More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1645 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1645  methyltransferase  100 
 
 
209 aa  420  1e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0714  methyltransferase  77.99 
 
 
231 aa  334  7e-91  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07641  methyltransferase  65.55 
 
 
209 aa  288  5.0000000000000004e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.210673 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0321  Methyltransferase type 11  42.58 
 
 
207 aa  165  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0328  Methyltransferase type 11  42.58 
 
 
207 aa  165  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1575  UbiE/COQ5 methyltransferase  41.15 
 
 
207 aa  162  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0135  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  45.24 
 
 
211 aa  159  2e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.228971 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2096  type 11 methyltransferase  42.11 
 
 
207 aa  155  3e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4314  methyltransferase type 11  37.85 
 
 
212 aa  149  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.24068 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5021  Methyltransferase type 11  41.43 
 
 
214 aa  147  9e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0478  demethylmenaquinone methyltransferase  32.87 
 
 
252 aa  75.5  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.5 
 
 
233 aa  75.5  0.0000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09381  methyltransferase  30.91 
 
 
351 aa  74.7  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.398692  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1475  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  28.85 
 
 
221 aa  74.3  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000576982  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09391  methyltransferase  30.3 
 
 
351 aa  72.8  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3788  type 11 methyltransferase  32.9 
 
 
306 aa  72  0.000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0879  SAM (and some other nucleotide) binding motif:Generic methyl-transferase  30.3 
 
 
351 aa  71.6  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10291  methyltransferase  28.66 
 
 
352 aa  70.9  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.55915 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1339  methyltransferase type 11  27.75 
 
 
220 aa  69.3  0.00000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0184467  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1591  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.62 
 
 
221 aa  68.9  0.00000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3864  Methyltransferase type 11  32.24 
 
 
305 aa  68.6  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3913  Methyltransferase type 11  32.89 
 
 
305 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.100491  normal  0.248183 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3132  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  33.1 
 
 
258 aa  66.6  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2827  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.69 
 
 
258 aa  66.2  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0976107 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51145  predicted protein  27.5 
 
 
363 aa  65.9  0.0000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.92 
 
 
237 aa  65.5  0.0000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4431  Methyltransferase type 11  30.81 
 
 
315 aa  65.5  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.184386 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4369  Methyltransferase type 11  30.81 
 
 
315 aa  65.5  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0872  hypothetical protein  30.41 
 
 
316 aa  64.7  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0354264  normal  0.0675112 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0705  Methyltransferase type 11  28.9 
 
 
300 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.716094  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10041  methyltransferase  27.88 
 
 
351 aa  64.3  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1352  hypothetical protein  29.73 
 
 
206 aa  64.3  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3130  hypothetical protein  28.86 
 
 
305 aa  63.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3833  methyltransferase type 11  28.49 
 
 
363 aa  63.5  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  33.61 
 
 
202 aa  63.2  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2596  Methyltransferase type 11  29.87 
 
 
311 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2956  methyltransferase type 11  29.33 
 
 
304 aa  63.2  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.626473  normal  0.0682436 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16301  methyltransferase  31.06 
 
 
357 aa  61.6  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.346442 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2158  methyltransferase type 11  32.95 
 
 
363 aa  62  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0217452 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.53 
 
 
215 aa  61.6  0.000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1309  Methyltransferase type 11  35.85 
 
 
231 aa  61.2  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.236304  normal  0.0297047 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0560  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.68 
 
 
245 aa  60.8  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2414  hypothetical protein  31.52 
 
 
351 aa  61.2  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.177274  normal  0.0190439 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0842  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.71 
 
 
235 aa  61.2  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.3305  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2762  hypothetical protein  25.53 
 
 
209 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000103169 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.03 
 
 
236 aa  60.1  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2397  Methyltransferase type 11  28.06 
 
 
273 aa  60.5  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000574494  decreased coverage  0.000150553 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0140  methyltransferase  29.24 
 
 
353 aa  60.1  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.67 
 
 
250 aa  60.1  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1697  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.36 
 
 
249 aa  60.1  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0587723  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3698  Methyltransferase type 11  29.24 
 
 
323 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  32.38 
 
 
263 aa  60.1  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4009  type 11 methyltransferase  29.82 
 
 
319 aa  60.1  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07721  methyltransferase  28.65 
 
 
353 aa  60.1  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0608577 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11556  methyltransferase  33.98 
 
 
347 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0639  Methyltransferase type 11  34.01 
 
 
307 aa  59.3  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110248 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  34.25 
 
 
271 aa  59.3  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0166  DNA topoisomerase VI subunit A-like protein  30 
 
 
257 aa  59.3  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2608  hypothetical protein  26.24 
 
 
209 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000306401 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2054  hypothetical protein  32.35 
 
 
313 aa  58.5  0.00000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.638121  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2013  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.1 
 
 
241 aa  58.9  0.00000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2205  Methyltransferase type 11  26.35 
 
 
362 aa  58.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000273998 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_41  SAM dependent methyltransferase, UbiE family  30.56 
 
 
202 aa  57.4  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000057615  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0537  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.98 
 
 
235 aa  57.8  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.383652 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  35.29 
 
 
236 aa  57.8  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1472  Methyltransferase type 11  29.6 
 
 
242 aa  57.8  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12966  methyltransferase  31.19 
 
 
270 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  30.99 
 
 
256 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0485  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.81 
 
 
249 aa  57  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.693247  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  30.14 
 
 
222 aa  57.4  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0176  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.4 
 
 
220 aa  57  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8055  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.01 
 
 
231 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  32.74 
 
 
214 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.99 
 
 
256 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2413  hypothetical protein  25.53 
 
 
209 aa  56.6  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00295431  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0429  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.27 
 
 
249 aa  56.6  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  30.47 
 
 
256 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2590  hypothetical protein  25.53 
 
 
209 aa  56.6  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2564  hypothetical protein  24.82 
 
 
209 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1761  DNA topoisomerase II  33.65 
 
 
658 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.271812 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 
259 aa  56.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3724  methyltransferase type 11  34.91 
 
 
240 aa  56.6  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46747  predicted protein  29.17 
 
 
335 aa  56.6  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0149  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.57 
 
 
351 aa  55.8  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.63 
 
 
217 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1008  methyltransferase type 11  30.77 
 
 
256 aa  55.8  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0240  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
217 aa  55.8  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.373296  normal  0.164188 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  30.91 
 
 
238 aa  55.5  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.78 
 
 
237 aa  55.8  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2995  Methyltransferase type 11  29.05 
 
 
363 aa  55.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.482606  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1589  Methyltransferase type 11  34.62 
 
 
197 aa  55.8  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.58 
 
 
241 aa  55.5  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  30 
 
 
255 aa  55.5  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.19 
 
 
205 aa  55.5  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  37.86 
 
 
225 aa  55.5  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1099  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.64 
 
 
233 aa  55.5  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.729785  normal  0.0384798 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  29.41 
 
 
233 aa  55.5  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0301  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.19 
 
 
257 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2785  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.05 
 
 
226 aa  55.5  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.846293 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1548  methyltransferase type 11  35.51 
 
 
225 aa  55.5  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>