23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0314 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0314  O-antigen polymerase  100 
 
 		 397 aa  768    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2800  O-antigen polymerase  28.87 
 
 		 422 aa  88.2  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3150  O-antigen polymerase  32.28 
 
 		 388 aa  79  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.9572 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66100  hypothetical protein  23.89 
 
 		 399 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4391  O-antigen polymerase  31 
 
 		 494 aa  53.5  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.6355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3078  O-antigen polymerase  32.43 
 
 		 500 aa  50.4  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5004  O-antigen polymerase family protein  29.44 
 
 		 436 aa  50.4  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0024  O-antigen polymerase  28.18 
 
 		 456 aa  49.7  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2009  O-antigen polymerase  22.88 
 
 		 459 aa  47.4  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0733  O-antigen polymerase  26.86 
 
 		 485 aa  47  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.480414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0480  O-antigen polymerase  27.6 
 
 		 620 aa  47  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.450132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4829  O-antigen polymerase  25.45 
 
 		 389 aa  46.6  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.126045  hitchhiker  0.0000506097 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2645  O-antigen polymerase  31.19 
 
 		 592 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1691  O-antigen polymerase  26.81 
 
 		 512 aa  45.8  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.121195  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5250  O-antigen polymerase  27.04 
 
 		 336 aa  45.8  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2034  O-antigen polymerase  31.19 
 
 		 592 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2674  O-antigen polymerase  31.19 
 
 		 592 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3774  O-antigen polymerase  38.2 
 
 		 439 aa  45.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5734  hypothetical protein  29.1 
 
 		 397 aa  44.3  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4465  O-antigen polymerase  24.78 
 
 		 479 aa  44.3  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000989096  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2638  O-antigen polymerase  24.08 
 
 		 428 aa  43.5  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1436  O-antigen polymerase  25.91 
 
 		 404 aa  43.5  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1639  hypothetical protein  26.98 
 
 		 447 aa  43.1  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>