More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1549 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_1549  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
308 aa  620  1e-177  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26  normal  0.473314 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1548  glycosyl transferase family 2  58.91 
 
 
316 aa  297  1e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.566859  normal  0.346969 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08980  glycosyl transferase  33.19 
 
 
329 aa  83.2  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.150997 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5925  succinoglycan biosynthesis glycosyltransferase  28.45 
 
 
331 aa  78.6  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2437  glycosyl transferase family 2  36.11 
 
 
357 aa  75.9  0.0000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0636  family 2 glycosyl transferase  32.89 
 
 
785 aa  75.9  0.0000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.678698 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1457  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 
341 aa  75.1  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00556553  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3987  putative glycosyl transferase  25.9 
 
 
344 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0110  putative glycosyl transferase  27.16 
 
 
327 aa  74.3  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.755571  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4032  putative glycosyl transferase  25.9 
 
 
344 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0315657  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26480  glycosyl transferase  27.78 
 
 
672 aa  73.9  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1081  glycosyl transferase family protein  32.39 
 
 
324 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0364187  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3906  putative glycosyl transferase  26.29 
 
 
344 aa  73.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.66206  normal  0.305957 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4959  glycosyl transferase family protein  30.36 
 
 
340 aa  73.2  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0171285 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0321  glycosyl transferase family protein  27.48 
 
 
342 aa  73.2  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4093  putative glycosyl transferase  25.9 
 
 
344 aa  71.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0647  glycosyl transferase family protein  29.22 
 
 
354 aa  72  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3925  putative glycosyl transferase  25.9 
 
 
344 aa  71.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3520  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  25.91 
 
 
323 aa  71.2  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1570  glycosyl transferase family protein  34.59 
 
 
252 aa  70.5  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3694  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.2 
 
 
266 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02310  glycosyl transferase  30.45 
 
 
354 aa  70.9  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4840  glycosyl transferase family protein  27.5 
 
 
337 aa  69.7  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00151484  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1651  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.6 
 
 
266 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.590239  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0992  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  31.14 
 
 
637 aa  68.9  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0522  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  33.19 
 
 
729 aa  68.6  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.010649 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1199  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  29.96 
 
 
941 aa  68.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.457578 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2262  glycosyl transferase, group 2  28.83 
 
 
386 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0957  ss-1,4-galactosyltransferase  26.43 
 
 
325 aa  67.8  0.0000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.655191  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0186  glycosyl transferase family protein  28.75 
 
 
348 aa  67.4  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1270  general glycosylation pathway protein  24.91 
 
 
309 aa  67  0.0000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.553122  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1203  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  32.11 
 
 
616 aa  67  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.811759 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  37.5 
 
 
300 aa  67  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1145  general glycosylation pathway protein  24.91 
 
 
309 aa  67  0.0000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3457  glycosyl transferase family protein  27.87 
 
 
313 aa  66.6  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2799  glycosyl transferase family 2  30.74 
 
 
335 aa  66.6  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4118  putative glycosyl transferase  25.98 
 
 
344 aa  66.2  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.910618  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5782  glycosyl transferase family 2  31.78 
 
 
317 aa  66.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0745  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosphotransferase  30.71 
 
 
1169 aa  66.2  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3065  glycosyl transferase family protein  23.51 
 
 
289 aa  66.2  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.807338  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4042  putative glycosyl transferase  25.98 
 
 
344 aa  66.2  0.0000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.24261  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1268  glycosyl transferase family 2  23.67 
 
 
369 aa  66.2  0.0000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.6355  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  33.1 
 
 
362 aa  65.9  0.0000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0676  teichuronic acid biosynthesis  32.79 
 
 
285 aa  65.9  0.0000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00829519  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1690  glycosyl transferase family protein  30.08 
 
 
518 aa  65.9  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0342764  hitchhiker  0.00101578 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03473  predicted glycosyl transferase  25.59 
 
 
344 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.320225  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0090  glycosyl transferase family 2  25.59 
 
 
344 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03424  hypothetical protein  25.59 
 
 
344 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.245637  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2919  glycosyl transferase family protein  43.88 
 
 
271 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0269  glycosyl transferase family protein  39.09 
 
 
346 aa  65.9  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0093  putative glycosyl transferase  25.59 
 
 
344 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.516407  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0593  general glycosylation pathway protein  31.01 
 
 
309 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.422601  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0642  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  29.72 
 
 
1157 aa  64.3  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0640  glycosyl transferase family 2  34.62 
 
 
321 aa  64.7  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0769  glycosyl transferase family 2  31.84 
 
 
352 aa  64.7  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2886  glycosyl transferase family protein  39.37 
 
 
329 aa  64.7  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.824951  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1205  Putative glycosyl/glycerophosphate transferase involved in teichoic acid biosynthesis TagF/TagB/EpsJ/RodC- like protein  29.77 
 
 
1173 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4199  glycosyl transferase family 2  42.35 
 
 
297 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0715  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.88 
 
 
334 aa  63.9  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.887983  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3951  putative glycosyl transferase  24.8 
 
 
344 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.174357  normal  0.660654 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0434  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  32.69 
 
 
731 aa  63.9  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1212  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  28.81 
 
 
946 aa  63.2  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.333736  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5165  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  29.47 
 
 
1168 aa  63.2  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.390829 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0706  glycosyl transferase group 2 family protein  25.88 
 
 
334 aa  63.2  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.912597  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  30.87 
 
 
302 aa  63.2  0.000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4914  family 2 glycosyl transferase  25.21 
 
 
306 aa  63.2  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12320  glycosyl transferase  27.04 
 
 
343 aa  63.2  0.000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09810  glycosyl transferase  29.86 
 
 
405 aa  62.8  0.000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.440212 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3827  putative glycosyl transferase  25.59 
 
 
344 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0526095  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1441  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  23.53 
 
 
322 aa  62.8  0.000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.692478  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0633  glycosyl transferase family 2  29.34 
 
 
345 aa  62.8  0.000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.810954  normal  0.460894 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1847  glycosyl transferase family 2  27.56 
 
 
1116 aa  62.8  0.000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.944284  normal  0.0115409 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2980  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  31.39 
 
 
317 aa  62.4  0.000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.815971 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0299  teichoic acid biosynthesis protein X, putative  25.41 
 
 
354 aa  62  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.192136  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1683  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.64 
 
 
266 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1497  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.64 
 
 
266 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.366034  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1469  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.64 
 
 
266 aa  62  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000134346  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0830  glycosyl transferase family 2  40.38 
 
 
321 aa  62  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.0971382 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1615  group 2 family glycosyl transferase  35.64 
 
 
266 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.653601  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  42.71 
 
 
597 aa  61.6  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2353  glycosyl transferase family protein  32.7 
 
 
252 aa  62.4  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.712246  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2040  glycosyl transferase family 2  31.75 
 
 
386 aa  62.4  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.12763  normal  0.970209 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1465  cell wall membrane glycosyltransferase  27.9 
 
 
391 aa  62.4  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30120  Glycosyl transferase, family 2 protein  28.82 
 
 
328 aa  62.4  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1144  glycosyl transferase family 2  35.29 
 
 
209 aa  60.8  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  31.96 
 
 
326 aa  60.8  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0701  glycosyl transferase family 2  25.64 
 
 
355 aa  61.2  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000226644  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3393  glycosyl transferase family protein  25.38 
 
 
324 aa  61.2  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2038  glycosyl transferase family 2  29.82 
 
 
340 aa  61.6  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.723912 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0177  putative glycosyl transferase  41.51 
 
 
268 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2039  glycosyl transferase family 2  29.58 
 
 
366 aa  61.2  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.294118  normal  0.96458 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2371  glycosyltransferase  28.79 
 
 
326 aa  61.2  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  33.67 
 
 
326 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0297  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  28.04 
 
 
970 aa  61.6  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1381  glycosyl transferase family protein  34.38 
 
 
326 aa  61.2  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  42.86 
 
 
344 aa  61.2  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  40 
 
 
672 aa  60.8  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22790  glycosyl transferase family 2  36.67 
 
 
250 aa  60.8  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1415  glycosyl transferase family protein  29.66 
 
 
312 aa  60.8  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435994 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1815  glycosyl transferase family 2  27.23 
 
 
958 aa  60.8  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.613695  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>