186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4003 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4003  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 406 aa  823    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1956  glycosyl transferase group 1  46.32 
 
 		 443 aa  353  4e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1066  glycosyl transferase, group 1  43.53 
 
 		 453 aa  350  3e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.48395  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1254  glycosyl transferase group 1  43.03 
 
 		 413 aa  347  2e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2683  glycosyl transferase group 1  44.44 
 
 		 412 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.765474 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2376  glycosyl transferase group 1  43.73 
 
 		 412 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0530  glycosyl transferase, group 1  44.33 
 
 		 407 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.307998 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0552  glycosyl transferase, group 1  42.79 
 
 		 455 aa  336  3.9999999999999995e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.410076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0700  glycosyltransferase  44.11 
 
 		 407 aa  332  6e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2355  glycosyl transferase, group 1  44.11 
 
 		 407 aa  330  2e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.359383  normal  0.146668 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1625  glycosyltransferase  40.7 
 
 		 407 aa  329  4e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0764414  normal  0.185019 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0219  putative glycosyltransferase  42.79 
 
 		 415 aa  329  6e-89  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0629  glycosyl transferase group 1  42.79 
 
 		 408 aa  323  4e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1873  glycosyl transferase group 1  42.01 
 
 		 428 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113427  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3962  glycosyl transferase group 1  42.86 
 
 		 411 aa  318  2e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.114116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3818  glycosyl transferase group 1  47.06 
 
 		 413 aa  317  2e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.731283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1739  glycosyl transferase, group 1  39.21 
 
 		 402 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00699985 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21031  glycosyltransferase  37.15 
 
 		 407 aa  313  3.9999999999999997e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2461  glycosyl transferase group 1  43.9 
 
 		 390 aa  312  6.999999999999999e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0447  hypothetical protein  40.59 
 
 		 412 aa  311  1e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.607814  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4925  glycosyl transferase, group 1  40.93 
 
 		 409 aa  302  9e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2591  glycosyl transferase group 1  40.5 
 
 		 410 aa  298  8e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2318  glycosyl transferase, group 1  39.45 
 
 		 406 aa  296  5e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0559  glycosyl transferase, group 1  39.76 
 
 		 420 aa  295  7e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.34709 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1803  glycosyl transferase, group 1  40.51 
 
 		 405 aa  292  7e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.143321 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3088  glycosyl transferase, group 1  37.4 
 
 		 402 aa  280  4e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.708464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1893  glycosyl transferase, group 1  38.68 
 
 		 460 aa  261  2e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01271  glycosyltransferase  37.43 
 
 		 385 aa  258  1e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2888  glycosyl transferase group 1  39.95 
 
 		 425 aa  257  2e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.378477  normal  0.0208188 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0109  glycosyltransferase  34.66 
 
 		 401 aa  252  8.000000000000001e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.927996  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3858  glycosyl transferase, group 1  35.71 
 
 		 417 aa  242  1e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1248  glycosyl transferase group 1  34.18 
 
 		 405 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0365  hypothetical protein  36.76 
 
 		 369 aa  239  9e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.309757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0078  glycosyl transferase, group 1  34.31 
 
 		 432 aa  236  5.0000000000000005e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.938289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1356  glycosyl transferase, group 1  33.5 
 
 		 423 aa  231  1e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.699846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4715  glycosyl transferase group 1  36.41 
 
 		 415 aa  232  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0188107 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3439  glycosyl transferase group 1  34.72 
 
 		 406 aa  226  7e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0503  glycosyl transferase group 1  34 
 
 		 403 aa  219  1e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0578  glycosyl transferase, group 1  33.73 
 
 		 518 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.941896  normal  0.221198 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2766  putative glycosyltransferase  33.57 
 
 		 437 aa  210  5e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0111  glycosyltransferase  30.83 
 
 		 401 aa  197  4.0000000000000005e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.451915  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0638  glycosyl transferase group 1  27.86 
 
 		 406 aa  139  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01261  hypothetical protein  25.41 
 
 		 412 aa  133  6e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.96532 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4431  glycosyl transferase group 1  40.71 
 
 		 188 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4495  glycosyl transferase group 1  40.71 
 
 		 188 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0991  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.88 
 
 		 421 aa  89.7  9e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  31.1 
 
 		 386 aa  66.2  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0289  glycosyl transferase, group 1  28.9 
 
 		 405 aa  63.2  0.000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  24.31 
 
 		 360 aa  60.1  0.00000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15860  glycogen synthase  25 
 
 		 397 aa  58.2  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3899  glycosyl transferase group 1  29.78 
 
 		 382 aa  58.9  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2061  glycosyl transferase group 1  25.15 
 
 		 418 aa  57.4  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2807  glycosyl transferase group 1  28.36 
 
 		 412 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1973  glycosyl transferase, group 1  25.81 
 
 		 416 aa  56.6  0.0000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3409  glycosyl transferase group 1  24.79 
 
 		 358 aa  56.2  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  29.03 
 
 		 407 aa  55.1  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0293  glycosyl transferase, group 1  26.27 
 
 		 406 aa  55.5  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.551542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11690  glycogen synthase  25.21 
 
 		 398 aa  55.1  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.328537  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1755  glycosyl transferase group 1  23.66 
 
 		 365 aa  54.3  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1888  glycogen synthase  23.31 
 
 		 404 aa  54.3  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000814984 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4273  glycosyl transferase group 1  20.88 
 
 		 407 aa  53.1  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1822  glycogen synthase  25.68 
 
 		 398 aa  53.1  0.000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.222954 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17450  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.11 
 
 		 402 aa  53.1  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.792945  normal  0.169163 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  26.9 
 
 		 377 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  26.9 
 
 		 377 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0108  glycosyl transferase group 1  28.82 
 
 		 382 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.48 
 
 		 443 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.48 
 
 		 443 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  31.71 
 
 		 439 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.48 
 
 		 499 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.48 
 
 		 443 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.48 
 
 		 443 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0389  glycosyl transferase group 1  23.4 
 
 		 359 aa  52.4  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.48 
 
 		 498 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.48 
 
 		 495 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  24.89 
 
 		 392 aa  52.4  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  27.23 
 
 		 415 aa  51.6  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2285  glycosyl transferase group 1  29.11 
 
 		 410 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0267673  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  31.71 
 
 		 439 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1867  glycosyl transferase, group 1  21.74 
 
 		 412 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  31.71 
 
 		 439 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2685  glycosyl transferase group 1  29.27 
 
 		 412 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1913  glycosyl transferase, group 1  21.74 
 
 		 412 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.434704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  23.35 
 
 		 385 aa  51.2  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1847  glycosyl transferase, group 1  21.74 
 
 		 412 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469612  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1787  glycosyl transferase group 1  26.9 
 
 		 401 aa  51.6  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0817969  normal  0.0689029 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  24.04 
 
 		 377 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2612  glycosyl transferase group 1  33.05 
 
 		 407 aa  51.2  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.198557 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2141  glycogen synthase  22.84 
 
 		 401 aa  51.2  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309796  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2645  glycosyl transferase, group 1  30.22 
 
 		 384 aa  50.8  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  29.27 
 
 		 412 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1027  glycosyl transferase group 1  26.64 
 
 		 377 aa  50.4  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1758  SqdX  24.16 
 
 		 377 aa  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  23.53 
 
 		 358 aa  50.1  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  23.79 
 
 		 406 aa  49.7  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2096  glycosyltransferase  23.56 
 
 		 415 aa  50.1  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1691  glycogen synthase  26.72 
 
 		 409 aa  49.7  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.533865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2461  glycosyl transferase group 1  28.09 
 
 		 374 aa  49.7  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0330  glycosyl transferase group 1  23.71 
 
 		 388 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0196896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1216  general glycosylation pathway protein  25.19 
 
 		 358 aa  49.3  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>