More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2821 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_2821  ankyrin  100 
 
 
208 aa  420  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.182298  normal  0.0986627 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2980  ankyrin  51.35 
 
 
208 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.362189  normal  0.0382606 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2852  ankyrin  50.27 
 
 
205 aa  167  7e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1284  ankyrin  51.85 
 
 
870 aa  81.6  0.000000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226002  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0550  ankyrin repeat-containing protein  45.57 
 
 
329 aa  68.2  0.00000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0703  hypothetical protein  37.5 
 
 
762 aa  67.8  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0976  Ankyrin  43.62 
 
 
395 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.157423  normal  0.476091 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2208  Ankyrin  37.74 
 
 
144 aa  65.9  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00294118  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1952  ankyrin  36.23 
 
 
223 aa  65.5  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0738  hypothetical protein  40 
 
 
1005 aa  64.7  0.0000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1943  Ankyrin  36.69 
 
 
241 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.579391 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3148  Ankyrin  45.33 
 
 
581 aa  64.3  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0155  Ankyrin  37.21 
 
 
149 aa  63.5  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0849  hypothetical protein  37.74 
 
 
723 aa  63.9  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.048411 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2693  ankyrin repeat-containing protein  36.84 
 
 
933 aa  62.8  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.82952  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3438  ankyrin  36.15 
 
 
296 aa  63.2  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3138  ankyrin  40.37 
 
 
208 aa  62.8  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0382  ankyrin repeat protein  30.39 
 
 
891 aa  62.4  0.000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4177  ankyrin  38.53 
 
 
175 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1797  ankyrin repeat-containing protein  41.89 
 
 
483 aa  62.4  0.000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0173  Ankyrin  36.94 
 
 
149 aa  62.4  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.947078  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0898  ankyrin  36.54 
 
 
450 aa  62.4  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.0000205657  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2661  ankyrin  36.36 
 
 
287 aa  62  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0806598 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2259  ankyrin repeat-containing signal peptide protein  36.43 
 
 
250 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0980373  normal  0.483285 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03775  conserved hypothetical protein  32.56 
 
 
307 aa  61.6  0.000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1144  hypothetical protein  36.36 
 
 
2122 aa  61.6  0.000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0622  Ankyrin  32.82 
 
 
711 aa  61.6  0.000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2451  Ankyrin  35.16 
 
 
155 aa  61.2  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0219  Ankyrin  39.24 
 
 
382 aa  61.2  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.41533e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0871  hypothetical protein  33.57 
 
 
646 aa  60.1  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.985956 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07000  Ankyrin-like protein  31.47 
 
 
173 aa  60.5  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5190  ankyrin repeat-containing protein  34.78 
 
 
236 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.210108 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1384  ankyrin  33.91 
 
 
235 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309496  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1046  ankyrin  34.35 
 
 
257 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.398559  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1435  hypothetical protein  29.22 
 
 
1585 aa  59.7  0.00000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.015567 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  36.19 
 
 
1402 aa  59.3  0.00000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  35.87 
 
 
2413 aa  59.3  0.00000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08767  ankyrin repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02830)  39.33 
 
 
855 aa  58.9  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0941887  normal  0.535904 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1096  ankyrin  32.85 
 
 
1061 aa  58.9  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0912242  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1253  hypothetical protein  32.35 
 
 
956 aa  58.9  0.00000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5572  Ankyrin  37.6 
 
 
157 aa  58.5  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.43275  normal  0.999489 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2380  hypothetical protein  36.11 
 
 
305 aa  58.5  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.691759  normal  0.155983 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6189  ankyrin repeat-containing protein  33.91 
 
 
236 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385081  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1890  ankyrin repeat-containing protein  33.91 
 
 
236 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0277934  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1913  ankyrin repeat-containing protein  33.91 
 
 
236 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0270531 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1153  hypothetical protein  35.29 
 
 
811 aa  58.2  0.00000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2318  Ankyrin  34.48 
 
 
217 aa  57.4  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3533  Ankyrin  40 
 
 
173 aa  57.8  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.254367  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2158  ankyrin repeat-containing protein  33.6 
 
 
240 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1827  ankyrin  33.04 
 
 
236 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0395685  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1865  hypothetical protein  36.56 
 
 
138 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000370925 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1185  ankyrin repeat-containing protein  33.6 
 
 
235 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3006  ankyrin  37.59 
 
 
222 aa  56.6  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2316  ankyrin repeat-containing protein  33.6 
 
 
242 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482363  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3392  ankyrin repeat-containing protein  33.6 
 
 
235 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0474  Ankyrin  37.93 
 
 
868 aa  57.4  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1799  ankyrin  33.04 
 
 
236 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.912311 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0636  hypothetical protein  32.04 
 
 
545 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1421  ankyrin repeat-containing protein  33.6 
 
 
235 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.89673  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1912  ankyrin repeat-containing protein  33.6 
 
 
235 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2277  ankyrin repeat-containing protein  33.6 
 
 
240 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2438  ankyrin repeat-containing protein  33.6 
 
 
242 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.75875  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3164  ankyrin  34.86 
 
 
173 aa  57  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.139563  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2666  ankyrin  34.75 
 
 
237 aa  56.6  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.931958  hitchhiker  0.000000569803 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0228  hypothetical protein  33.88 
 
 
750 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.871268 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02994  conserved hypothetical protein  35.96 
 
 
1133 aa  56.6  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1610  hypothetical protein  39.47 
 
 
4520 aa  56.6  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0911  hypothetical protein  36.7 
 
 
931 aa  56.2  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0380613 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0393  hypothetical protein  38 
 
 
821 aa  56.2  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0225  hypothetical protein  34.45 
 
 
423 aa  56.2  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.728925 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01130  conserved hypothetical protein  35.64 
 
 
1030 aa  55.8  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.329359  normal  0.12831 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  30.08 
 
 
731 aa  55.8  0.0000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5420  ankyrin  34.03 
 
 
274 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1229  hypothetical protein  40 
 
 
1249 aa  55.8  0.0000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0154751 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5275  Ankyrin  41.03 
 
 
178 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.667111 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1887  ankyrin  33.54 
 
 
321 aa  55.8  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.959203 
 
 
-
 
NC_002978  WD0766  ankyrin repeat-containing protein  35.16 
 
 
474 aa  55.5  0.0000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.705844  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4314  ankyrin  30.77 
 
 
426 aa  55.5  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327235  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5600  hypothetical protein  35.05 
 
 
170 aa  55.5  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2151  Ankyrin  35.71 
 
 
490 aa  55.1  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712677 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0363  hypothetical protein  31.48 
 
 
2171 aa  55.1  0.0000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.082224 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05168  NACHT and Ankyrin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G07030)  33.05 
 
 
1307 aa  55.1  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.6235  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2379  Ankyrin  31.75 
 
 
185 aa  54.7  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000440604 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2092  Ankyrin  31.75 
 
 
185 aa  54.7  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1634  ankyrin repeat-containing protein  37.5 
 
 
1116 aa  54.3  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0269822  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5249  ankyrin  39.05 
 
 
190 aa  54.7  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0147  ankyrin repeat-containing protein  43.28 
 
 
954 aa  54.3  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3421  Ankyrin  40 
 
 
197 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.175263  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3262  Ankyrin  33.59 
 
 
163 aa  54.7  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00689099  normal  0.0238683 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0015  ankyrin  32.19 
 
 
194 aa  54.7  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.189305  hitchhiker  0.00296993 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1108  ankyrin repeat protein  36.84 
 
 
740 aa  54.3  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.383427  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1343  ankyrin domain-containing protein  32.99 
 
 
178 aa  54.3  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0374452 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1152  hypothetical protein  49.21 
 
 
339 aa  53.9  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0378  ankyrin  30.25 
 
 
186 aa  53.9  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00324909  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2058  hypothetical protein  36 
 
 
580 aa  53.9  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4090  hypothetical protein  32 
 
 
427 aa  53.9  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2256  ankyrin  43.24 
 
 
187 aa  53.9  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.410202  normal  0.75483 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1618  Ankyrin  43.24 
 
 
187 aa  53.9  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1000  ankyrin  37.37 
 
 
494 aa  53.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0471  Ankyrin  32.61 
 
 
249 aa  53.1  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>