26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1065 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1065  Phage major tail protein, TP901-1  100 
 
 		 137 aa  273  5e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.134368 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2170  hypothetical protein  77.94 
 
 		 137 aa  228  2e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2894  TP901-1 family phage major tail protein  77.94 
 
 		 137 aa  223  8e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.232162 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2473  hypothetical protein  77.21 
 
 		 137 aa  220  4.9999999999999996e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.181779  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1639  Phage major tail protein, TP901-1  75.56 
 
 		 137 aa  218  1.9999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.799138 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1137  TP901-1 family phage major tail protein  76.47 
 
 		 137 aa  218  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.594391 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1082  TP901-1 family phage major tail protein  75 
 
 		 137 aa  214  5e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.085931 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0911  TP901-1 family phage major tail protein  61.31 
 
 		 137 aa  180  6e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.594868 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1699  phage major tail protein, TP901-1 family  60.58 
 
 		 136 aa  173  9e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0600382  normal  0.311621 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1421  phage major tail protein, TP901-1 family  60.58 
 
 		 136 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.997697  normal  0.225019 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1419  Phage major tail protein, TP901-1  61.76 
 
 		 135 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1174  Phage major tail protein, TP901-1  61.03 
 
 		 135 aa  169  1e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1816  Phage major tail protein, TP901-1  58.39 
 
 		 135 aa  163  9e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0067398  normal  0.215518 
 
 
-
 
NC_004310  BR0594  hypothetical protein  55.97 
 
 		 137 aa  162  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3161  TP901-1 family phage major tail protein  59.56 
 
 		 135 aa  160  4.0000000000000004e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.272123  normal  0.0134128 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1425  TP901-1 family phage major tail protein  60.58 
 
 		 136 aa  158  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0384204  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2109  phage major tail protein, TP901-1 family  58.09 
 
 		 135 aa  158  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000411275  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3465  Phage major tail protein, TP901-1  54.41 
 
 		 135 aa  157  6e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0406458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1983  gene transfer agent (GTA) orf  55.22 
 
 		 135 aa  156  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.516459 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4972  TP901-1 family phage major tail protein  58.82 
 
 		 136 aa  153  8e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.392569  hitchhiker  0.0000970804 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1345  hypothetical protein  55.97 
 
 		 136 aa  153  8e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00292894  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0926  TP901-1 family phage major tail protein  56.2 
 
 		 138 aa  151  2.9999999999999998e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.419609 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3910  TP901-1 family phage major tail protein  61.31 
 
 		 138 aa  144  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.69911  normal  0.119703 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1995  Phage major tail protein, TP901-1  43.61 
 
 		 135 aa  102  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0543379  hitchhiker  0.00425281 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3125  Phage major tail protein, TP901-1  39.1 
 
 		 135 aa  93.2  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1649  phage major tail protein, TP901-1  29.84 
 
 		 136 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.70666  normal  0.500579 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>