31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2504 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_2504  hypothetical protein  100 
 
 
124 aa  249  1e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2206  hypothetical protein  55.83 
 
 
120 aa  138  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000336434 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1772  hypothetical protein  49.17 
 
 
122 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.46345  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0428  hypothetical protein  37.1 
 
 
125 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0440  hypothetical protein  36.36 
 
 
122 aa  76.3  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.728055  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4084  hypothetical protein  33.06 
 
 
122 aa  69.7  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1815  hypothetical protein  26.89 
 
 
125 aa  69.7  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.245824  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3291  hypothetical protein  25.83 
 
 
122 aa  62.4  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1354  hypothetical protein  35.25 
 
 
133 aa  62  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.002337  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1237  hypothetical protein  40.91 
 
 
121 aa  60.8  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.106406  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1637  hypothetical protein  30.83 
 
 
122 aa  60.5  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0635046  hitchhiker  0.001286 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2494  hypothetical protein  28.33 
 
 
122 aa  58.9  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.255706 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2486  hypothetical protein  27.35 
 
 
121 aa  58.5  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0794808  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4280  hypothetical protein  29.46 
 
 
115 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5909  hypothetical protein  40.54 
 
 
128 aa  56.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4898  hypothetical protein  27.78 
 
 
124 aa  55.1  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.135304  normal  0.116752 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1888  hypothetical protein  35.71 
 
 
117 aa  53.9  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0537  hypothetical protein  32.17 
 
 
115 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2515  hypothetical protein  32.2 
 
 
116 aa  52.4  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.172015  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6320  hypothetical protein  29.06 
 
 
120 aa  51.2  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1368  hypothetical protein  42.37 
 
 
117 aa  48.9  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2777  hypothetical protein  28.57 
 
 
124 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1771  hypothetical protein  31.71 
 
 
119 aa  47.4  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.300159  normal  0.312594 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2181  hypothetical protein  37.33 
 
 
118 aa  45.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.16221  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4168  hypothetical protein  32.76 
 
 
119 aa  46.2  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000529234  decreased coverage  0.00000158295 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2262  hypothetical protein  41.38 
 
 
116 aa  44.7  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00019364 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0279  hypothetical protein  28.69 
 
 
120 aa  43.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.457399  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2642  hypothetical protein  35.71 
 
 
117 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0170  hypothetical protein  25.42 
 
 
130 aa  41.6  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1681  hypothetical protein  36.23 
 
 
116 aa  40.8  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000243963  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0600  hypothetical protein  35.59 
 
 
118 aa  40  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0476447  normal  0.181324 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>