36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_21860 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_21860  hypothetical protein  100 
 
 		 354 aa  728    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.218372  normal  0.0328594 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4993  hypothetical protein  52.31 
 
 		 350 aa  349  3e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2701  hypothetical protein  46.01 
 
 		 353 aa  277  2e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000302317  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6745  hypothetical protein  36.81 
 
 		 653 aa  178  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419034  normal  0.323144 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6063  Ricin B lectin  31.72 
 
 		 524 aa  145  9e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1673  hypothetical protein  26.42 
 
 		 418 aa  105  8e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.595687 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1679  hypothetical protein  25.82 
 
 		 416 aa  100  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.882455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5213  hypothetical protein  25.88 
 
 		 423 aa  99.4  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0312335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4260  hypothetical protein  25.54 
 
 		 397 aa  97.1  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.50651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7163  hypothetical protein  28.25 
 
 		 417 aa  97.1  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3769  hypothetical protein  25.99 
 
 		 410 aa  95.1  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.657962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1894  hypothetical protein  26.63 
 
 		 413 aa  90.5  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2941  hypothetical protein  25.43 
 
 		 410 aa  87  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2746  hypothetical protein  26.82 
 
 		 414 aa  85.5  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000246717  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5827  Triacylglycerol lipase  26.58 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30530  hypothetical protein  26.16 
 
 		 265 aa  57.4  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.859475 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2842  lipolytic protein G-D-S-L family  26.6 
 
 		 353 aa  55.8  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00148431  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1033  hypothetical protein  24.83 
 
 		 298 aa  54.3  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.468233  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1542  Triacylglycerol lipase  25.99 
 
 		 259 aa  53.1  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.429303  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3058  hypothetical protein  24.84 
 
 		 295 aa  52.8  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3694  hypothetical protein  24.01 
 
 		 1357 aa  50.8  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5073  hypothetical protein  23.85 
 
 		 1349 aa  49.7  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.528473  hitchhiker  0.000168425 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0951  Triacylglycerol lipase  25.4 
 
 		 270 aa  49.7  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4974  Triacylglycerol lipase  26.16 
 
 		 261 aa  47.8  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.809775  normal  0.295048 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4925  hypothetical protein  24.25 
 
 		 295 aa  47.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4380  putative secreted hydrolase  28.03 
 
 		 305 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784206  normal  0.181391 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1119  lipolytic protein G-D-S-L family  24.38 
 
 		 297 aa  47.4  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00446637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2246  hypothetical protein  24.49 
 
 		 446 aa  45.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.421702  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0195  hypothetical protein  25.51 
 
 		 323 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0610  hypothetical protein  23.28 
 
 		 455 aa  43.9  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.457827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12270  hypothetical protein  25.3 
 
 		 295 aa  43.5  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.57947  normal  0.510292 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3218  secreted hydrolase  22.62 
 
 		 295 aa  43.9  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134174  normal  0.246696 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3869  hypothetical protein  26 
 
 		 337 aa  43.9  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000000820088  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1455  hypothetical protein  23.59 
 
 		 304 aa  43.5  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03570  GDSL-like Lipase/Acylhydrolase  24.07 
 
 		 291 aa  43.1  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.312052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5446  hypothetical protein  26.84 
 
 		 475 aa  42.7  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231631  normal  0.382515 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>