38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1556 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1556  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  270  6e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.606485 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2309  hypothetical protein  28.57 
 
 		 181 aa  67.4  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00812325 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1798  hypothetical protein  35.85 
 
 		 166 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0394364  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1730  hypothetical protein  37.14 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000217513  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2101  hypothetical protein  34.58 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0911395  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3578  hypothetical protein  34.58 
 
 		 162 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.461789  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3349  hypothetical protein  36.45 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.42671  normal  0.0171262 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1000  hypothetical protein  33.04 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4144  hypothetical protein  33.06 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.752301 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1070  hypothetical protein  29.92 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00610238  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0572  hypothetical protein  34.51 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.541327  hitchhiker  0.00799235 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4536  hypothetical protein  30.83 
 
 		 157 aa  53.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.251544  normal  0.629992 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0105  hypothetical protein  32.23 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.516432  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1483  hypothetical protein  32.23 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0550  hypothetical protein  32.23 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.906026  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0566  hypothetical protein  32.23 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2912  hypothetical protein  32.23 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0458  hypothetical protein  32.23 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0733  hypothetical protein  32.23 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.253076  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0455  hypothetical protein  31.43 
 
 		 144 aa  51.2  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.596707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0303  hypothetical protein  30.83 
 
 		 127 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3965  hypothetical protein  30.28 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0275074  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0488  hypothetical protein  31.4 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2873  hypothetical protein  32.23 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3105  hypothetical protein  31.9 
 
 		 152 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.965221  normal  0.584323 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2731  hypothetical protein  32.23 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6143  hypothetical protein  32.23 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0947  hypothetical protein  32.41 
 
 		 195 aa  47.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.936738 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1519  hypothetical protein  32.41 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3581  hypothetical protein  33.96 
 
 		 160 aa  47  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2472  hypothetical protein  26.05 
 
 		 126 aa  44.7  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.435209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2824  hypothetical protein  30.58 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3016  hypothetical protein  38.75 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.689478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2457  hypothetical protein  29.46 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0270573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2813  hypothetical protein  30.58 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5108  hypothetical protein  30.43 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2199  hypothetical protein  30.58 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.699425  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8505  hypothetical protein  33.33 
 
 		 129 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.886769 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>