More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_09380 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_09380  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component  100 
 
 		 267 aa  525  1e-148  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6634  protein of unknown function DUF140  80.56 
 
 		 260 aa  404  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451559  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03700  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component  77.33 
 
 		 250 aa  389  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.270229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0701  hypothetical protein  72.29 
 
 		 261 aa  349  3e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2250  protein of unknown function DUF140  69.84 
 
 		 267 aa  347  2e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4348  protein of unknown function DUF140  63.86 
 
 		 285 aa  341  9e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1128  protein of unknown function DUF140  65.92 
 
 		 268 aa  340  2e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0856  hypothetical protein  61.87 
 
 		 253 aa  322  3e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.792912 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2826  hypothetical protein  56.25 
 
 		 257 aa  266  2e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1554  hypothetical protein  54.55 
 
 		 237 aa  250  2e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13535  integral membrane protein YrbE4a  50 
 
 		 254 aa  249  4e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000148357 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5204  hypothetical protein  55 
 
 		 237 aa  247  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.217332 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5002  hypothetical protein  51.65 
 
 		 254 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4707  hypothetical protein  51.65 
 
 		 254 aa  246  2e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4619  hypothetical protein  51.65 
 
 		 254 aa  246  2e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3686  hypothetical protein  49.17 
 
 		 270 aa  239  2e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.86718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3673  hypothetical protein  49.17 
 
 		 270 aa  240  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3746  hypothetical protein  49.17 
 
 		 270 aa  240  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.507857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2506  hypothetical protein  46.96 
 
 		 269 aa  239  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.423121 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2849  hypothetical protein  46.96 
 
 		 270 aa  236  4e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1545  hypothetical protein  47.35 
 
 		 271 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1522  hypothetical protein  47.35 
 
 		 271 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3952  protein of unknown function DUF140  51.33 
 
 		 254 aa  233  3e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4606  hypothetical protein  48.15 
 
 		 255 aa  233  3e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.809194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4152  hypothetical protein  47.77 
 
 		 269 aa  229  3e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2988  protein of unknown function DUF140  48.22 
 
 		 285 aa  229  3e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0264  hypothetical protein  47.5 
 
 		 256 aa  229  4e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.720653 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0273  hypothetical protein  47.5 
 
 		 256 aa  229  4e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0283  hypothetical protein  47.5 
 
 		 256 aa  229  4e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.23346 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4190  hypothetical protein  46.12 
 
 		 255 aa  229  5e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.731627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4540  hypothetical protein  47.08 
 
 		 270 aa  228  7e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.113009 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4172  hypothetical protein  44.94 
 
 		 257 aa  226  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2099  hypothetical protein  45.93 
 
 		 255 aa  225  7e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4401  hypothetical protein  46.67 
 
 		 250 aa  222  4e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3830  protein of unknown function DUF140  46.37 
 
 		 267 aa  222  4e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0498  hypothetical protein  46.81 
 
 		 269 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0382697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10598  integral membrane protein YrbE2a  46.67 
 
 		 265 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10168  integral membrane protein YrbE1a  46.81 
 
 		 265 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0654  hypothetical protein  46.81 
 
 		 269 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0633475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1676  hypothetical protein  46.81 
 
 		 266 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.277826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1625  hypothetical protein  46.81 
 
 		 266 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1650  hypothetical protein  46.81 
 
 		 266 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0713  hypothetical protein  49.09 
 
 		 265 aa  219  3e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0361  hypothetical protein  42.8 
 
 		 256 aa  217  2e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0520  protein of unknown function DUF140  47.37 
 
 		 262 aa  215  7e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3984  hypothetical protein  42.8 
 
 		 257 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0132  hypothetical protein  48.18 
 
 		 265 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.99032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3025  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents permease component-like protein  46.15 
 
 		 269 aa  209  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.753078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0957  hypothetical protein  44.93 
 
 		 281 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0012  hypothetical protein  44.49 
 
 		 312 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0106  hypothetical protein  48.4 
 
 		 265 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.963801 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0116  hypothetical protein  48.4 
 
 		 265 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.239683  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0125  hypothetical protein  48.4 
 
 		 265 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.288689  normal  0.150892 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1246  protein of unknown function DUF140  46.05 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.869523  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4170  protein of unknown function DUF140  45.95 
 
 		 285 aa  175  7e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1221  protein of unknown function DUF140  44.6 
 
 		 349 aa  169  5e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0920  hypothetical protein  46.69 
 
 		 255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403471 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3789  protein of unknown function DUF140  41.28 
 
 		 272 aa  157  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1620  protein of unknown function DUF140  39.3 
 
 		 246 aa  145  9e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.346599  normal  0.915848 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  33.47 
 
 		 256 aa  142  8e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0708  protein of unknown function DUF140  37.1 
 
 		 272 aa  133  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  31.5 
 
 		 270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11995  integral membrane protein YrbE3a  45.86 
 
 		 141 aa  125  6e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0833  hypothetical protein  34.69 
 
 		 297 aa  125  9e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0817  hypothetical protein  31.54 
 
 		 257 aa  124  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.879823  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  30.04 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0473  hypothetical protein  33.07 
 
 		 258 aa  122  5e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000261611  unclonable  0.00000724337 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1976  hypothetical protein  30.96 
 
 		 250 aa  122  6e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0788  hypothetical protein  31.01 
 
 		 257 aa  120  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0852  protein of unknown function DUF140  29.53 
 
 		 267 aa  119  7e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0347867 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0705  protein of unknown function DUF140  30.94 
 
 		 269 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.316668  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0190  protein of unknown function DUF140  35.51 
 
 		 262 aa  118  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126608  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3483  hypothetical protein  31.95 
 
 		 257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0562  hypothetical protein  29.2 
 
 		 256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000209401  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1863  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  29.41 
 
 		 251 aa  116  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.685467  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  29.05 
 
 		 256 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1816  hypothetical protein  28.28 
 
 		 267 aa  115  6e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0408  hypothetical protein  31.2 
 
 		 257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0327  hypothetical protein  29.58 
 
 		 258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.650486  normal  0.733671 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2082  protein of unknown function DUF140  28.99 
 
 		 251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1997  protein of unknown function DUF140  28.99 
 
 		 251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3706  hypothetical protein  34.47 
 
 		 258 aa  112  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.311916  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4107  protein of unknown function DUF140  34.38 
 
 		 263 aa  112  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2734  protein of unknown function DUF140  29.29 
 
 		 258 aa  112  6e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4068  protein of unknown function DUF140  34.38 
 
 		 263 aa  112  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1245  hypothetical protein  27.8 
 
 		 257 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1738  hypothetical protein  29.22 
 
 		 260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.025954  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1507  protein of unknown function DUF140  28.87 
 
 		 258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.621937 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0741  protein of unknown function DUF140  30.18 
 
 		 267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121135  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1900  transporter, putative  30.49 
 
 		 257 aa  110  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1577  hypothetical protein  31.1 
 
 		 268 aa  110  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.303696 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0760  protein of unknown function DUF140  31.1 
 
 		 266 aa  109  5e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2986  ABC transporter, permease  32.48 
 
 		 263 aa  109  5e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1067  hypothetical protein  29.08 
 
 		 260 aa  109  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0685  hypothetical protein  31.25 
 
 		 250 aa  109  6e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1271  hypothetical protein  32.35 
 
 		 255 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.584401  hitchhiker  0.000000000788442 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1812  protein of unknown function DUF140  33.06 
 
 		 271 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.402733 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4314  hypothetical protein  31.31 
 
 		 252 aa  108  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.450744  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2708  hypothetical protein  29.92 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2459  ABC transporter, inner membrane subunit  28.92 
 
 		 260 aa  106  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.584552  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>