54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0141 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0141  Putitive phosphate transport regulator  100 
 
 		 226 aa  455  1e-127  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.572504  normal  0.330321 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2470  hypothetical protein  70.35 
 
 		 226 aa  324  7e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0618  hypothetical protein  48.64 
 
 		 223 aa  233  1.0000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0351  hypothetical protein  51.34 
 
 		 225 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0634  hypothetical protein  48.64 
 
 		 223 aa  233  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5953  hypothetical protein  51.34 
 
 		 225 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68800  hypothetical protein  50.89 
 
 		 225 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3843  hypothetical protein  48.21 
 
 		 226 aa  229  3e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000724256  hitchhiker  0.0000000283379 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3487  hypothetical protein  48.21 
 
 		 226 aa  227  1e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000126131  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0692  hypothetical protein  49.55 
 
 		 226 aa  227  1e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130211  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0565  hypothetical protein  49.55 
 
 		 226 aa  226  2e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0717  hypothetical protein  47.77 
 
 		 226 aa  225  4e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000253337  unclonable  0.0000000117044 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2188  hypothetical protein  49.77 
 
 		 226 aa  224  1e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.839701  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0618  hypothetical protein  47.77 
 
 		 226 aa  223  2e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.357102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2827  hypothetical protein  49.33 
 
 		 224 aa  222  3e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.245918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2673  hypothetical protein  48.66 
 
 		 226 aa  222  4e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.241271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0138  putative pit accessory protein  49.32 
 
 		 238 aa  221  8e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0853  hypothetical protein  48.21 
 
 		 226 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000459273  normal  0.62908 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0822  hypothetical protein  48.21 
 
 		 226 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000109083  normal  0.209568 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3770  hypothetical protein  48.21 
 
 		 226 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3119  hypothetical protein  48.21 
 
 		 226 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000717729  normal  0.542025 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0917  hypothetical protein  47.77 
 
 		 226 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00343614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3455  hypothetical protein  47.77 
 
 		 226 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000227297  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3096  hypothetical protein  47.32 
 
 		 226 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000106475  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0883  hypothetical protein  47.77 
 
 		 226 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000129781  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0907  protein of unknown function DUF47  47.77 
 
 		 226 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000556938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3320  hypothetical protein  46.19 
 
 		 225 aa  215  5e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.915489  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3638  hypothetical protein  44.84 
 
 		 226 aa  210  1e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.1465  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1052  hypothetical protein  48.43 
 
 		 224 aa  211  1e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00170442  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0711  hypothetical protein  47.35 
 
 		 226 aa  209  3e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2681  hypothetical protein  43.75 
 
 		 226 aa  207  7e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0612362  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00863  hypothetical protein  42.86 
 
 		 228 aa  203  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1190  phosphate transport regulator  45.05 
 
 		 226 aa  203  2e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.967179  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0181  hypothetical protein  43.3 
 
 		 226 aa  201  6e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2019  hypothetical protein  42.86 
 
 		 228 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000582127  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004528  phosphate transport regulator  42.93 
 
 		 195 aa  172  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.327148  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0228  hypothetical protein  40.97 
 
 		 227 aa  172  2.9999999999999996e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.775061  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0063  hypothetical protein  31.94 
 
 		 224 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1146  Putitive phosphate transport regulator  24.09 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.266401  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2044  hypothetical protein  26.36 
 
 		 228 aa  94.4  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000405279  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3224  hypothetical protein  27.52 
 
 		 222 aa  88.6  7e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0788  hypothetical protein  23.18 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0013  hypothetical protein  25.29 
 
 		 213 aa  54.7  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0688  hypothetical protein  22.87 
 
 		 222 aa  54.7  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000115743  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0013  hypothetical protein  25.29 
 
 		 213 aa  54.7  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0493  hypothetical protein  23 
 
 		 224 aa  53.5  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000213235  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0664  hypothetical protein  20.93 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000019589  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1625  hypothetical protein  20.45 
 
 		 217 aa  48.9  0.00006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.109704  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1923  hypothetical protein  22.37 
 
 		 223 aa  48.9  0.00006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00116502  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0285  hypothetical protein  20.09 
 
 		 217 aa  45.4  0.0007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3782  protein of unknown function DUF47  20.11 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.287695  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1332  hypothetical protein  22.54 
 
 		 215 aa  42  0.008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3132  hypothetical protein  21.2 
 
 		 205 aa  41.6  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000131524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3780  phosphate transport regulator-like  21.94 
 
 		 226 aa  41.6  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>