More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_2153 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_2153  50S ribosomal protein L7/L12  100 
 
 
128 aa  233  9e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.66919  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27801  hypothetical protein  80.92 
 
 
179 aa  177  4e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1568  50S ribosomal protein L7/L12  85.5 
 
 
131 aa  161  3e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02771  50S ribosomal protein L7/L12  84.73 
 
 
131 aa  160  6e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0831676  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0203  50S ribosomal protein L7/L12  82.44 
 
 
131 aa  156  9e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02191  50S ribosomal protein L7/L12  84.09 
 
 
132 aa  155  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.605695  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2468  50S ribosomal protein L7/L12  91.47 
 
 
129 aa  154  3e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.26707 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1037  50S ribosomal protein L7/L12  69.77 
 
 
129 aa  153  1e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144376  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02211  50S ribosomal protein L7/L12  83.21 
 
 
131 aa  149  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.833107  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02191  50S ribosomal protein L7/L12  83.21 
 
 
131 aa  149  1e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02301  50S ribosomal protein L7/L12  83.21 
 
 
131 aa  149  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0631  50S ribosomal protein L7/L12  70.31 
 
 
128 aa  135  1e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.141708  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2555  50S ribosomal protein L7/L12  72.66 
 
 
128 aa  133  8e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.113587  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1761  50S ribosomal protein L7/L12  61.36 
 
 
132 aa  127  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1737  50S ribosomal protein L7/L12  61.36 
 
 
132 aa  127  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1017  50S ribosomal protein L7/L12  63.36 
 
 
131 aa  120  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221809 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0262  50S ribosomal protein L12P  60.9 
 
 
133 aa  117  3.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.314795  normal  0.113093 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4010  50S ribosomal protein L7/L12  63.36 
 
 
131 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0094315  hitchhiker  0.00000000352658 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0858  50S ribosomal protein L7/L12  59.35 
 
 
125 aa  111  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150638  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3767  50S ribosomal protein L7/L12  51.91 
 
 
122 aa  107  6e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000892884  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0223  50S ribosomal protein L7/L12  51.91 
 
 
122 aa  107  6e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0277  ribosomal protein L7/L12  53.97 
 
 
126 aa  106  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000125688  hitchhiker  0.000433063 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0701  50S ribosomal protein L7/L12  53.23 
 
 
128 aa  105  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2330  ribosomal protein L7/L12  59.38 
 
 
125 aa  105  3e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2729  50S ribosomal protein L7/L12  50.78 
 
 
121 aa  103  5e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000345895  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0299  50S ribosomal protein L7/L12  58.54 
 
 
128 aa  103  6e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00870762  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0195  50S ribosomal protein L7/L12  53.85 
 
 
125 aa  103  6e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00370258  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0176  50S ribosomal protein L7/L12  52.34 
 
 
121 aa  100  6e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000503001  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0181  50S ribosomal protein L7/L12  55.56 
 
 
122 aa  100  7e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.563708  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0209  ribosomal protein L7/L12  53.91 
 
 
121 aa  100  8e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000161356  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08450  LSU ribosomal protein L12P  57.03 
 
 
124 aa  99.8  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0838646  normal  0.398642 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0204  ribosomal protein L7/L12  53.91 
 
 
121 aa  99.4  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.454723  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02420  LSU ribosomal protein L12P  58.59 
 
 
126 aa  99  2e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.346451  normal  0.371005 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03862  50S ribosomal protein L7/L12  54.69 
 
 
121 aa  97.8  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000247439  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4009  ribosomal protein L7/L12  54.69 
 
 
121 aa  97.8  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000814927  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4527  50S ribosomal protein L7/L12  54.69 
 
 
121 aa  97.8  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000174413  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5451  50S ribosomal protein L7/L12  54.69 
 
 
121 aa  97.8  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000730473  hitchhiker  0.0030051 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4474  50S ribosomal protein L7/L12  54.69 
 
 
121 aa  97.8  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000613838  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03815  hypothetical protein  54.69 
 
 
121 aa  97.8  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000273173  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4219  50S ribosomal protein L7/L12  54.69 
 
 
121 aa  97.8  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000137425  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0140  ribosomal protein L7/L12  46.15 
 
 
121 aa  97.8  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000121885  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4039  50S ribosomal protein L7/L12  54.69 
 
 
121 aa  97.8  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00670642  hitchhiker  0.000881188 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4434  50S ribosomal protein L7/L12  54.69 
 
 
121 aa  97.8  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00187873  hitchhiker  0.00000582659 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0214  ribosomal protein L7/L12  53.97 
 
 
126 aa  97.4  5e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3886  ribosomal protein L7/L12  54.69 
 
 
121 aa  97.4  6e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.449029  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1528  ribosomal protein L7/L12  53.91 
 
 
129 aa  96.3  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020563  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0315  ribosomal protein L7/L12  50 
 
 
125 aa  96.3  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00406821  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3170  50S ribosomal protein L7/L12  52.46 
 
 
123 aa  95.5  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3934  ribosomal protein L7/L12  54.03 
 
 
128 aa  95.1  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.189008  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0503  50S ribosomal protein L7/L12  52.67 
 
 
129 aa  95.1  3e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000266288  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0409  50S ribosomal protein L7/L12  54.76 
 
 
124 aa  95.1  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000329533  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0362  50S ribosomal protein L7/L12  50.78 
 
 
120 aa  95.1  3e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00344046  hitchhiker  0.0000691271 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2721  ribosomal protein L7/L12  54.84 
 
 
123 aa  94.7  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.200766  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0173  50S ribosomal protein L7/L12  52.34 
 
 
125 aa  94.4  5e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0397  50S ribosomal protein L7/L12  54.1 
 
 
127 aa  94  6e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.294224  normal  0.0166902 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3867  50S ribosomal protein L7/L12  50.79 
 
 
126 aa  94  6e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0270847 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0501  ribosomal protein L7/L12  46.09 
 
 
121 aa  94  6e-19  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2723  50S ribosomal protein L12P  53.91 
 
 
129 aa  94  6e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000110024  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1664  50S ribosomal protein L7/L12  51.56 
 
 
124 aa  94  7e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.63361  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0386  50S ribosomal protein L7/L12  50 
 
 
126 aa  93.6  8e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0361  50S ribosomal protein L7/L12  50 
 
 
126 aa  93.6  8e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0276  50S ribosomal protein L7/L12  56.25 
 
 
121 aa  93.6  8e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00026  normal  0.0846349 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0257  50S ribosomal protein L7/L12  54.47 
 
 
127 aa  93.6  8e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857279  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2332  50S ribosomal protein L7/L12  50 
 
 
126 aa  93.6  9e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00721046  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2809  50S ribosomal protein L7/L12  51.91 
 
 
130 aa  93.6  9e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000299683  normal  0.290865 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4362  50S ribosomal protein L7/L12  53.91 
 
 
121 aa  92.8  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.993642  normal  0.506874 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0196  50S ribosomal protein L7/L12  53.91 
 
 
121 aa  93.2  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000850088  normal  0.220465 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0392  50S ribosomal protein L7/L12  53.91 
 
 
124 aa  93.2  1e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1591  50S ribosomal protein L7/L12  53.17 
 
 
124 aa  92.8  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1926  ribosomal protein L7/L12  53.91 
 
 
128 aa  93.2  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.252163  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4394  50S ribosomal protein L7/L12  53.91 
 
 
121 aa  92.8  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000226611  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4558  50S ribosomal protein L7/L12  53.91 
 
 
121 aa  92.8  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.347891  hitchhiker  0.0000000000101149 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4484  50S ribosomal protein L7/L12  53.91 
 
 
121 aa  92.8  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000110879 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37027  predicted protein  54.33 
 
 
149 aa  93.2  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00417433  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4481  50S ribosomal protein L7/L12  53.91 
 
 
121 aa  92.8  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102709 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1371  50S ribosomal protein L7/L12  50.41 
 
 
125 aa  93.2  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.526741  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1171  ribosomal protein L7/L12  55.47 
 
 
126 aa  92  2e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000534348  unclonable  0.0000000277278 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1429  ribosomal protein L7/L12  55.28 
 
 
126 aa  92  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1144  ribosomal protein L7/L12  55.56 
 
 
127 aa  92.8  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000177036  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0272  50S ribosomal protein L7/L12  52.34 
 
 
121 aa  92  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.079724  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3156  50S ribosomal protein L7/L12  55.65 
 
 
128 aa  92  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.254156  normal  0.267482 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3346  50S ribosomal protein L7/L12  53.49 
 
 
124 aa  92.4  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.80361  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0577  50S ribosomal protein L7/L12  56.35 
 
 
122 aa  92  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000019471  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2469  50S ribosomal protein L12P  53.17 
 
 
126 aa  91.7  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130995  hitchhiker  0.00690979 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0563  50S ribosomal protein L7/L12  56.35 
 
 
122 aa  92  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000998366  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4677  50S ribosomal protein L7/L12  52.94 
 
 
126 aa  91.7  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0969346  decreased coverage  0.00273455 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1317  50S ribosomal protein L7/L12  50.78 
 
 
124 aa  91.7  3e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000128375  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0232  50S ribosomal protein L7/L12  51.56 
 
 
125 aa  92  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0946443  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0094  50S ribosomal protein L7/L12  53.66 
 
 
119 aa  91.7  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000037425  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3732  50S ribosomal protein L7/L12  55.47 
 
 
122 aa  91.3  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4326  ribosomal protein L7/L12  53.6 
 
 
129 aa  90.9  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.488636 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1953  50S ribosomal protein L7/L12  55.37 
 
 
127 aa  90.9  5e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0817116  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0338  50S ribosomal protein L7/L12  55.81 
 
 
122 aa  90.9  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3861  50S ribosomal protein L7/L12  55.81 
 
 
122 aa  90.9  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000856877  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1346  50S ribosomal protein L7/L12  51.24 
 
 
126 aa  90.5  7e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0781137  normal  0.0992596 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0150  ribosomal protein L7/L12  53.12 
 
 
122 aa  90.1  8e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000840717  normal  0.0325702 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0450  50S ribosomal protein L7/L12  46.09 
 
 
125 aa  90.1  8e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0352  ribosomal protein L7/L12  51.64 
 
 
124 aa  90.1  9e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.40803  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1700  50S ribosomal protein L7/L12  56.2 
 
 
125 aa  90.1  9e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.357459  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2163  50S ribosomal protein L12P  53.49 
 
 
128 aa  90.1  9e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.243742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>