More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0720 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0720  30S ribosomal protein S10  100 
 
 
105 aa  210  4.9999999999999996e-54  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0939005  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0421  30S ribosomal protein S10  75.51 
 
 
102 aa  155  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000238297  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0476  ribosomal protein S10  72.55 
 
 
108 aa  154  6e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1525  ribosomal protein S10  76.77 
 
 
102 aa  153  7e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.651999  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0224  ribosomal protein S10  73 
 
 
102 aa  152  1e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0285  ribosomal protein S10  71 
 
 
102 aa  150  5e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0119984  hitchhiker  0.00531479 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0214  ribosomal protein S10  70 
 
 
102 aa  149  8.999999999999999e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114911  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1554  30S ribosomal protein S10  74.49 
 
 
103 aa  148  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000633059  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01160  ribosomal protein S10  71 
 
 
103 aa  147  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000349687  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1225  30S ribosomal protein S10  71 
 
 
123 aa  147  4e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00268366  unclonable  0.00000899576 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0193  SSU ribosomal protein S10P  71 
 
 
103 aa  146  8e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000113928  normal  0.060255 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2461  30S ribosomal protein S10  70.71 
 
 
102 aa  146  9e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.043315 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2858  30S ribosomal protein S10  74.49 
 
 
102 aa  145  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800784  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2902  30S ribosomal protein S10  73 
 
 
103 aa  145  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000945352  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0625  30S ribosomal protein S10  74.49 
 
 
102 aa  145  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000558853  hitchhiker  0.0000000000000328358 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0147  ribosomal protein S10  71.72 
 
 
103 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000495355  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0230  30S ribosomal protein S10  70.71 
 
 
103 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0157  30S ribosomal protein S10  70.71 
 
 
103 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000255753  decreased coverage  0.0000448668 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1911  30S ribosomal protein S10  72.45 
 
 
101 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.253834 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1946  30S ribosomal protein S10  72.45 
 
 
101 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2170  ribosomal protein S10  70.71 
 
 
103 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00128539  normal  0.372781 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1933  30S ribosomal protein S10  72.45 
 
 
101 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4318  30S ribosomal protein S10  69.7 
 
 
103 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000242072  unclonable  0.0000000000477389 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2735  ribosomal protein S10  71 
 
 
102 aa  145  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.796099  normal  0.119445 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4691  30S ribosomal protein S10  69.7 
 
 
103 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000838307  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0183  30S ribosomal protein S10  69.7 
 
 
103 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140291  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0198  30S ribosomal protein S10  70.71 
 
 
103 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000200655  unclonable  0.0000000000157318 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0193  30S ribosomal protein S10  70.71 
 
 
103 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000424599  decreased coverage  0.00027939 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0198  30S ribosomal protein S10  70.71 
 
 
103 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000267319  hitchhiker  0.0000000013297 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2018  30S ribosomal protein S10  72.45 
 
 
101 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4006  ribosomal protein S10  72.16 
 
 
102 aa  144  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0232097  normal  0.70609 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3760  30S ribosomal protein S10  69.7 
 
 
103 aa  144  3e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000001631  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4057  30S ribosomal protein S10  69.7 
 
 
103 aa  144  3e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000379961  hitchhiker  0.000000000138432 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0169  30S ribosomal protein S10  70.71 
 
 
103 aa  144  3e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000585443  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0195  30S ribosomal protein S10  69.7 
 
 
103 aa  144  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000000645818  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0199  30S ribosomal protein S10  69.7 
 
 
103 aa  144  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000181945  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4171  30S ribosomal protein S10  69.7 
 
 
103 aa  144  3e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000385608  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1484  30S ribosomal protein S10  70.71 
 
 
102 aa  144  4.0000000000000006e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000272811  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3020  30S ribosomal protein S10  69.31 
 
 
104 aa  144  4.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000044729  hitchhiker  0.00550197 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0319  30S ribosomal protein S10  70.71 
 
 
103 aa  144  4.0000000000000006e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0188597  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1345  30S ribosomal protein S10  72 
 
 
102 aa  144  4.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.312234  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1163  ribosomal protein S10  69.39 
 
 
102 aa  144  4.0000000000000006e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000940072  hitchhiker  0.000000509949 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16250  SSU ribosomal protein S10P  66.99 
 
 
107 aa  144  4.0000000000000006e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00216069  hitchhiker  0.00000702102 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1796  SSU ribosomal protein S10P  71 
 
 
104 aa  144  4.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.13057  normal  0.040484 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0866  30S ribosomal protein S10  71.72 
 
 
102 aa  144  5e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000610931  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0468  30S ribosomal protein S10  69.39 
 
 
103 aa  144  5e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000173961  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2334  ribosomal protein S10  67.68 
 
 
103 aa  144  5e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000521962  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2373  30S ribosomal protein S10  68.69 
 
 
103 aa  143  6e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.837203  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00444  30S ribosomal protein S10  70.41 
 
 
103 aa  143  6e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0405184  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0212  30S ribosomal protein S10  69.7 
 
 
103 aa  144  6e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000277123  unclonable  0.00000693674 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2325  30S ribosomal protein S10  70 
 
 
103 aa  143  7.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000023421  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3525  ribosomal protein S10  69.7 
 
 
103 aa  143  7.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00000457129  hitchhiker  0.0000321241 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00729  30S ribosomal protein S10  70.71 
 
 
103 aa  143  8.000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001743  SSU ribosomal protein S10p (S20e)  70.71 
 
 
103 aa  143  8.000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000127695  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0859  30S ribosomal protein S10  68 
 
 
109 aa  142  1e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.591238  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0583  ribosomal protein S10  69.7 
 
 
103 aa  142  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572032  normal  0.180599 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0404  30S ribosomal protein S10  69 
 
 
102 aa  142  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000000016581  normal  0.139805 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0404  30S ribosomal protein S10  69.7 
 
 
103 aa  142  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0007092  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2712  ribosomal protein S10  69.7 
 
 
102 aa  143  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000160608  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0282  ribosomal protein S10  69.7 
 
 
103 aa  142  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000746506  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2689  30S ribosomal protein S10  71 
 
 
102 aa  142  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.283235  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3710  ribosomal protein S10  69.7 
 
 
103 aa  142  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000120586  normal  0.692874 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3745  30S ribosomal protein S10  69.7 
 
 
103 aa  142  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00135486  normal  0.0277892 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3916  ribosomal protein S10  69.7 
 
 
103 aa  142  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.06232e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0322  30S ribosomal protein S10  69.7 
 
 
103 aa  142  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000012719  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3823  30S ribosomal protein S10  69.7 
 
 
103 aa  142  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000546327  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4002  30S ribosomal protein S10  69.7 
 
 
103 aa  142  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000661379  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0058  SSU ribosomal protein S10P  69.7 
 
 
103 aa  142  1e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000415336  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4545  ribosomal protein S10  69.7 
 
 
103 aa  142  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000155488  hitchhiker  0.00172679 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3808  30S ribosomal protein S10  69.7 
 
 
103 aa  142  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000064612  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0290  30S ribosomal protein S10  68.37 
 
 
102 aa  142  1e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000153979  unclonable  7.221610000000001e-29 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3637  ribosomal protein S10  69.7 
 
 
103 aa  142  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000269105  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3637  30S ribosomal protein S10  69.7 
 
 
103 aa  142  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000584006  normal  0.459498 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0679  30S ribosomal protein S10  71 
 
 
102 aa  142  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330255  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0757  30S ribosomal protein S10  69 
 
 
103 aa  142  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515165  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3752  SSU ribosomal protein S10P  68.69 
 
 
103 aa  142  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000621266  hitchhiker  0.0036093 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0048  30S ribosomal protein S10  68 
 
 
105 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3298  30S ribosomal protein S10  69 
 
 
103 aa  142  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000231204  hitchhiker  0.000170279 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0961  ribosomal protein S10  67.68 
 
 
102 aa  141  2e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000260411  hitchhiker  0.000000000152054 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10030  SSU ribosomal protein S10P  67.68 
 
 
102 aa  141  2e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000017716  hitchhiker  0.00000000188362 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0846  SSU ribosomal protein S10P  70 
 
 
103 aa  142  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000264723  decreased coverage  0.00000947215 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2951  30S ribosomal protein S10  69 
 
 
103 aa  142  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00000133875  hitchhiker  0.000000722255 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0707  30S ribosomal protein S10  68 
 
 
105 aa  141  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.282417  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2175  30S ribosomal protein S10  69.7 
 
 
103 aa  141  3e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000032436  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3865  30S ribosomal protein S10  67 
 
 
103 aa  141  4e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0874  ribosomal protein S10  68.37 
 
 
103 aa  141  4e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.522199  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3444  30S ribosomal protein S10  67 
 
 
103 aa  140  4e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.000018475  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0883  30S ribosomal protein S10  67 
 
 
105 aa  141  4e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000808839 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0245  30S ribosomal protein S10  71 
 
 
104 aa  140  4e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.814405  normal  0.941593 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0477  30S ribosomal protein S10  66 
 
 
105 aa  141  4e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0395283  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0932  30S ribosomal protein S10  71.43 
 
 
102 aa  140  5e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0025936  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3329  30S ribosomal protein S10  71.43 
 
 
102 aa  140  5e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000189761 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0277  30S ribosomal protein S10  67.68 
 
 
103 aa  140  6e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.0000127009  decreased coverage  0.000000000926134 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0275  30S ribosomal protein S10  69.61 
 
 
106 aa  140  6e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0390  30S ribosomal protein S10  67.68 
 
 
103 aa  140  6e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000705562  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0272  30S ribosomal protein S10  67.68 
 
 
103 aa  140  6e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  unclonable  0.0000000000156586  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0337  30S ribosomal protein S10  67.68 
 
 
103 aa  140  6e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012954  decreased coverage  0.000295628 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4027  30S ribosomal protein S10  67.68 
 
 
102 aa  140  7e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000005274 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2400  30S ribosomal protein S10  68 
 
 
102 aa  140  7e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028025  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0594  SSU ribosomal protein S10P  66.67 
 
 
102 aa  140  7e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000677882  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>