More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4299 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_4299  aminotransferase  100 
 
 
373 aa  740    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3005  histidinol-phosphate aminotransferase  48.63 
 
 
370 aa  311  1e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13886  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0978  histidinol-phosphate aminotransferase  48.61 
 
 
370 aa  309  5e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.811497  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0742  histidinol-phosphate aminotransferase  46.09 
 
 
371 aa  308  8e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0775  histidinol-phosphate aminotransferase  48.77 
 
 
374 aa  308  9e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00278497 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  49.15 
 
 
374 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0562865 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2193  histidinol-phosphate aminotransferase  43.63 
 
 
392 aa  299  6e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0905  histidinol-phosphate aminotransferase  50 
 
 
374 aa  298  9e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23290  histidinol-phosphate aminotransferase  48.11 
 
 
369 aa  296  4e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.113747 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0952  histidinol-phosphate aminotransferase  50.28 
 
 
384 aa  296  5e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.221365  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1024  histidinol-phosphate aminotransferase  45.96 
 
 
374 aa  296  5e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1851  histidinol-phosphate aminotransferase  48.59 
 
 
369 aa  295  6e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  48.11 
 
 
369 aa  290  3e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2574  histidinol-phosphate aminotransferase  47.19 
 
 
376 aa  288  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.62978  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4075  histidinol-phosphate aminotransferase  46.63 
 
 
370 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000427384  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1684  histidinol-phosphate aminotransferase  43.06 
 
 
369 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3038  histidinol-phosphate aminotransferase  46.44 
 
 
365 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1594  histidinol-phosphate aminotransferase  44.94 
 
 
365 aa  279  6e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.121928 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0175  histidinol-phosphate aminotransferase  43.54 
 
 
370 aa  279  7e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.645733  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15840  histidinol-phosphate aminotransferase  47.75 
 
 
370 aa  277  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1116  histidinol-phosphate aminotransferase  41.85 
 
 
370 aa  276  4e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.177687 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0717  histidinol-phosphate aminotransferase  45.28 
 
 
374 aa  273  3e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0496  histidinol-phosphate aminotransferase  43.17 
 
 
374 aa  271  2e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.128785  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1194  histidinol-phosphate aminotransferase  41.34 
 
 
373 aa  269  5e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1312  histidinol-phosphate aminotransferase  42.9 
 
 
374 aa  268  8.999999999999999e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000790606 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1233  histidinol-phosphate aminotransferase  44.13 
 
 
362 aa  267  2.9999999999999995e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0515  histidinol phosphate aminotransferase  40.62 
 
 
386 aa  264  2e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839874  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1442  histidinol-phosphate aminotransferase  39.77 
 
 
370 aa  261  2e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0612  histidinol-phosphate aminotransferase  37.68 
 
 
369 aa  259  4e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1249  histidinol-phosphate aminotransferase  38.66 
 
 
367 aa  259  6e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.109002  normal  0.0431111 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1417  histidinol-phosphate aminotransferase  45.15 
 
 
371 aa  259  7e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1681  histidinol-phosphate aminotransferase  39.49 
 
 
370 aa  259  8e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2138  histidinol-phosphate aminotransferase  43.13 
 
 
363 aa  258  1e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.302169  normal  0.180028 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9607  histidinol-phosphate aminotransferase  40.11 
 
 
368 aa  256  3e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1400  histidinol-phosphate aminotransferase  39.2 
 
 
370 aa  256  5e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0824  histidinol-phosphate aminotransferase  42.66 
 
 
383 aa  256  5e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0205035  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1428  histidinol-phosphate aminotransferase  39.2 
 
 
370 aa  256  6e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  39.2 
 
 
370 aa  256  6e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1400  histidinol-phosphate aminotransferase  39.2 
 
 
370 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.563984  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1612  histidinol-phosphate aminotransferase  39.2 
 
 
370 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0219277 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1198  histidinol-phosphate aminotransferase  38.98 
 
 
370 aa  254  1.0000000000000001e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107306  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  44.72 
 
 
385 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0342464  normal  0.0473532 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1645  histidinol-phosphate aminotransferase  38.64 
 
 
370 aa  253  3e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1335  histidinol-phosphate aminotransferase  44.03 
 
 
394 aa  250  4e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.687157  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01910  Histidinol-phosphate transaminase  38.18 
 
 
372 aa  245  9.999999999999999e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  41.76 
 
 
373 aa  244  9.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1205  histidinol-phosphate aminotransferase  38.74 
 
 
380 aa  243  5e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.67172  normal  0.780528 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1185  histidinol-phosphate aminotransferase  38.46 
 
 
380 aa  241  2e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.318294 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  35.03 
 
 
358 aa  240  2e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3771  histidinol-phosphate aminotransferase  39.44 
 
 
370 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2310  histidinol-phosphate aminotransferase  45.01 
 
 
364 aa  240  4e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.357051 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0567  histidinol-phosphate aminotransferase  44.04 
 
 
381 aa  239  5.999999999999999e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1241  histidinol-phosphate aminotransferase  38.89 
 
 
370 aa  238  1e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2116  histidinol-phosphate aminotransferase  37.26 
 
 
388 aa  238  1e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  unclonable  0.00000966557 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1574  histidinol-phosphate aminotransferase  39.15 
 
 
370 aa  238  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2049  histidinol-phosphate aminotransferase  33.24 
 
 
373 aa  237  2e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.679361  hitchhiker  0.000000000231729 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3864  aminotransferase  37.05 
 
 
374 aa  236  3e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502444  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1155  histidinol-phosphate aminotransferase  40.51 
 
 
363 aa  233  5e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1184  histidinol-phosphate aminotransferase  39.83 
 
 
362 aa  231  2e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  38.23 
 
 
362 aa  229  6e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0927  histidinol-phosphate aminotransferase  42.62 
 
 
379 aa  228  1e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2282  histidinol-phosphate aminotransferase  35.94 
 
 
366 aa  227  3e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000137435 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2996  histidinol-phosphate aminotransferase  36.52 
 
 
366 aa  226  4e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.77849  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1590  histidinol-phosphate aminotransferase  33.8 
 
 
365 aa  225  9e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0471  histidinol-phosphate aminotransferase  33.43 
 
 
364 aa  224  2e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2137  histidinol-phosphate aminotransferase  39.18 
 
 
365 aa  223  3e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2749  histidinol-phosphate aminotransferase  36.57 
 
 
366 aa  223  3e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2696  histidinol-phosphate aminotransferase  35.36 
 
 
366 aa  222  7e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2958  histidinol-phosphate aminotransferase  35.94 
 
 
366 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1020  histidinol-phosphate aminotransferase  39.39 
 
 
365 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.874382  unclonable  0.0000000000413694 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0898  histidinol-phosphate aminotransferase  39.39 
 
 
365 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.907335  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3273  histidinol-phosphate aminotransferase  40.81 
 
 
377 aa  221  1.9999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0187192 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0307  histidinol-phosphate aminotransferase  37.29 
 
 
378 aa  220  3.9999999999999997e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.210737  normal  0.185476 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2955  histidinol-phosphate aminotransferase  35.36 
 
 
366 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.24092e-22 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3002  histidinol-phosphate aminotransferase  35.36 
 
 
366 aa  219  5e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0113319  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2746  histidinol-phosphate aminotransferase  35.36 
 
 
366 aa  219  6e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2955  histidinol-phosphate aminotransferase  35.36 
 
 
366 aa  219  6e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0331892  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1679  histidinol-phosphate aminotransferase  41.54 
 
 
362 aa  219  7e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4034  histidinol-phosphate aminotransferase  37.5 
 
 
364 aa  216  4e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2379  histidinol phosphate aminotransferase  37.68 
 
 
362 aa  216  4e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.279952 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  36.84 
 
 
371 aa  216  5e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00917892 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4283  histidinol-phosphate aminotransferase  35.46 
 
 
365 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0212802 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0217  histidinol-phosphate aminotransferase  36.26 
 
 
366 aa  214  9.999999999999999e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2675  histidinol-phosphate aminotransferase  35.19 
 
 
366 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3264  histidinol-phosphate aminotransferase  38.44 
 
 
368 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0482  histidinol-phosphate aminotransferase  40.17 
 
 
365 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1868  histidinol-phosphate aminotransferase  37.54 
 
 
386 aa  213  5.999999999999999e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0318031  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4927  histidinol-phosphate aminotransferase  35.67 
 
 
365 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1974  histidinol-phosphate aminotransferase  34.52 
 
 
369 aa  211  2e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2197  histidinol-phosphate aminotransferase  38.21 
 
 
366 aa  211  2e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1667  histidinol-phosphate aminotransferase  33.15 
 
 
365 aa  210  4e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1183  histidinol-phosphate aminotransferase  34.36 
 
 
365 aa  209  4e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1456  histidinol-phosphate aminotransferase  32.7 
 
 
371 aa  210  4e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.591481  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4101  histidinol-phosphate aminotransferase  33.8 
 
 
365 aa  209  6e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.156349  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2405  histidinol-phosphate aminotransferase  36.44 
 
 
389 aa  208  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1979  histidinol-phosphate aminotransferase  34.25 
 
 
369 aa  207  3e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4254  histidinol-phosphate aminotransferase  33.7 
 
 
365 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0674  histidinol-phosphate aminotransferase  34.07 
 
 
365 aa  206  4e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0362  histidinol-phosphate aminotransferase  30.98 
 
 
364 aa  205  9e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2213  histidinol-phosphate aminotransferase  37.58 
 
 
361 aa  205  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>