More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0473 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0473  peptide ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 287 aa  575  1.0000000000000001e-163  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.038149  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0868  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.6 
 
 		 314 aa  211  7.999999999999999e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0758  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.78 
 
 		 340 aa  209  4e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0548  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.95 
 
 		 310 aa  209  5e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.58 
 
 		 310 aa  207  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0465132  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1236  oligopeptide ABC transporter, permease protein  43.81 
 
 		 338 aa  193  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.519507  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1103  oligopeptide ABC transporter permease  43.81 
 
 		 338 aa  193  3e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1085  oligopeptide ABC transporter, permease  43.81 
 
 		 338 aa  193  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1079  oligopeptide ABC transporter, permease  43.81 
 
 		 338 aa  193  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1340  oligopeptide ABC transporter, permease protein  43.81 
 
 		 338 aa  193  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000803209  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1193  oligopeptide ABC transporter permease protein  43.81 
 
 		 338 aa  193  3e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0326029  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2030  oligopeptide ABC transporter permease protein  37.69 
 
 		 293 aa  193  3e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0128641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1091  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.81 
 
 		 338 aa  193  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0104198  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1263  oligopeptide ABC transporter, permease protein  43.81 
 
 		 338 aa  193  3e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1302  oligopeptide ABC transporter, permease protein  43.81 
 
 		 338 aa  193  4e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.793608  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4106  oligopeptide ABC transporter, permease protein  43.36 
 
 		 338 aa  192  4e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0898  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.92 
 
 		 338 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0571  oligopeptide ABC transporter, permease protein  41.89 
 
 		 313 aa  189  5e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1614  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.51 
 
 		 340 aa  188  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2745  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.7 
 
 		 313 aa  180  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0986  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.08 
 
 		 356 aa  180  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1005  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.08 
 
 		 356 aa  180  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.724279  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0064  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.27 
 
 		 321 aa  179  4e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0638  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  38.85 
 
 		 320 aa  179  4.999999999999999e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0590  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.96 
 
 		 302 aa  178  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305304  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3855  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.09 
 
 		 309 aa  176  3e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1948  oligopeptide transport system permease protein C  34.64 
 
 		 300 aa  172  5e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02947  hypothetical protein  36.15 
 
 		 302 aa  171  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3105  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.7 
 
 		 305 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.238767  normal  0.85069 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1916  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.15 
 
 		 325 aa  171  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00471699  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0150  oligopeptide ABC transporter, permease protein  36.36 
 
 		 343 aa  170  2e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002961  oligopeptide transport system permease protein OppC  35.77 
 
 		 300 aa  170  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003659  oligopeptide transport system permease protein OppC  33.93 
 
 		 310 aa  169  5e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1849  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.64 
 
 		 282 aa  169  6e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.176782  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3001  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 		 299 aa  169  6e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.499686  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1137  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.08 
 
 		 293 aa  167  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000296229  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0611  oligopeptide ABC transporter, permease protein  36.26 
 
 		 300 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1930  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease component  36.8 
 
 		 341 aa  166  4e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0488899  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1077  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.61 
 
 		 289 aa  166  5e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0036  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.35 
 
 		 379 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.750131  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3780  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.79 
 
 		 260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.578435 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0510  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.73 
 
 		 270 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2836  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.81 
 
 		 305 aa  163  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.824973 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.95 
 
 		 304 aa  161  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.673312 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2419  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 		 301 aa  160  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264728 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5411  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.78 
 
 		 300 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.49 
 
 		 301 aa  160  3e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.69178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4864  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.78 
 
 		 300 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.09 
 
 		 297 aa  159  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1403  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  37.44 
 
 		 373 aa  159  7e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0967501  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3019  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.54 
 
 		 347 aa  158  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000434539  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2888  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.81 
 
 		 379 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0666  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.83 
 
 		 290 aa  158  1e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.614424  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0843  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  38.43 
 
 		 337 aa  158  1e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0217859  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3265  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.78 
 
 		 300 aa  158  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0755  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, inner membrane subunit  30.83 
 
 		 304 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0941  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.82 
 
 		 301 aa  157  2e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0187  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.9 
 
 		 334 aa  157  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0023  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.9 
 
 		 301 aa  156  4e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1479  ABC oligopeptide transporter, inner membrane subunit OppC  38.89 
 
 		 379 aa  155  6e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.230564  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.79 
 
 		 317 aa  155  6e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.367551 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2802  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.99 
 
 		 300 aa  155  6e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.89 
 
 		 379 aa  155  6e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.923959 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_930  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  35.82 
 
 		 301 aa  155  8e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.438382  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0230  oligopeptide ABC transporter, permease protein  33.9 
 
 		 334 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5320  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.4 
 
 		 300 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.474615  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4732  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.4 
 
 		 300 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5540  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.4 
 
 		 300 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.988714  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0187  oligopeptide ABC transporter permease  34.49 
 
 		 334 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.67 
 
 		 377 aa  154  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0206  oligopeptide ABC transporter, permease protein  34.49 
 
 		 334 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0186  oligopeptide ABC transporter permease protein  34.49 
 
 		 334 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0465  oligopeptide ABC transporter, permease protein  37.96 
 
 		 386 aa  153  2.9999999999999998e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0535  oligopeptide ABC transporter, permease protein  37.96 
 
 		 386 aa  152  5e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1095  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.28 
 
 		 300 aa  152  5e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.407507  hitchhiker  0.0072251 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1343  peptide ABC transporter, permease protein, putative  37.02 
 
 		 479 aa  151  1e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.736839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1536  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppC  33.49 
 
 		 300 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4406  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.32 
 
 		 308 aa  150  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0353  oligopeptide ABC transporter, permease protein  33.49 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2030  ABC transporter, permease protein  32.39 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0884139  normal  0.749678 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1251  putative oligopeptide transport system permease protein  33.49 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0117  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  33.94 
 
 		 300 aa  151  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.697818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2217  oligopeptide ABC transporter, permease protein  33.49 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0387  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppC  33.49 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.510408  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1326  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.44 
 
 		 307 aa  150  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1571  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.44 
 
 		 307 aa  150  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.385135  normal  0.0216142 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0211  oligopeptide ABC transporter, permease protein  35.31 
 
 		 334 aa  150  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1726  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppC  33.49 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0047  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.49 
 
 		 331 aa  150  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3017  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppC  33.49 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2901  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppC  33.49 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00914111  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0206  oligopeptide ABC transporter, permease protein  37.45 
 
 		 334 aa  150  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.91 
 
 		 312 aa  150  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1676  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.1 
 
 		 494 aa  150  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1997  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.51 
 
 		 348 aa  149  5e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0562507  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.16 
 
 		 496 aa  149  5e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5113  oligopeptide ABC transporter, permease protein  34.98 
 
 		 334 aa  149  6e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1395  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  35.63 
 
 		 288 aa  149  6e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.064701  decreased coverage  0.00784209 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0174  oligopeptide ABC transporter, permease  39.29 
 
 		 334 aa  149  7e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.175997  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0177  oligopeptide ABC transporter, permease  39.29 
 
 		 334 aa  149  7e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>