80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3974 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3974  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  100 
 
 		 363 aa  729    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.301778  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5934  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  46.11 
 
 		 380 aa  342  8e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0249  2OG-Fe(II) oxygenase  35.8 
 
 		 325 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2559  putative hydroxylase  36.11 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546533 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3048  putative hydroxylase  34.82 
 
 		 227 aa  57  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0701  putative hydroxylase  28.3 
 
 		 226 aa  55.8  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.455712 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0698  putative hydroxylase  32.1 
 
 		 224 aa  55.5  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00417487  hitchhiker  0.000293405 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12420  putative hydroxylase  27.94 
 
 		 226 aa  53.9  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.455137  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0717  putative hydroxylase  30.25 
 
 		 224 aa  53.1  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00266806  hitchhiker  0.000189122 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3244  putative hydroxylase  30.25 
 
 		 224 aa  52.8  0.000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0054374  hitchhiker  0.00000245191 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4677  putative hydroxylase  34.95 
 
 		 227 aa  52.8  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.000773199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0612  2OG-Fe(II) oxygenase  42.86 
 
 		 226 aa  52.4  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.240573  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03560  putative hydroxylase  35.48 
 
 		 226 aa  52  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12340  putative hydroxylase  25.86 
 
 		 226 aa  51.6  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3913  putative hydroxylase  29.63 
 
 		 224 aa  51.6  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1514  putative hydroxylase  28.73 
 
 		 229 aa  51.2  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35715  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7101  putative hydroxylase  28.23 
 
 		 226 aa  50.8  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1638  putative hydroxylase  37.14 
 
 		 230 aa  50.1  0.00006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0838  putative hydroxylase  29.12 
 
 		 228 aa  50.1  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.143447 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1709  putative hydroxylase  37.14 
 
 		 230 aa  50.1  0.00006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.822877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58580  putative hydroxylase  31.73 
 
 		 226 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00121484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3575  putative hydroxylase  24.49 
 
 		 227 aa  49.7  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.574336 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1130  putative hydroxylase  29.94 
 
 		 227 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.671813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5129  putative hydroxylase  31.73 
 
 		 242 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482297  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0799  putative hydroxylase  32.11 
 
 		 226 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5004  putative hydroxylase  25 
 
 		 227 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3084  putative hydroxylase  31.25 
 
 		 227 aa  48.9  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.418159  normal  0.523268 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4660  putative hydroxylase  31.43 
 
 		 227 aa  48.5  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1313  putative hydroxylase  27.56 
 
 		 209 aa  47.4  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0803  putative hydroxylase  27.91 
 
 		 222 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0577  2OG-Fe(II) oxygenase  28.57 
 
 		 225 aa  47.4  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0176076  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1172  2OG-Fe(II) oxygenase  33.66 
 
 		 226 aa  47.4  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4316  putative hydroxylase  31.19 
 
 		 226 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0120702 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4479  putative hydroxylase  24.24 
 
 		 227 aa  47.4  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0990  2OG-Fe(II) oxygenase  37.68 
 
 		 225 aa  47.4  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20118 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1077  putative hydroxylase  24.73 
 
 		 227 aa  47  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0905  putative hydroxylase  31.19 
 
 		 226 aa  47  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0497199 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0721  putative hydroxylase  27.23 
 
 		 252 aa  47  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000319663  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0750  putative hydroxylase  27.23 
 
 		 252 aa  47  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.904412  hitchhiker  0.000158665 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3634  putative hydroxylase  29.76 
 
 		 224 aa  47  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2548  putative hydroxylase  32.47 
 
 		 225 aa  46.6  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0828  putative hydroxylase  32.47 
 
 		 225 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2839  putative hydroxylase  32.47 
 
 		 225 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.113073 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0106  2OG-Fe(II) oxygenase  38.1 
 
 		 227 aa  46.6  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00788  hypothetical protein  32.47 
 
 		 225 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2838  2OG-Fe(II) oxygenase  32.47 
 
 		 225 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0859  putative hydroxylase  32.47 
 
 		 225 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00771  putative hydroxylase  32.47 
 
 		 225 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0872  putative hydroxylase  32.47 
 
 		 225 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2089  putative hydroxylase  26.95 
 
 		 229 aa  46.2  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0632378 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0741  putative hydroxylase  29.52 
 
 		 224 aa  46.2  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0366446  hitchhiker  0.0000066194 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7102  putative hydroxylase  33.85 
 
 		 227 aa  46.2  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2199  2OG-Fe(II) oxygenase  32 
 
 		 224 aa  46.2  0.0009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.568044  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0953  putative hydroxylase  39.68 
 
 		 228 aa  46.2  0.0009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2812  putative hydroxylase  31.87 
 
 		 226 aa  45.4  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.192542  decreased coverage  0.000000224129 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0862  putative hydroxylase  30.91 
 
 		 226 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3426  putative hydroxylase  25.79 
 
 		 223 aa  45.8  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.475229  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1577  putative hydroxylase  28.67 
 
 		 222 aa  45.4  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.572766  normal  0.0227046 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0219  putative hydroxylase  33.85 
 
 		 227 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0099  2OG-Fe(II) oxygenase  36.9 
 
 		 227 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3334  putative hydroxylase  27.54 
 
 		 229 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0690816  normal  0.437526 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0792  putative hydroxylase  34.17 
 
 		 227 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.182432  normal  0.929966 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2093  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.77 
 
 		 151 aa  45.1  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.652687 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0892  putative hydroxylase  31.07 
 
 		 226 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.137748 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1949  2OG-Fe(II) oxygenase  35.63 
 
 		 227 aa  45.1  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3541  putative hydroxylase  34.48 
 
 		 229 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1675  putative hydroxylase  27.5 
 
 		 219 aa  45.4  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.899153  normal  0.0319364 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1523  2OG-Fe(II) oxygenase  35.19 
 
 		 259 aa  44.7  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0045  putative hydroxylase  32.22 
 
 		 227 aa  44.7  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.635627  normal  0.44842 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0892  putative hydroxylase  36.78 
 
 		 227 aa  43.9  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.132513  normal  0.456008 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4810  putative hydroxylase  34.34 
 
 		 227 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.63397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3557  putative hydroxylase  34.34 
 
 		 227 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5473  putative hydroxylase  34.34 
 
 		 227 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0632728 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3968  putative hydroxylase  27.61 
 
 		 229 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.713172  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1201  putative hydroxylase  37.93 
 
 		 227 aa  43.5  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.515429  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1809  2OG-Fe(II) oxygenase  30 
 
 		 228 aa  43.5  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.893749  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0377  putative hydroxylase  27.06 
 
 		 226 aa  43.1  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.925919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3637  putative hydroxylase  31.25 
 
 		 228 aa  43.1  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2001  putative hydroxylase  28.42 
 
 		 222 aa  42.7  0.009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.563142  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1218  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.58 
 
 		 153 aa  42.7  0.01  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0808047  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>