78.57 
 
 		 988 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  78.57 
 
 		 988 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  78.57 
 
 		 606 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0150  Tn1721 transposase  78.57 
 
 		 310 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.751061 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0035  transposase  78.57 
 
 		 255 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.401081  normal  0.351265 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1576  transposase  78.57 
 
 		 203 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0122395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  78.57 
 
 		 985 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  82.14 
 
 		 988 aa  50.1  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  82.14 
 
 		 988 aa  50.1  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  86.96 
 
 		 990 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  86.96 
 
 		 990 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  86.96 
 
 		 990 aa  43.5  0.0009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  86.96 
 
 		 755 aa  43.5  0.0009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  86.96 
 
 		 990 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  86.96 
 
 		 990 aa  43.5  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  86.96 
 
 		 990 aa  43.5  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  86.96 
 
 		 990 aa  43.5  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  86.96 
 
 		 989 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>