More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4268 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4268  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  100 
 
 		 462 aa  956    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.375018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4846  hypothetical protein  53.63 
 
 		 470 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.318443 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1129  hypothetical protein  52.6 
 
 		 468 aa  510  1e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2670  hypothetical protein  53.76 
 
 		 457 aa  497  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1591  hypothetical protein  54.3 
 
 		 457 aa  495  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.176548 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31500  Flavin-dependent oxidoreductase  52.77 
 
 		 463 aa  481  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419822  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1906  DszA family monooxygenase  50.87 
 
 		 457 aa  476  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.214665  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1543  DszA family monooxygenase  50.88 
 
 		 456 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.9269  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1146  monoxygenase  51.55 
 
 		 467 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.948118  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0931  monoxygenase  51.55 
 
 		 467 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639701  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1520  monoxygenase  51.55 
 
 		 467 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148632  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43810  monoxygenase, NtaA/DszA family  49.56 
 
 		 467 aa  467  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.29629  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0093  monoxygenase  51.55 
 
 		 467 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1016  monoxygenase  51.33 
 
 		 467 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0291524  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5152  nitrilotriacetate monooxygenase  50.33 
 
 		 454 aa  463  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669149  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2746  hypothetical protein  49.22 
 
 		 469 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0157125  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5186  monooxygenase, DszA family  48.12 
 
 		 452 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2257  monoxygenase  51.11 
 
 		 467 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3007  hypothetical protein  49 
 
 		 469 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.40837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34540  xenobiotic compound DszA family monooxygenase  49.45 
 
 		 469 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.748973  normal  0.0562583 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2914  hypothetical protein  49.34 
 
 		 462 aa  457  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.513081  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0352  DszA family monooxygenase  47.89 
 
 		 452 aa  457  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.895998  normal  0.798866 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1120  hypothetical protein  49 
 
 		 461 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2933  hypothetical protein  49.45 
 
 		 469 aa  458  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.820953  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34290  DszA family monooxygenase  49.34 
 
 		 462 aa  457  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0671328  normal  0.0164622 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0897  putative monooxygenase  49.78 
 
 		 480 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.125634  normal  0.0455418 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1741  monoxygenase  50.66 
 
 		 467 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139435  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0891  putative monooxygenase  49.56 
 
 		 480 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6097  putative monooxygenase protein  48.89 
 
 		 452 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.97832  normal  0.472399 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0908  putative monooxygenase  49.56 
 
 		 480 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2869  xenobiotic compound monooxygenase  47.79 
 
 		 466 aa  451  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.927289  normal  0.14753 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0238  DszA family monooxygenase  48.45 
 
 		 454 aa  450  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.552909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4990  monooxygenase  48.25 
 
 		 464 aa  448  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6510  putative monooxygenase protein  48.67 
 
 		 452 aa  449  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4930  flavin-dependent oxidoreductase  49.44 
 
 		 470 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.497416  normal  0.995257 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2984  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family  47.45 
 
 		 466 aa  444  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0528073  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1590  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  49.45 
 
 		 460 aa  442  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0963352 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4538  flavin-dependent oxidoreductase  49.67 
 
 		 468 aa  444  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3028  flavin-dependent oxidoreductase  49.44 
 
 		 470 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0660648  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5338  flavin-dependent oxidoreductase  49.44 
 
 		 470 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.287655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2573  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  51.42 
 
 		 478 aa  444  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.210511 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5029  flavin-dependent oxidoreductase  50.11 
 
 		 463 aa  444  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177434  normal  0.283856 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0246  monooxygenase  48.25 
 
 		 463 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4860  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  49 
 
 		 469 aa  441  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.06917  normal  0.729737 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0237  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  47.89 
 
 		 461 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.782934  normal  0.380883 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6560  putative monooxygenase protein, DszA family  47.28 
 
 		 465 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.176413  normal  0.397515 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3195  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  49.22 
 
 		 454 aa  441  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0222  DszA family monooxygenase  47.45 
 
 		 461 aa  438  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0424148  hitchhiker  0.00698134 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2363  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  46.92 
 
 		 467 aa  438  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000880106  hitchhiker  0.00124341 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3392  flavin-dependent oxidoreductase  48.46 
 
 		 465 aa  438  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.425797  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6145  DszA family monooxygenase  46.94 
 
 		 465 aa  435  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.453092  hitchhiker  0.00590526 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1440  monoxygenase  48.9 
 
 		 464 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5217  flavin-dependent oxidoreductase  48.89 
 
 		 472 aa  435  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.668453 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4229  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  51.11 
 
 		 469 aa  434  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0857  hypothetical protein  48.9 
 
 		 472 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1866  monoxygenase  48.9 
 
 		 464 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0384468  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0310  flavin-dependent oxidoreductase  48.91 
 
 		 470 aa  435  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0447  hypothetical protein  48.9 
 
 		 472 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2173  monoxygenase  48.9 
 
 		 464 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.417795  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4688  flavin-dependent oxidoreductase  48.89 
 
 		 472 aa  433  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0991712  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0545  hypothetical protein  48.68 
 
 		 472 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3529  monooxygenase, putative  46.98 
 
 		 454 aa  428  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.756628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2397  monoxygenase  46.76 
 
 		 463 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.661365 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2244  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  46.98 
 
 		 463 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2085  monoxygenase  48.45 
 
 		 464 aa  426  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.924859  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2052  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  47.53 
 
 		 463 aa  427  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.752934  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1560  FMNH2-dependent monooxygenase  44.37 
 
 		 461 aa  423  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.414034  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1591  monoxygenase  47.12 
 
 		 483 aa  419  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.452627  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3872  putative monooxygenase  46.02 
 
 		 467 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0559897 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02460  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  46.27 
 
 		 473 aa  417  9.999999999999999e-116  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.230038  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3462  monoxygenase  44.57 
 
 		 460 aa  416  9.999999999999999e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0705308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3798  putative monooxygenase  45.8 
 
 		 467 aa  415  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.438268 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3490  putative monooxygenase  45.8 
 
 		 467 aa  414  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5154  nitrilotriacetate monooxygenase  43.58 
 
 		 467 aa  409  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.866117  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6108  putative monooxygenase  45.27 
 
 		 469 aa  409  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7155  nitrilotriacetate monooxygenase  44.69 
 
 		 468 aa  406  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2543  putative monooxygenase  44.8 
 
 		 462 aa  392  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.779513  normal  0.2652 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7501  flavin-dependent oxidoreductase-like  44.03 
 
 		 466 aa  389  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.180408  normal  0.269687 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3997  monooxygenase  45.18 
 
 		 459 aa  392  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.784522  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6340  flavin-dependent oxidoreductase-like protein  44.27 
 
 		 466 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6751  flavin-dependent oxidoreductase-like protein  44.25 
 
 		 466 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0288588 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1776  DszA family monooxygenase  44.81 
 
 		 454 aa  382  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6517  flavin-dependent oxidoreductase-like  44.25 
 
 		 466 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02576  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family (AFU_orthologue; AFUA_3G15040)  42.2 
 
 		 481 aa  374  1e-102  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.285559 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2175  hypothetical protein  45.66 
 
 		 408 aa  358  1.9999999999999998e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09004  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17580)  41.18 
 
 		 482 aa  356  5e-97  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43740  monooxygenase, NtaA/SnaA/SoxA/DszA family  40.62 
 
 		 452 aa  354  2e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.514983  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02320  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family (AFU_orthologue; AFUA_6G01920)  39.65 
 
 		 486 aa  345  8e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.678427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3646  putative monooxygenase, DszA family  42.58 
 
 		 460 aa  345  1e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1259  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  40.55 
 
 		 460 aa  340  4e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.860986  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6573  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductases-like protein  40.55 
 
 		 460 aa  340  4e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.265801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6178  hypothetical protein  40.59 
 
 		 460 aa  338  9e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0589592 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45532  predicted protein  39.42 
 
 		 505 aa  335  9e-91  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.533075 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0096  hypothetical protein  40.62 
 
 		 458 aa  332  1e-89  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2534  putative flavin-dependent oxidoreductase  40.93 
 
 		 458 aa  330  4e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.688829  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1792  monooxygenase  40.58 
 
 		 460 aa  328  2.0000000000000001e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.318899 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2800  hypothetical protein  38.72 
 
 		 457 aa  327  3e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5216  nitrilotriacetate monooxygenase  37.17 
 
 		 461 aa  327  4.0000000000000003e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.772157  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36305  predicted protein  38.48 
 
 		 507 aa  315  9.999999999999999e-85  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.412413  normal  0.117145 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3554  hypothetical protein  38.76 
 
 		 475 aa  312  7.999999999999999e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>