More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0573 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0573  rhodanese-like protein  100 
 
 		 109 aa  220  4.9999999999999996e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2218  rhodanese domain protein  54.46 
 
 		 118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0630  Rhodanese domain protein  43.81 
 
 		 109 aa  94.4  5e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.220757 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  46.88 
 
 		 220 aa  93.6  8e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1906  Rhodanese domain protein  53.09 
 
 		 105 aa  93.2  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000236409  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2188  Rhodanese domain protein  50.5 
 
 		 109 aa  87.8  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0415469  hitchhiker  0.000000235552 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2558  rhodanese-like domain protein  50.5 
 
 		 109 aa  87.8  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.029677  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0094  rhodanese-like protein  42.06 
 
 		 110 aa  87.4  6e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  37.86 
 
 		 127 aa  86.3  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  51.95 
 
 		 130 aa  85.9  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  43 
 
 		 129 aa  85.1  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  48.78 
 
 		 123 aa  82.8  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  40.52 
 
 		 142 aa  82  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  45.68 
 
 		 269 aa  82.4  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  46.51 
 
 		 141 aa  82  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  43.88 
 
 		 145 aa  80.9  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  41.58 
 
 		 138 aa  80.5  0.000000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1271  rhodanese-like protein  38.83 
 
 		 138 aa  80.5  0.000000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  41.58 
 
 		 133 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  48.72 
 
 		 103 aa  79.7  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  39 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2852  Rhodanese domain-containing protein  50 
 
 		 113 aa  79.3  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  42.31 
 
 		 142 aa  78.6  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2680  rhodanese-like protein  46.32 
 
 		 105 aa  78.2  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  41.25 
 
 		 125 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  39.42 
 
 		 121 aa  78.2  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06606  hypothetical protein  41.98 
 
 		 116 aa  77  0.00000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0020  Rhodanese domain-containing protein  45.88 
 
 		 119 aa  76.3  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.529293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5022  rhodanese domain-containing protein  39.58 
 
 		 111 aa  76.6  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635764 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0156  rhodanese domain-containing protein  48.15 
 
 		 111 aa  76.6  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.634327  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000724  phage shock protein E  43.04 
 
 		 116 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1506  rhodanese-like domain-containing protein  36.78 
 
 		 107 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207517  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2644  Rhodanese domain protein  46.67 
 
 		 102 aa  75.9  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00713239  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3925  rhodanese-like protein  39.18 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0429  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  47.3 
 
 		 820 aa  75.1  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000601829  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  39.58 
 
 		 170 aa  75.1  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0213  Rhodanese domain protein  43.68 
 
 		 109 aa  75.1  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  43.04 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  44.94 
 
 		 459 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1215  beta-lactamase domain-containing protein  46.75 
 
 		 460 aa  74.3  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0173274 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4870  rhodanese domain-containing protein  38.78 
 
 		 103 aa  74.3  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00622661  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0398  phage shock protein E, putative  34.65 
 
 		 118 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  41.67 
 
 		 113 aa  73.9  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0959  Rhodanese domain protein  39.08 
 
 		 107 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2900  rhodanese domain-containing protein  39.24 
 
 		 127 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423457  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2894  rhodanese domain-containing protein  45.1 
 
 		 113 aa  73.6  0.0000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127379  normal  0.672082 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4064  rhodanese domain-containing protein  39.24 
 
 		 127 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2634  NADH oxidase/rhodanese-related sulfurtransferase  50 
 
 		 105 aa  73.6  0.0000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2913  beta-lactamase domain protein  40 
 
 		 469 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3678  hypothetical protein  39.08 
 
 		 107 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.233085 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2891  Rhodanese domain protein  42.5 
 
 		 98 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2405  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  36.17 
 
 		 562 aa  73.6  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.692685  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1056  putative rhodanese-related sulfurtransferase  35.56 
 
 		 116 aa  73.2  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.218606  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1146  Rhodanese domain protein  46.99 
 
 		 137 aa  72.8  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0154905  hitchhiker  0.0000789559 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2630  Rhodanese domain protein  47.06 
 
 		 112 aa  72.8  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0913  rhodanese-like domain protein  39.24 
 
 		 127 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.130078  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2763  Rhodanese domain protein  35.71 
 
 		 105 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0148242  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  40.51 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2480  rhodanese domain-containing protein  36.78 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  32.35 
 
 		 476 aa  72.8  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  40.7 
 
 		 141 aa  72  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3085  rhodanese-like protein  39.51 
 
 		 459 aa  72.4  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0564  Rhodanese domain protein  41.49 
 
 		 98 aa  72.8  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000375905  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4320  rhodanese-like domain protein  39.24 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1869  rhodanese domain-containing protein  46.25 
 
 		 117 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000584453  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1570  rhodanese-like domain-containing protein  37.5 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5264  Rhodanese domain protein  42.57 
 
 		 110 aa  71.6  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43 
 
 		 389 aa  72  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  37.86 
 
 		 116 aa  72  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  41.41 
 
 		 132 aa  72  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  40.51 
 
 		 124 aa  72  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3100  rhodanese domain-containing protein  35.63 
 
 		 109 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0563  Rhodanese domain protein  39.76 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000600861  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3125  rhodanese-like domain-containing protein  39.47 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2045  rhodanese-like domain-containing protein  39.47 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.550294  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2568  rhodanese-like domain-containing protein  39.47 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  39.58 
 
 		 113 aa  71.2  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0728  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  39.56 
 
 		 566 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0715  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  39.56 
 
 		 566 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3064  rhodanese domain-containing protein  39.47 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4285  rhodanese-like domain-containing protein  37.97 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4112  rhodanese-like domain-containing protein  37.97 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3953  rhodanese-related sulfurtransferase  37.97 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3963  rhodanese-related sulfurtransferase  37.97 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4432  rhodanese-like domain-containing protein  37.97 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4229  rhodanese-like domain protein  37.97 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4340  rhodanese-like domain protein  37.97 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4642  Rhodanese domain protein  34.69 
 
 		 109 aa  70.9  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.845465  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4512  rhodanese domain-containing protein  35.42 
 
 		 111 aa  70.5  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0870  rhodanese domain-containing protein  40.43 
 
 		 98 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01120  Rhodanese-related sulfurtransferase  41.51 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0154  rhodanese domain-containing protein  42.86 
 
 		 113 aa  70.5  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0667  Rhodanese domain protein  34.69 
 
 		 104 aa  70.5  0.000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0750  rhodanese-like protein  38.37 
 
 		 107 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0093  Rhodanese domain protein  43.53 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0690  rhodanese domain-containing protein  38.3 
 
 		 98 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.623453  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3463  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.62 
 
 		 379 aa  69.7  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.838901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4502  rhodanese domain protein  38.3 
 
 		 106 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000125485 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  35 
 
 		 123 aa  68.9  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0874  rhodanese domain family protein  40 
 
 		 98 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000677114 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>