181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2812 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2812  patatin  100 
 
 		 343 aa  711    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.338159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2356  patatin  63.85 
 
 		 345 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1730  patatin  48.54 
 
 		 372 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.220053  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2385  patatin  51.26 
 
 		 335 aa  320  3e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000835704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2550  patatin  52.06 
 
 		 335 aa  320  3e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.128442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1768  patatin  48.96 
 
 		 372 aa  319  5e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.114347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0718  patatin  50.15 
 
 		 344 aa  319  5e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0491611  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2559  Patatin  49.54 
 
 		 372 aa  318  7.999999999999999e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00539059  hitchhiker  0.000000000253034 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1725  patatin  48.34 
 
 		 380 aa  318  1e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000438392  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1591  patatin  48.19 
 
 		 383 aa  315  5e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02679  Patatin  45.95 
 
 		 378 aa  313  2.9999999999999996e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2613  patatin  45.86 
 
 		 415 aa  295  8e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3501  patatin family phospholipase  43.23 
 
 		 422 aa  240  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3630  patatin  43.23 
 
 		 424 aa  239  4e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.330139  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0834  patatin family phospholipase  42.9 
 
 		 422 aa  238  8e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0656  patatin  41.96 
 
 		 373 aa  233  3e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.52912 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4884  phospholipase, patatin family  39.23 
 
 		 357 aa  229  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0375868  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4971  patatin  38.91 
 
 		 364 aa  229  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4919  patatin  38.91 
 
 		 364 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4817  patatin  38.91 
 
 		 357 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04253  predicted esterase  39.09 
 
 		 357 aa  227  2e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.463702  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3621  Patatin  39.09 
 
 		 357 aa  227  2e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4921  phospholipase, patatin family  39.09 
 
 		 357 aa  227  2e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1204  putative phospholipase  41.11 
 
 		 638 aa  227  2e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04219  hypothetical protein  39.09 
 
 		 357 aa  227  2e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.361585  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4925  patatin family phospholipase  39.09 
 
 		 357 aa  227  3e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3679  patatin  39.09 
 
 		 357 aa  226  3e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.436712  hitchhiker  0.00198477 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4978  patatin  38.91 
 
 		 364 aa  227  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.165091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5890  phospholipase, patatin family  38.76 
 
 		 357 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.547138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4612  patatin family phospholipase  38.76 
 
 		 357 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4975  patatin family phospholipase  38.76 
 
 		 357 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.065894  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0537  patatin  37.94 
 
 		 356 aa  221  1.9999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.871804  hitchhiker  0.00848516 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06415  phospholipase  36.3 
 
 		 305 aa  181  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000588  hypothetical protein  36.43 
 
 		 282 aa  177  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.233579  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003010  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  29.86 
 
 		 383 aa  168  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12929  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06662  hypothetical protein  32.28 
 
 		 290 aa  161  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001123  hypothetical protein  31.93 
 
 		 290 aa  158  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0238457  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02892  hypothetical protein  39.29 
 
 		 381 aa  152  5.9999999999999996e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0214  patatin-like phospholipase  30.74 
 
 		 290 aa  148  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1595  hypothetical protein  35.38 
 
 		 389 aa  144  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01883  hypothetical protein  28.87 
 
 		 287 aa  144  3e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4528  phospholipase, patatin family  28.22 
 
 		 284 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.430948  normal  0.279256 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0815  phospholipase, putative  28.22 
 
 		 284 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0555533  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0821  phospholipase, patatin family  27.87 
 
 		 284 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5960900000000002e-53 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0709  phospholipase  27.87 
 
 		 284 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.626659  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0653  phospholipase  27.87 
 
 		 284 aa  103  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000540236  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0652  phospholipase  27.87 
 
 		 284 aa  103  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0951235  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0745  phospholipase  27.87 
 
 		 284 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0574828  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0900  phospholipase, patatin family  27.87 
 
 		 284 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0660  patatin  27.66 
 
 		 284 aa  103  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0803  phospholipase, patatin family  27.53 
 
 		 284 aa  102  9e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.240564  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0630  patatin  27.27 
 
 		 284 aa  102  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000302445  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1339  patatin-like phospholipase family protein  26.74 
 
 		 279 aa  97.1  4e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00020938  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1851  patatin  27.2 
 
 		 283 aa  96.3  7e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.255911  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1546  patatin family phospholipase  26.74 
 
 		 279 aa  95.1  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00664201  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2735  patatin  27.24 
 
 		 304 aa  92.4  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0568052  hitchhiker  0.0000690966 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2716  putative phospholipase  27.05 
 
 		 283 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2446  patatin  26.64 
 
 		 283 aa  89  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0616415  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2763  putative phospholipase  26.64 
 
 		 283 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.224384  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2438  serine protease  26.64 
 
 		 283 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00741052  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2593  putative phospholipase  26.64 
 
 		 283 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0159021 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0215  patatin  29.63 
 
 		 293 aa  87  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000161768  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3501  patatin  26.82 
 
 		 289 aa  87.4  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0437866  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4122  patatin  30.81 
 
 		 293 aa  87  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00238218  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0217  Patatin  26.3 
 
 		 293 aa  87  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000888537  normal  0.183812 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4243  patatin  30.81 
 
 		 293 aa  86.7  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000146713  hitchhiker  0.00194419 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2473  patatin-like phospholipase  26.64 
 
 		 283 aa  86.3  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000274868  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2711  putative phospholipase  26.64 
 
 		 283 aa  86.3  7e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000208359 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3733  patatin  29.9 
 
 		 290 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.445531 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1792  Patatin  25.9 
 
 		 296 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3931  patatin  29.9 
 
 		 290 aa  84  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00834869  normal  0.974076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3804  patatin  29.9 
 
 		 290 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0103  putative esterase-like protein  26.67 
 
 		 281 aa  77.8  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2059  hypothetical protein  27.5 
 
 		 281 aa  76.6  0.0000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.291914  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4525  hypothetical protein  27.94 
 
 		 289 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0997  patatin  29.5 
 
 		 284 aa  75.1  0.000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00027457  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0299  hypothetical protein  27.75 
 
 		 285 aa  71.6  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1409  hypothetical protein  27.6 
 
 		 282 aa  70.5  0.00000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1044  alpha-beta hydrolase family esterase  25.99 
 
 		 283 aa  70.1  0.00000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0733835  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13100  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  28.5 
 
 		 293 aa  70.1  0.00000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0309972  normal  0.551391 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0513  Patatin  28.99 
 
 		 289 aa  69.7  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000855028  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1253  Patatin  27.87 
 
 		 304 aa  68.2  0.0000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1410  hypothetical protein  24.9 
 
 		 270 aa  67  0.0000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14290  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  25.64 
 
 		 303 aa  62.4  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0935  Patatin  24.5 
 
 		 314 aa  60.8  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5074  Patatin  26.64 
 
 		 332 aa  59.7  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0543  alpha-beta hydrolase family esterase  26.24 
 
 		 282 aa  59.7  0.00000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.47199e-26 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08930  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  27.18 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0254499  normal  0.882141 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0810  Patatin  26.22 
 
 		 347 aa  56.6  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.163365 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1761  patatin  26.61 
 
 		 376 aa  55.5  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15620  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  24.76 
 
 		 300 aa  54.7  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0266793  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1897  Patatin  25.13 
 
 		 290 aa  52.8  0.000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184207  hitchhiker  0.00000000000000682914 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0853  patatin  25.88 
 
 		 382 aa  52.8  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000107118  unclonable  0.000000108981 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3005  patatin  27.27 
 
 		 383 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000873649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1500  Patatin  27.71 
 
 		 374 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000109081  normal  0.428917 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2574  Patatin  26.92 
 
 		 307 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.649252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1344  patatin  26.52 
 
 		 374 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0143871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1409  patatin  26.52 
 
 		 374 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1079  Patatin  28.8 
 
 		 251 aa  51.2  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0128373  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2876  patatin  27.71 
 
 		 374 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000103139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>