9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1764 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1764  O-antigen polymerase  100 
 
 		 560 aa  1107    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0063  O-antigen polymerase  29.76 
 
 		 531 aa  57  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0639643 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0489  O-antigen polymerase  31.05 
 
 		 605 aa  55.1  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.091013 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0891  O-antigen polymerase  34.57 
 
 		 393 aa  50.4  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.335212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1788  O-antigen polymerase  23.32 
 
 		 446 aa  50.4  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1436  O-antigen polymerase  26.56 
 
 		 404 aa  47  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0480  O-antigen polymerase  27.39 
 
 		 620 aa  45.8  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.450132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3437  O-antigen polymerase  28.79 
 
 		 456 aa  45.8  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000533693  normal  0.14602 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0634  O-antigen polymerase  31 
 
 		 415 aa  45.4  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.60095 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>