233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3022 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008044  TM1040_3022  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  100 
 
 
244 aa  503  9.999999999999999e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.174708  normal  0.43626 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0021  metallophosphoesterase  49.58 
 
 
243 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1353  hypothetical protein  48.75 
 
 
243 aa  221  9e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0011  metallophosphoesterase  49.17 
 
 
261 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.637468  hitchhiker  0.00983747 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3319  metallophosphoesterase  50 
 
 
244 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0815  metallophosphoesterase  50.21 
 
 
242 aa  211  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.266593  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4812  metallophosphoesterase  38.98 
 
 
257 aa  161  9e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.709692  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3040  metallophosphoesterase  41.35 
 
 
268 aa  160  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1134  metallophosphoesterase  39.66 
 
 
253 aa  149  4e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.924043 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0370  metallophosphoesterase  39.08 
 
 
247 aa  148  6e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1588  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase (symmetrical)  38.91 
 
 
235 aa  148  8e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.094703  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0597  Ser/Thr protein phosphatase family protein  38.91 
 
 
235 aa  148  8e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000001033  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0661  metallophosphoesterase  37.02 
 
 
249 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0635365  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3532  metallophosphoesterase  40.09 
 
 
255 aa  144  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0300439 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1902  metallophosphoesterase  37.5 
 
 
268 aa  142  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0529367  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3775  metallophosphoesterase  36.55 
 
 
258 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4822  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  38.79 
 
 
257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1036  putative serine/threonine protein phosphatase  39.06 
 
 
236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.4139  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3967  metallophosphoesterase  38.79 
 
 
280 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.315376 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1488  metallophosphoesterase  40.09 
 
 
266 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111744  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3780  metallophosphoesterase  37.29 
 
 
251 aa  137  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.721753 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3546  serine/threonine protein phosphatase I  40.69 
 
 
259 aa  137  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3111  metallophosphoesterase  40.79 
 
 
260 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2674  metallophosphoesterase  38.05 
 
 
213 aa  132  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.607795  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2988  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  33.05 
 
 
264 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.479268  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3109  metallophosphoesterase  36.53 
 
 
245 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.304635 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3367  metallophosphoesterase  36.53 
 
 
245 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0260954 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4702  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  36.73 
 
 
219 aa  129  6e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.795213 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5880  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  37.07 
 
 
267 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219709  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0412  protein phosphatase 1  36.73 
 
 
215 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000414677  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3236  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  33.62 
 
 
260 aa  126  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3024  metallophosphoesterase  36.4 
 
 
356 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2347  metallophosphoesterase  39.46 
 
 
234 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.419284 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2626  metallophosphoesterase  39.01 
 
 
224 aa  125  6e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.726827  normal  0.0771552 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2303  metallophosphoesterase  39.46 
 
 
224 aa  125  6e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.254735  normal  0.040346 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2344  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  36.73 
 
 
213 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.448077  normal  0.141683 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5084  metallophosphoesterase  38.2 
 
 
221 aa  122  8e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349721  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3006  metallophosphoesterase  35.53 
 
 
244 aa  116  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0345  metallophosphoesterase  33.49 
 
 
208 aa  115  6e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0100121  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1247  metallophosphoesterase  37.5 
 
 
208 aa  113  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.312472  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3500  metallophosphoesterase  34.67 
 
 
224 aa  112  5e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00659372 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5380  metallophosphoesterase  36.21 
 
 
221 aa  112  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3390  metallophosphoesterase  35.68 
 
 
253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1582  metallophosphoesterase  33.63 
 
 
265 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000731771  normal  0.190685 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3688  metallophosphoesterase  36.77 
 
 
269 aa  107  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1589  metallophosphoesterase  35.02 
 
 
255 aa  105  8e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24873  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1216  metallophosphoesterase  32.16 
 
 
291 aa  102  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.498854 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5378  putative serine/threonine protein phosphatase  36.56 
 
 
249 aa  101  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.205618 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3383  hypothetical protein  32.43 
 
 
228 aa  99  6e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0539  serine/threonine phosphatase  33.33 
 
 
234 aa  97.8  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0570  serine/threonine phosphatase  33.33 
 
 
234 aa  97.8  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3606  metallophosphoesterase  30.25 
 
 
246 aa  97.8  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0626  putative serine/threonine phosphatase  33.33 
 
 
234 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0481  serine/threonine protein phosphatase  33.05 
 
 
234 aa  97.4  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0678743  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2197  metallophosphoesterase  31.06 
 
 
233 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1028  metallophosphoesterase  29.17 
 
 
209 aa  97.1  2e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1911  metallophosphoesterase  30.47 
 
 
223 aa  96.7  3e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000147352  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2149  metallophosphoesterase  31.06 
 
 
233 aa  96.3  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0701  putative serine/threonine phosphatase  33.19 
 
 
234 aa  95.5  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0483  serine/threonine protein phosphatase  31.25 
 
 
238 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4537  metallophosphoesterase  35.04 
 
 
264 aa  94.7  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000938164  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0633  serine/threonine phosphatase, putative  31.71 
 
 
234 aa  94  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0709  metallophosphoesterase  32.13 
 
 
221 aa  94  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.400864 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0607  putative serine/threonine phosphatase  32.19 
 
 
234 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4732  putative serine/threonine phosphatase  32.62 
 
 
234 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0484  metallophosphoesterase  32.33 
 
 
234 aa  92  7e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3990  metallophosphoesterase  31.74 
 
 
250 aa  92  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.399345 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0495  metallophosphoesterase  31.86 
 
 
231 aa  92  8e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1187  metallophosphoesterase  32.57 
 
 
243 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634228  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3306  metallophosphoesterase  32.64 
 
 
251 aa  91.3  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.645763  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0187  metallophosphoesterase  29.91 
 
 
209 aa  90.9  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0160617  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2646  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  31.39 
 
 
248 aa  89.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.476513 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3470  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  31.39 
 
 
248 aa  89.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1580  serine/threonine specific protein phosphatase (protein phosphatase 1)  32.31 
 
 
227 aa  85.9  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0522604  normal  0.0445956 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1989  metallophosphoesterase  31.56 
 
 
236 aa  85.9  6e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0029  metallophosphoesterase  29.63 
 
 
218 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1210  metallophosphoesterase  29.53 
 
 
254 aa  82.8  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1931  serine/threonine protein phosphatase  34.21 
 
 
256 aa  80.9  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.824915  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1555  serine/threonine protein phosphatase, putative  27.35 
 
 
241 aa  79.7  0.00000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0307054  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1659  metallophosphoesterase  31.02 
 
 
238 aa  79.7  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2248  metallophosphoesterase  30.65 
 
 
251 aa  79  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1296  metallophosphoesterase  29.39 
 
 
230 aa  78.2  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3221  metallophosphoesterase  31.28 
 
 
233 aa  77.4  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0458  metallophosphoesterase  28.44 
 
 
230 aa  75.1  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008504  LACR_B1  diadenosine tetraphosphatase-like protein  26.47 
 
 
229 aa  72.8  0.000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0443  metallophosphoesterase  28.37 
 
 
259 aa  68.2  0.0000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2328  metallophosphoesterase  33.17 
 
 
245 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2593  metallophosphoesterase  27.16 
 
 
230 aa  67  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000136211  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2630  serine/threonine protein phosphatase, putative  26.61 
 
 
227 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0868  metallophosphoesterase  31.93 
 
 
361 aa  64.3  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03770  Calcineurin-like phosphoesterase  30.7 
 
 
325 aa  63.5  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.978477  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1680  serine/threonine protein phosphatase  28.9 
 
 
235 aa  63.2  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47351  predicted protein  25.58 
 
 
359 aa  62  0.000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1549  metallophosphoesterase  40 
 
 
287 aa  61.2  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.253978  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0475  metallophosphoesterase  29.17 
 
 
274 aa  60.1  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0217  metallophosphoesterase  26.75 
 
 
273 aa  60.5  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4095  metallophosphoesterase  27.71 
 
 
334 aa  59.7  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.590494  normal  0.27033 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3720  metallophosphoesterase  24.05 
 
 
229 aa  59.7  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00810  Calcineurin-like phosphoesterase  48.05 
 
 
307 aa  59.3  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1121  metallophosphoesterase  23.48 
 
 
243 aa  58.9  0.00000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00136945  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>