12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1436 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1436  O-antigen polymerase  100 
 
 		 404 aa  807    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0658  O-antigen polymerase family protein  27.55 
 
 		 398 aa  105  2e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.238334  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0143  O-antigen polymerase  22.11 
 
 		 405 aa  49.3  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.697441  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3700  hypothetical protein  24.13 
 
 		 480 aa  47.4  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160795  normal  0.238064 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1764  O-antigen polymerase  28 
 
 		 560 aa  47  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2384  O-antigen polymerase  24.3 
 
 		 436 aa  47  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.486663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1088  O-antigen polymerase  24.34 
 
 		 737 aa  45.1  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2800  O-antigen polymerase  33.03 
 
 		 422 aa  44.7  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0843  O-antigen polymerase  26.1 
 
 		 440 aa  44.3  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.475178  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1822  O-antigen polymerase  27.04 
 
 		 461 aa  43.9  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.831736  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1954  hypothetical protein  26.03 
 
 		 443 aa  43.1  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3696  O-antigen polymerase  26.5 
 
 		 461 aa  43.1  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>