40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2270 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_2270  conserved hypothetical protein, proline rich; putative membrane anchored protein  100 
 
 		 189 aa  371  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00227194 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0198  hypothetical protein  31.76 
 
 		 183 aa  61.2  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.434531  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3404  proline rich signal peptide protein  31.82 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0273  hypothetical protein  34.66 
 
 		 202 aa  53.1  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440817  decreased coverage  0.00233416 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0314  hypothetical protein  29.07 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4411  hypothetical protein  28.49 
 
 		 199 aa  52.8  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.92645 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0183  putative proline rich signal peptide protein  31.28 
 
 		 179 aa  52.4  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000332053 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6473  hypothetical protein  28.57 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2846  hypothetical protein  28.24 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0592  putative proline rich signal peptide protein  29.55 
 
 		 215 aa  49.7  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3138  hypothetical protein  28.57 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.757645 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3122  hypothetical protein  28.57 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.321378  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2508  hypothetical protein  28.57 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.087584  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3561  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  29.07 
 
 		 276 aa  49.7  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0029  proline rich signal peptide protein  27.84 
 
 		 203 aa  48.5  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.703627 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3673  putative proline rich signal peptide protein  28.72 
 
 		 256 aa  48.5  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2625  hypothetical protein  26.8 
 
 		 196 aa  48.1  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.362297  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3350  proline rich signal peptide protein  28.72 
 
 		 256 aa  48.1  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3119  hypothetical protein  26.92 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.924603 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0133  hypothetical protein  26.92 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0351  hypothetical protein  27.22 
 
 		 196 aa  45.1  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0147  hypothetical protein  27.22 
 
 		 196 aa  45.1  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.583084  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2358  hypothetical protein  27.22 
 
 		 196 aa  45.1  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0166  hypothetical protein  27.22 
 
 		 196 aa  45.1  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485321  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0156  hypothetical protein  27.22 
 
 		 196 aa  45.1  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2280  hypothetical protein  27.22 
 
 		 196 aa  45.1  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.454235  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2800  hypothetical protein  27.22 
 
 		 196 aa  45.1  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3631  putative proline rich signal peptide protein  29.38 
 
 		 219 aa  45.1  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0868148 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2076  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  24.59 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1774  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  25.75 
 
 		 180 aa  44.3  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.585717 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3060  hypothetical protein  28.17 
 
 		 197 aa  42.7  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3177  hypothetical protein  28.17 
 
 		 197 aa  42.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0514  putative proline rich signal peptide protein  26.09 
 
 		 187 aa  42.4  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268844 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2082  hypothetical protein  26.75 
 
 		 210 aa  42.4  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4527  putative proline rich signal peptide protein  37.88 
 
 		 217 aa  42.4  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330497  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0076  proline rich signal peptide protein  28.26 
 
 		 256 aa  41.6  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0426414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2267  putative proline rich signal peptide protein  41.54 
 
 		 203 aa  42  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3017  hypothetical protein  24.44 
 
 		 197 aa  42  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3242  hypothetical protein  29.05 
 
 		 197 aa  41.2  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.123821  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4085  hypothetical protein  29.1 
 
 		 199 aa  41.2  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>