33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1679 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1679  MT-A70  100 
 
 		 190 aa  396  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0660  MT-A70 family protein  59.44 
 
 		 202 aa  216  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4092  MT-A70 family protein  53.26 
 
 		 193 aa  202  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.61785 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3839  MT-A70 family protein  52.22 
 
 		 187 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2489  MT-A70 family protein  50.56 
 
 		 188 aa  179  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0901291  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5079  MT-A70 family protein  50.56 
 
 		 187 aa  176  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2112  MT-A70 family protein  44.85 
 
 		 201 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.193598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1288  MT-A70 family protein  44.85 
 
 		 201 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3618  MT-A70 family protein  45.03 
 
 		 194 aa  152  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.92147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0426  MT-A70 family protein  36.87 
 
 		 229 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2608  MT-A70  39.66 
 
 		 226 aa  115  3e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0246  adenine-specific DNA methyltransferase  39.33 
 
 		 216 aa  115  5e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.298743  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3884  MT-A70 family protein  38.29 
 
 		 208 aa  114  6.9999999999999995e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0375479 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4628  MT-A70 family protein  40.7 
 
 		 186 aa  112  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000658429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2137  MT-A70 family protein  38.51 
 
 		 224 aa  111  7.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1143  adenine methylase  38.2 
 
 		 200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0265355  hitchhiker  1.9630399999999998e-21 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2063  MT-A70 family protein  36.47 
 
 		 211 aa  108  3e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.524395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2710  MT-A70 family protein  36.27 
 
 		 208 aa  104  6e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3576  adenine methylase  38.64 
 
 		 208 aa  103  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000695706 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0443  MT-A70 family protein  38.6 
 
 		 426 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.516252  hitchhiker  0.000000000100538 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0620  MT-A70  33.84 
 
 		 206 aa  98.6  5e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2604  MT-A70 family protein  32.4 
 
 		 401 aa  89.7  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1667  MT-A70 family protein  36.05 
 
 		 507 aa  87.8  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.584736  normal  0.226598 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2318  MT-A70 family protein  37.93 
 
 		 435 aa  87.8  8e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1165  MT-A70 family protein  32.12 
 
 		 305 aa  87  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1616  MT-A70 family protein  32.31 
 
 		 208 aa  87  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3316  hypothetical protein  31.76 
 
 		 168 aa  61.6  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03860  mRNA methyltransferase, putative  26.63 
 
 		 406 aa  58.2  0.00000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_43977  predicted protein  25.71 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0538105  normal  0.400079 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57562  activator of IME1 Predicted N6-adenine RNA methylase IME4  25.84 
 
 		 531 aa  52.8  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2064  Transcriptional activator adenine-specific DNA methyltransferase-like protein  38.37 
 
 		 122 aa  49.7  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000107502  normal  0.010036 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7351  MT-A70 family protein  34.19 
 
 		 130 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1554  hypothetical protein  25.71 
 
 		 750 aa  43.1  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>