More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0050 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0050  phosphopyruvate hydratase  100 
 
 
429 aa  865    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0050  phosphopyruvate hydratase  99.77 
 
 
429 aa  863    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0174  phosphopyruvate hydratase  78.09 
 
 
429 aa  695    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.165268  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1722  phosphopyruvate hydratase  72.73 
 
 
432 aa  643    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1726  phosphopyruvate hydratase  77.49 
 
 
431 aa  684    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000127224  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2958  phosphopyruvate hydratase  68.85 
 
 
430 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000744717  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3133  phosphopyruvate hydratase  67.92 
 
 
430 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2987  phosphopyruvate hydratase  65.8 
 
 
428 aa  584  1e-166  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000287207  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1505  phosphopyruvate hydratase  65.19 
 
 
431 aa  581  1.0000000000000001e-165  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.246827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1295  phosphopyruvate hydratase  65.19 
 
 
431 aa  581  1.0000000000000001e-165  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000258447  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3678  phosphopyruvate hydratase  64.87 
 
 
430 aa  578  1e-164  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00320398  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4985  phosphopyruvate hydratase  64.49 
 
 
431 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4814  phosphopyruvate hydratase  64.49 
 
 
431 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4824  phosphopyruvate hydratase  64.49 
 
 
431 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.223702  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4927  phosphopyruvate hydratase  64.72 
 
 
431 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1310  phosphopyruvate hydratase  64.87 
 
 
429 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5364  phosphopyruvate hydratase  64.49 
 
 
431 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0413646  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5220  phosphopyruvate hydratase  64.49 
 
 
431 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0136  phosphopyruvate hydratase  65.26 
 
 
427 aa  574  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1305  phosphopyruvate hydratase  64.4 
 
 
432 aa  570  1e-161  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5238  phosphopyruvate hydratase  64.49 
 
 
431 aa  560  1e-158  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0256572  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3933  enolase  63.7 
 
 
426 aa  559  1e-158  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000019797  normal  0.771462 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5284  phosphopyruvate hydratase  64.49 
 
 
431 aa  560  1e-158  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000135484  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5249  phosphopyruvate hydratase  64.72 
 
 
431 aa  559  1e-158  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.33817  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1780  phosphopyruvate hydratase  64.34 
 
 
429 aa  558  1e-158  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000860602  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0143  phosphopyruvate hydratase  63.4 
 
 
433 aa  558  1e-158  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000522536  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5703  phosphopyruvate hydratase  64.49 
 
 
431 aa  559  1e-158  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000699269  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1403  phosphopyruvate hydratase  65.97 
 
 
434 aa  556  1e-157  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000162747  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2019  phosphopyruvate hydratase  65.5 
 
 
431 aa  555  1e-157  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00033595  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0266  enolase  64.47 
 
 
428 aa  555  1e-157  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0768  enolase  62.62 
 
 
431 aa  555  1e-157  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0396287  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1562  enolase  63.15 
 
 
429 aa  556  1e-157  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0446  phosphopyruvate hydratase  63.97 
 
 
434 aa  554  1e-156  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15790  enolase  65.09 
 
 
428 aa  552  1e-156  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000402486  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1042  phosphopyruvate hydratase  66.19 
 
 
428 aa  549  1e-155  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2603  enolase  64.85 
 
 
425 aa  549  1e-155  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0996  phosphopyruvate hydratase  64.57 
 
 
429 aa  548  1e-155  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0889818  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0146  phosphopyruvate hydratase  63.47 
 
 
428 aa  549  1e-155  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.152915  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3264  phosphopyruvate hydratase  64.57 
 
 
429 aa  548  1e-155  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0306  phosphopyruvate hydratase  62.24 
 
 
427 aa  548  1e-155  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2254  phosphopyruvate hydratase  62.85 
 
 
431 aa  547  1e-154  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0274446  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0912  phosphopyruvate hydratase  61.95 
 
 
428 aa  545  1e-154  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4715  phosphopyruvate hydratase  61.65 
 
 
425 aa  547  1e-154  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000215444  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2650  phosphopyruvate hydratase  62.03 
 
 
427 aa  545  1e-154  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1055  phosphopyruvate hydratase  63.15 
 
 
429 aa  547  1e-154  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1070  phosphopyruvate hydratase  63.27 
 
 
433 aa  546  1e-154  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0967  enolase  63.4 
 
 
432 aa  546  1e-154  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1174  phosphopyruvate hydratase  63.15 
 
 
427 aa  545  1e-154  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538518 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2286  phosphopyruvate hydratase  64.02 
 
 
428 aa  542  1e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0997  phosphopyruvate hydratase  61.72 
 
 
428 aa  542  1e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1129  phosphopyruvate hydratase  63.15 
 
 
427 aa  544  1e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.488598 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0972  phosphopyruvate hydratase  63.15 
 
 
427 aa  542  1e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0771581  normal  0.0192441 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0801  phosphopyruvate hydratase  62.59 
 
 
434 aa  543  1e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0383653  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2364  phosphopyruvate hydratase  61.56 
 
 
427 aa  544  1e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.593258 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1091  phosphopyruvate hydratase  62.44 
 
 
429 aa  543  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953298  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0817  phosphopyruvate hydratase  62.59 
 
 
434 aa  543  1e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2372  phosphopyruvate hydratase  64.1 
 
 
429 aa  544  1e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0900103  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0341  phosphopyruvate hydratase  61.57 
 
 
433 aa  543  1e-153  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00111686  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1068  phosphopyruvate hydratase  63.15 
 
 
427 aa  542  1e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.021025  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0684  phosphopyruvate hydratase  63.11 
 
 
434 aa  544  1e-153  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00725906  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0949  phosphopyruvate hydratase  61.07 
 
 
433 aa  539  9.999999999999999e-153  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4067  enolase  62.41 
 
 
435 aa  539  9.999999999999999e-153  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.122819  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1909  phosphopyruvate hydratase  61.74 
 
 
427 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.48075  normal  0.540424 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2847  enolase  61.29 
 
 
433 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.392404  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1322  phosphopyruvate hydratase  61.83 
 
 
428 aa  540  9.999999999999999e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3446  enolase  62.15 
 
 
427 aa  539  9.999999999999999e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0276  phosphopyruvate hydratase  60.95 
 
 
425 aa  539  9.999999999999999e-153  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000321511  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1402  enolase  61.21 
 
 
431 aa  541  9.999999999999999e-153  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0078  phosphopyruvate hydratase  64.62 
 
 
426 aa  538  9.999999999999999e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  unclonable  0.0000170876 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0744  enolase  65.72 
 
 
426 aa  537  1e-151  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0621  phosphopyruvate hydratase  63.98 
 
 
427 aa  536  1e-151  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.584957 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1230  phosphopyruvate hydratase  62.15 
 
 
428 aa  537  1e-151  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000046481  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2161  phosphopyruvate hydratase  64.96 
 
 
430 aa  536  1e-151  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.844141  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02841  phosphopyruvate hydratase  64.49 
 
 
433 aa  537  1e-151  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1642  phosphopyruvate hydratase  61.68 
 
 
429 aa  536  1e-151  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0004  phosphopyruvate hydratase  62.5 
 
 
422 aa  535  1e-151  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00896876  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0931  phosphopyruvate hydratase  61.06 
 
 
425 aa  536  1e-151  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0406521  normal  0.0209015 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2650  phosphopyruvate hydratase  61.59 
 
 
428 aa  535  1e-151  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0762745  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0003  enolase  62.86 
 
 
424 aa  535  1e-151  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0397743  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2793  phosphopyruvate hydratase  62.95 
 
 
428 aa  536  1e-151  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4289  phosphopyruvate hydratase  64.18 
 
 
427 aa  533  1e-150  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.627493 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1688  enolase  62.88 
 
 
427 aa  533  1e-150  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1575  phosphopyruvate hydratase  64.25 
 
 
433 aa  533  1e-150  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.837756  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27721  phosphopyruvate hydratase  63.75 
 
 
431 aa  531  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2249  enolase  62.8 
 
 
425 aa  534  1e-150  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.804275  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2476  phosphopyruvate hydratase  64.89 
 
 
430 aa  534  1e-150  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.846458  normal  0.0424446 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5108  phosphopyruvate hydratase  62.18 
 
 
428 aa  533  1e-150  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal  0.613587 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1228  phosphopyruvate hydratase  61.32 
 
 
427 aa  532  1e-150  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1184  Phosphopyruvate hydratase  61.76 
 
 
426 aa  531  1e-150  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2216  phosphopyruvate hydratase  62.59 
 
 
432 aa  533  1e-150  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2305  phosphopyruvate hydratase  61.45 
 
 
429 aa  533  1e-150  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02281  phosphopyruvate hydratase  63.68 
 
 
430 aa  533  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.879614  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02271  phosphopyruvate hydratase  63.92 
 
 
432 aa  531  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.260696  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1654  phosphopyruvate hydratase  62.94 
 
 
429 aa  533  1e-150  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000730285  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4373  enolase  62 
 
 
423 aa  533  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2217  phosphopyruvate hydratase  61.68 
 
 
429 aa  533  1e-150  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1163  phosphopyruvate hydratase  61.56 
 
 
427 aa  528  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000432295 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0947  phosphopyruvate hydratase  61.59 
 
 
428 aa  531  1e-149  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2483  phosphopyruvate hydratase  62.82 
 
 
430 aa  528  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.700297  normal  0.330243 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3184  phosphopyruvate hydratase  62.5 
 
 
427 aa  530  1e-149  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147815  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>