47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1862 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1862  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  426  1e-118  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3387  hypothetical protein  49.75 
 
 		 204 aa  175  4e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2439  hypothetical protein  57.84 
 
 		 200 aa  164  9e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.872565  hitchhiker  0.00642281 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0783  hypothetical protein  57.35 
 
 		 200 aa  162  3e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0735  hypothetical protein  53.33 
 
 		 204 aa  161  6e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0632908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3617  hypothetical protein  42.03 
 
 		 215 aa  154  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.417732  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0093  hypothetical protein  40.89 
 
 		 216 aa  142  5e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2344  hypothetical protein  38.84 
 
 		 225 aa  138  6e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2508  hypothetical protein  39.29 
 
 		 225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0424  hypothetical protein  44.97 
 
 		 219 aa  132  5e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.976938 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3331  hypothetical protein  41.18 
 
 		 227 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55019 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2533  hypothetical protein  37.86 
 
 		 239 aa  124  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.312874 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5549  hypothetical protein  39.41 
 
 		 212 aa  122  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245566  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5317  hypothetical protein  39.81 
 
 		 212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.650496  normal  0.0133436 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1214  hypothetical protein  38.33 
 
 		 233 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.835454 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5126  hypothetical protein  39.62 
 
 		 212 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.511198  normal  0.929155 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2267  hypothetical protein  38.33 
 
 		 230 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0953  hypothetical protein  37.39 
 
 		 289 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.195854  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0930  hypothetical protein  38.22 
 
 		 230 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.572615  normal  0.581042 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5688  hypothetical protein  38.77 
 
 		 230 aa  112  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0888  hypothetical protein  33.65 
 
 		 222 aa  112  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.541454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2349  hypothetical protein  38.33 
 
 		 231 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391911  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1737  hypothetical protein  38.33 
 
 		 256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2385  hypothetical protein  37 
 
 		 230 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1780  hypothetical protein  39.61 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0254342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2370  hypothetical protein  38.33 
 
 		 231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3311  hypothetical protein  34.08 
 
 		 246 aa  108  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3781  hypothetical protein  34.08 
 
 		 220 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.656806  normal  0.14797 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1156  hypothetical protein  37.67 
 
 		 227 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1316  hypothetical protein  37.67 
 
 		 264 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104062  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1165  hypothetical protein  37.67 
 
 		 227 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1950  hypothetical protein  37.67 
 
 		 264 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.530616  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1003  hypothetical protein  37.67 
 
 		 227 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.501161  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0861  hypothetical protein  37.67 
 
 		 227 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0287  hypothetical protein  37.67 
 
 		 227 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.615178  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0740  hypothetical protein  34.86 
 
 		 230 aa  97.1  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4243  hypothetical protein  30.18 
 
 		 238 aa  86.7  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0364  hypothetical protein  31.8 
 
 		 250 aa  85.1  8e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.581754  normal  0.602447 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4440  hypothetical protein  34.59 
 
 		 245 aa  82.4  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.986206 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2031  hypothetical protein  34.78 
 
 		 204 aa  77.8  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0800927 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2751  hypothetical protein  39.19 
 
 		 167 aa  63.9  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785617 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05620  hypothetical protein  41.18 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1018  hypothetical protein  32.21 
 
 		 263 aa  45.4  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0218  hypothetical protein  30.84 
 
 		 240 aa  44.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0523  hypothetical protein  35.03 
 
 		 244 aa  43.9  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2743  hypothetical protein  35.58 
 
 		 229 aa  43.1  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.704856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01720  hypothetical protein  42.11 
 
 		 217 aa  42.7  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.420757 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>