37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5386 on replicon NC_009507
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009507  Swit_5386  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  384  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2302  hypothetical protein  38.59 
 
 		 203 aa  119  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0620  hypothetical protein  37.5 
 
 		 203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.286873 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1163  hypothetical protein  37.5 
 
 		 203 aa  112  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.242998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3322  hypothetical protein  40.31 
 
 		 208 aa  109  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7805  hypothetical protein  38.46 
 
 		 204 aa  108  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0167986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3835  hypothetical protein  39.18 
 
 		 190 aa  99.4  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4468  hypothetical protein  40.22 
 
 		 215 aa  99.4  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.075562  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71390  hypothetical protein  40 
 
 		 186 aa  99  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6196  hypothetical protein  40 
 
 		 186 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3980  hypothetical protein  35.91 
 
 		 186 aa  91.7  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0213  hypothetical protein  39.01 
 
 		 179 aa  91.7  7e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0641  hypothetical protein  36.81 
 
 		 182 aa  90.5  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0410  hypothetical protein  34.21 
 
 		 206 aa  89.7  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.144489  normal  0.754821 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7679  hypothetical protein  32.63 
 
 		 185 aa  85.9  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3375  protein of unknown function DUF308 membrane  36.08 
 
 		 192 aa  85.9  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00523019  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00883  hypothetical protein  38.55 
 
 		 186 aa  80.9  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0347503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0311  hypothetical protein  33.16 
 
 		 207 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.773139  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5301  hypothetical protein  34.44 
 
 		 186 aa  77  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2295  hypothetical protein  32.28 
 
 		 207 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.357303  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1205  hypothetical protein  34.81 
 
 		 208 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.39038  normal  0.418544 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1519  hypothetical protein  33.51 
 
 		 194 aa  73.6  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5490  hypothetical protein  34.18 
 
 		 191 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1416  hypothetical protein  32.64 
 
 		 219 aa  71.6  0.000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.336817 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1255  hypothetical protein  32.64 
 
 		 219 aa  71.6  0.000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.390712 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2447  hypothetical protein  30.3 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.632564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1963  hypothetical protein  33.33 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.153133 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3612  hypothetical protein  32.45 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.173241  hitchhiker  0.00194962 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5913  hypothetical protein  32.58 
 
 		 190 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.897248  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6893  hypothetical protein  33.67 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.39706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3822  hypothetical protein  30.73 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4892  hypothetical protein  28.95 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4031  protein of unknown function DUF308 membrane  30.11 
 
 		 196 aa  52.8  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4409  hypothetical protein  28.42 
 
 		 283 aa  50.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32866  predicted protein  24.87 
 
 		 224 aa  50.1  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.861678  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36110  hypothetical protein  32.49 
 
 		 254 aa  46.6  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0131  hypothetical protein  29.19 
 
 		 186 aa  41.2  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391144  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>