More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0925 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0925  phosphoribosylamine--glycine ligase  100 
 
 		 433 aa  861    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3227  phosphoribosylamine--glycine ligase  64.47 
 
 		 425 aa  536  1e-151  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0779  phosphoribosylamine/glycine ligase  62.17 
 
 		 428 aa  536  1e-151  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00193673  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1775  phosphoribosylamine/glycine ligase  62.04 
 
 		 433 aa  528  1e-149  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.780493 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4039  phosphoribosylamine/glycine ligase  58.47 
 
 		 423 aa  504  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.324775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3997  phosphoribosylamine/glycine ligase  58.47 
 
 		 423 aa  504  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1983  phosphoribosylamine/glycine ligase  57.35 
 
 		 423 aa  494  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.853313 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1471  phosphoribosylamine--glycine ligase  59.06 
 
 		 423 aa  486  1e-136  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0600936 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2231  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.57 
 
 		 423 aa  426  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0036  phosphoribosylamine/glycine ligase  54.42 
 
 		 430 aa  423  1e-117  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2361  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.21 
 
 		 422 aa  421  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1628  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.63 
 
 		 425 aa  421  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1245  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.86 
 
 		 419 aa  412  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.495633  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2122  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.04 
 
 		 435 aa  414  1e-114  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2043  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.24 
 
 		 421 aa  414  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.453314 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0735  phosphoribosylamine/glycine ligase  53.68 
 
 		 425 aa  414  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1699  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.07 
 
 		 427 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251383  normal  0.989876 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17671  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.41 
 
 		 434 aa  405  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13941  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.64 
 
 		 446 aa  402  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.144546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0911  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.06 
 
 		 434 aa  403  1e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2759  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.33 
 
 		 424 aa  404  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000179977  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0172  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.36 
 
 		 429 aa  404  1e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0909  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.9 
 
 		 432 aa  404  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05461  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.72 
 
 		 438 aa  403  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.958381 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64220  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.71 
 
 		 429 aa  401  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.88359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2180  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.16 
 
 		 419 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.900628  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06880  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.95 
 
 		 426 aa  400  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285428  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0707  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.95 
 
 		 429 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3457  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.24 
 
 		 423 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.021302  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0360  Phosphoribosylamine--glycine ligase  51.9 
 
 		 430 aa  401  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03882  phosphoribosylamine-glycine ligase  49.65 
 
 		 429 aa  396  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000860274  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4823  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.47 
 
 		 431 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4876  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.47 
 
 		 431 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4698  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.47 
 
 		 430 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.744432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4613  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.47 
 
 		 431 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.302277 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4239  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.65 
 
 		 429 aa  395  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00124381  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0612  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.95 
 
 		 430 aa  395  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.147919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5575  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.24 
 
 		 429 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03835  hypothetical protein  49.65 
 
 		 429 aa  396  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000931477  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3523  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.24 
 
 		 423 aa  396  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0437232 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1626  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.36 
 
 		 432 aa  396  1e-109  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4020  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.65 
 
 		 429 aa  395  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000927217  normal  0.0101467 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5474  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.65 
 
 		 429 aa  397  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4548  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.65 
 
 		 429 aa  395  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000304372  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0292  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.18 
 
 		 427 aa  395  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00181025  normal  0.0133648 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23090  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.29 
 
 		 425 aa  397  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.121893  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3988  phosphoribosylamine/glycine ligase  49.65 
 
 		 429 aa  394  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0361396  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3149  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.95 
 
 		 433 aa  392  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.868678  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4453  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.41 
 
 		 429 aa  394  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  hitchhiker  0.000392069 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0551  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.01 
 
 		 435 aa  395  1e-108  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4496  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.65 
 
 		 429 aa  394  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000225394  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0414  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.31 
 
 		 427 aa  391  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31965  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0422  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.83 
 
 		 427 aa  388  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4506  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.17 
 
 		 429 aa  391  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0278032 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11500  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.42 
 
 		 430 aa  390  1e-107  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.089244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0221  phosphoribosylamine/glycine ligase  51.19 
 
 		 427 aa  389  1e-107  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.529077 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2652  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.05 
 
 		 429 aa  389  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0646  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.59 
 
 		 436 aa  391  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0784  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.71 
 
 		 422 aa  389  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.110869  normal  0.244609 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3845  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.81 
 
 		 423 aa  389  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000183828  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1300  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.76 
 
 		 432 aa  389  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617554  normal  0.088058 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4419  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.94 
 
 		 429 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.160091  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15411  phosphoribosylglycinamide synthetase  43.5 
 
 		 443 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  decreased coverage  0.000363118  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4508  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.94 
 
 		 429 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0778373 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1338  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.16 
 
 		 430 aa  391  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4386  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.94 
 
 		 429 aa  388  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.677738 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0610  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.76 
 
 		 423 aa  387  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00101284  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0361  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.35 
 
 		 427 aa  387  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.292405  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002184  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.82 
 
 		 429 aa  388  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.25624  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4867  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.53 
 
 		 431 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4407  phosphoribosylamine--glycine ligase  50 
 
 		 431 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.357121 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4582  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.7 
 
 		 429 aa  388  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.213422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1969  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.54 
 
 		 433 aa  385  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.949647 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00211  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.05 
 
 		 429 aa  388  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0215  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.7 
 
 		 430 aa  387  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0406099  normal  0.0125796 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3862  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.58 
 
 		 429 aa  385  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.256361  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0177  phosphoribosylamine/glycine ligase  51.42 
 
 		 429 aa  387  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.348487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0026  phosphoribosylamine/glycine ligase  50.94 
 
 		 704 aa  387  1e-106  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3451  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.1 
 
 		 428 aa  388  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264337  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0960  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.05 
 
 		 426 aa  382  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2342  phosphoribosylamine/glycine ligase  49.64 
 
 		 428 aa  384  1e-105  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.51337  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0526  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.69 
 
 		 419 aa  382  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5622  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.48 
 
 		 425 aa  384  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0356  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.07 
 
 		 428 aa  384  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0104682  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1014  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.53 
 
 		 425 aa  384  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1532  phosphoribosylamine/glycine ligase  51.06 
 
 		 423 aa  383  1e-105  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.612843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3260  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.29 
 
 		 432 aa  384  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1683  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.12 
 
 		 426 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.138512  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2212  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.07 
 
 		 426 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1230  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.76 
 
 		 425 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2295  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.12 
 
 		 426 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1729  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.54 
 
 		 430 aa  382  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.576125 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3467  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.71 
 
 		 423 aa  382  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3665  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.18 
 
 		 428 aa  382  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3219  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.93 
 
 		 429 aa  382  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.708681 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2318  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.88 
 
 		 426 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.57608 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2552  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.93 
 
 		 426 aa  381  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0177333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1384  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.29 
 
 		 425 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.563842  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0464  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.83 
 
 		 428 aa  380  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00032027  normal  0.0111484 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0805  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.82 
 
 		 430 aa  380  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>