More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3948 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_3948  cell cycle protein  100 
 
 
405 aa  803    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1882  cell cycle protein  59.38 
 
 
410 aa  448  1e-125  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.115024 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1132  cell cycle protein  52.86 
 
 
397 aa  303  5.000000000000001e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.91568  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0951  cell cycle protein  42.32 
 
 
392 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215554  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1389  cell division protein FtsW  42.02 
 
 
385 aa  282  7.000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1432  cell division protein FtsW  42.02 
 
 
385 aa  282  9e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2595  cell division protein FtsW  41.35 
 
 
384 aa  281  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1743  cell division protein FtsW  42.29 
 
 
386 aa  280  4e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0466348  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2855  cell division protein FtsW  40.81 
 
 
384 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487661 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2892  cell division protein  39.78 
 
 
384 aa  275  1.0000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.628629  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2420  cell division protein FtsW  42.43 
 
 
382 aa  273  5.000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.114347  normal  0.737508 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3167  cell cycle protein  41.55 
 
 
388 aa  265  7e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0456428  normal  0.818594 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2940  cell cycle protein  41.55 
 
 
388 aa  265  7e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.237576 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2079  cell division protein FtsW  42.59 
 
 
375 aa  265  1e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0540467  normal  0.263887 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1190  cell division protein FtsW  43.21 
 
 
399 aa  263  6e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3123  cell cycle protein  40.27 
 
 
388 aa  260  3e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.174848  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2008  cell division protein FtsW  41.51 
 
 
384 aa  259  6e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0298176  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2083  cell division protein FtsW  37.63 
 
 
384 aa  258  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.501886  hitchhiker  0.00100012 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0948  cell division protein FtsW  40.47 
 
 
386 aa  255  8e-67  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.104281  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1050  cell cycle protein  39.35 
 
 
383 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00180763  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2357  cell cycle protein  40.81 
 
 
388 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.178188 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4049  cell division protein FtsW  39.89 
 
 
380 aa  249  8e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3171  cell cycle protein  40.55 
 
 
387 aa  248  2e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.0069748  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3486  cell cycle protein  40.59 
 
 
398 aa  247  2e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7444  cell cycle protein  39.84 
 
 
379 aa  246  4e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.727498  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1278  cell cycle protein  38.61 
 
 
382 aa  246  4e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.959004  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6175  essential cell division protein (stabilizes FtsZ ring)  38.67 
 
 
383 aa  245  9e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.189814 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1993  cell cycle protein  40.21 
 
 
381 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.273485  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0062  cell cycle protein  39.84 
 
 
387 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3395  cell cycle protein  40.48 
 
 
381 aa  244  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3307  cell cycle protein  39.35 
 
 
383 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0691  cell cycle protein  40.21 
 
 
380 aa  233  5e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.145993  normal  0.313961 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2761  cell cycle protein  40.7 
 
 
395 aa  233  5e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.355007  normal  0.882367 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6705  cell cycle protein  40.49 
 
 
379 aa  230  3e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0681  cell division protein FtsW  40 
 
 
389 aa  224  2e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0184419 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3667  cell division protein FtsW  36.66 
 
 
390 aa  222  8e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.249047  normal  0.105898 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2424  putative cell division protein ftsW  40.53 
 
 
388 aa  206  4e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0439759  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4496  cell division protein FtsW  40.71 
 
 
389 aa  186  9e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0692  cell division protein FtsW  38.77 
 
 
388 aa  182  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.393268 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0782  cell division protein FtsW  38.5 
 
 
388 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.18598  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2106  cell division protein FtsW  38.5 
 
 
388 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0754  cell division protein FtsW  35.49 
 
 
375 aa  165  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.138938  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3499  cell cycle protein  33.96 
 
 
387 aa  162  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00851666  normal  0.20091 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0490  cell division protein FtsW  33.7 
 
 
368 aa  160  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.846166  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2788  cell division protein FtsW  35.46 
 
 
371 aa  160  5e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0507  cell division protein FtsW  33.7 
 
 
368 aa  159  8e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1146  cell division protein FtsW  32.24 
 
 
406 aa  158  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1437  stage V sporulation protein E  34.62 
 
 
367 aa  154  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0166  cell division protein FtsW  33.24 
 
 
423 aa  153  5e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.582847  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5099  cell division protein FtsW  34.53 
 
 
474 aa  153  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00102633  normal  0.0547084 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0180  cell division protein FtsW  33.78 
 
 
423 aa  152  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.598529  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0394  cell division protein FtsW, putative  32.97 
 
 
371 aa  150  4e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.612635  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2668  cell division protein ftsW  31.54 
 
 
391 aa  150  5e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2538  cell division protein ftsW  31.54 
 
 
391 aa  150  5e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1974  cell division protein  33.59 
 
 
372 aa  148  1.0000000000000001e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0222  cell division protein FtsW  33.33 
 
 
372 aa  148  1.0000000000000001e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0674  stage V sporulation protein E  31.15 
 
 
367 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1096  cell division protein FtsW  35.22 
 
 
420 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3812  cell division protein FtsW  33.97 
 
 
405 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09080  stage V sporulation protein E  31.59 
 
 
365 aa  147  3e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.861786  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2647  cell division protein FtsW  33.25 
 
 
539 aa  147  3e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3571  cell division protein FtsW  35.6 
 
 
403 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000791404 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0567  rod shape-determining protein roda  31.23 
 
 
360 aa  147  5e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.398514  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2674  cell division protein FtsW  32.8 
 
 
427 aa  146  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3975  cell division protein FtsW  33.52 
 
 
359 aa  146  8.000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0411  cell cycle protein  33.61 
 
 
375 aa  145  9e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4220  cell division protein FtsW  33.7 
 
 
403 aa  145  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3319  cell division protein FtsW  32.88 
 
 
511 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.40135  normal  0.193679 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2203  cell cycle protein FtsW  33.33 
 
 
369 aa  145  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3257  cell division protein FtsW  32.88 
 
 
511 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.19497  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0385  cell division protein FtsW  35.6 
 
 
403 aa  145  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0110798 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3268  cell division protein FtsW  32.88 
 
 
511 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.162204  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3744  cell division protein FtsW  35.6 
 
 
403 aa  145  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000784985 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  32.73 
 
 
368 aa  145  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0487  cell division protein FtsW  32.09 
 
 
427 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.564923  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2730  rod shape-determining protein RodA  28.99 
 
 
371 aa  144  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00606092  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0842  cell cycle protein  34.63 
 
 
364 aa  144  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  31.49 
 
 
368 aa  144  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0449  cell division protein FtsW  33.93 
 
 
415 aa  144  2e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0159  cell cycle protein  31.45 
 
 
369 aa  145  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.679501  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0462  cell division protein FtsW  32.09 
 
 
427 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.526617  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0484  cell cycle protein  28.99 
 
 
509 aa  144  3e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2495  cell cycle protein  31.98 
 
 
386 aa  144  3e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1054  cell division protein FtsW  32.45 
 
 
371 aa  144  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1559  rod shape-determining protein RodA  29.02 
 
 
374 aa  144  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0999879  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3454  cell division protein FtsW  32.61 
 
 
404 aa  144  4e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00477404 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  32.13 
 
 
368 aa  143  5e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  32.41 
 
 
367 aa  143  5e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2927  cell division protein FtsW  32.33 
 
 
417 aa  142  8e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0125089  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3461  rod shape-determining protein RodA  33.33 
 
 
413 aa  142  9e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0402831  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2837  cell division protein FtsW  31.82 
 
 
427 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.202196  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1714  rod shape-determining protein RodA  33.98 
 
 
371 aa  142  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.991825  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3090  cell division protein FtsW  33.42 
 
 
413 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.812659  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3785  cell division protein FtsW  34.38 
 
 
423 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4985  cell division protein FtsW  31.67 
 
 
399 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.348028  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2725  cell division protein FtsW  33.42 
 
 
413 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.669489  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  32.41 
 
 
368 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0529  cell division protein FtsW  31.55 
 
 
427 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.704536  normal  0.739964 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57360  cell division protein FtsW  31.67 
 
 
399 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0558  cell division protein FtsW  31.82 
 
 
427 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>