168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1950 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1950  hypothetical protein  100 
 
 
296 aa  591  1e-168  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.24178  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3809  integral membrane protein  32.44 
 
 
298 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.770617  normal  0.329241 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0036  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.67 
 
 
298 aa  143  3e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1529  integral membrane protein  28 
 
 
298 aa  119  4.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1715  integral membrane protein  27.67 
 
 
298 aa  119  7.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1901  integral membrane protein  27.57 
 
 
298 aa  119  7.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  28.33 
 
 
289 aa  90.1  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0738  DMT family permease  24.36 
 
 
303 aa  85.5  9e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000110425  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0882  transporter, EamA family  23.64 
 
 
303 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  23.64 
 
 
303 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0789  EamA family protein  23.64 
 
 
303 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000376936  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0829  eama family protein  23.64 
 
 
303 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248571  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0725  DMT family permease  23.64 
 
 
303 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.123032  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0739  hypothetical protein  23.13 
 
 
303 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0993  transporter, EamA family  23.27 
 
 
303 aa  82.4  0.000000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00144449  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0919  EamA family protein  22.91 
 
 
303 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.23491  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0924  transporter, EamA family  23.27 
 
 
303 aa  79  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64365e-45 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.12 
 
 
292 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.09 
 
 
292 aa  74.3  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  22.91 
 
 
302 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  25.82 
 
 
311 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  24.65 
 
 
305 aa  70.9  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.67 
 
 
325 aa  65.1  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0672  hypothetical protein  26.01 
 
 
325 aa  62.8  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.176077  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2630  hypothetical protein  22.12 
 
 
309 aa  63.2  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.815333 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  24 
 
 
341 aa  62.4  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  24.33 
 
 
308 aa  61.6  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1865  hypothetical protein  23.32 
 
 
328 aa  62  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0073  hypothetical protein  24.3 
 
 
282 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  20.07 
 
 
303 aa  59.3  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  20.07 
 
 
303 aa  59.3  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  23.88 
 
 
293 aa  59.3  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.67 
 
 
300 aa  59.3  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2617  hypothetical protein  28.08 
 
 
304 aa  58.5  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  19.72 
 
 
303 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2469  hypothetical protein  28.08 
 
 
304 aa  57.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  20.91 
 
 
303 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0334  hypothetical protein  27.92 
 
 
313 aa  57.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  22.11 
 
 
304 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  19.72 
 
 
303 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  19.37 
 
 
303 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  19.72 
 
 
303 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  23.49 
 
 
315 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  20.56 
 
 
303 aa  56.2  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4050  hypothetical protein  26.51 
 
 
310 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4316  hypothetical protein  26.51 
 
 
310 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  20.56 
 
 
303 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.6 
 
 
321 aa  55.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000917632 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12661  SMR family transporter PecM  23.3 
 
 
317 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000571261 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  19.37 
 
 
303 aa  54.7  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1024  hypothetical protein  24.14 
 
 
330 aa  54.7  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2900  hypothetical protein  28.19 
 
 
308 aa  54.7  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.149951  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1212  hypothetical protein  24.4 
 
 
299 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.57 
 
 
300 aa  54.3  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124016  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1789  hypothetical protein  23.02 
 
 
301 aa  54.7  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000223486  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.75 
 
 
298 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106399  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  23.61 
 
 
329 aa  53.9  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0937  hypothetical protein  22.37 
 
 
310 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2617  hypothetical protein  23.33 
 
 
325 aa  53.9  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.387385  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1999  EamA family protein  23.63 
 
 
301 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.099067  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1919  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  23.63 
 
 
301 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.208347  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24 
 
 
291 aa  52.8  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1505  hypothetical protein  23.08 
 
 
305 aa  53.1  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1734  drug/metabolite exporter family protein  23.63 
 
 
301 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000184981  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3379  transporter, EamA family  24.02 
 
 
294 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0798  SMR family transporter PecM  23.1 
 
 
316 aa  52.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3424  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  23.63 
 
 
301 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000803671 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1777  EamA family protein  23.63 
 
 
301 aa  52.4  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00180942  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1756  drug/metabolite exporter family protein  23.63 
 
 
301 aa  52.4  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1915  eama family protein  23.63 
 
 
301 aa  52.4  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0191779  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1951  transporter, EamA family  23.63 
 
 
301 aa  52.4  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000452263 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2020  transporter, EamA family  26.12 
 
 
283 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000240822  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2053  integral membrane protein DUF6  23.51 
 
 
302 aa  52  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3550  hypothetical protein  22.03 
 
 
310 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2926  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.44 
 
 
305 aa  50.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3353  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.95 
 
 
310 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0574  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.98 
 
 
307 aa  51.2  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2723  hypothetical protein  25.26 
 
 
309 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.297419  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0743  hypothetical protein  24.82 
 
 
299 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3467  hypothetical protein  24.91 
 
 
295 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  20.34 
 
 
325 aa  50.4  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4780  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.84 
 
 
301 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.8061  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3804  hypothetical protein  21.23 
 
 
331 aa  50.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5288  hypothetical protein  25.11 
 
 
314 aa  50.4  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3425  hypothetical protein  22.03 
 
 
310 aa  50.4  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3393  transporter, EamA family  24.02 
 
 
294 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  24.02 
 
 
274 aa  50.1  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6116  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24 
 
 
330 aa  49.7  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.51682  normal  0.0433001 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  21.72 
 
 
299 aa  49.7  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4097  hypothetical protein  23.15 
 
 
310 aa  49.7  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.913855 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16531  SMR family transporter  21.12 
 
 
316 aa  49.7  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.724697 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  23.11 
 
 
304 aa  49.7  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  24.51 
 
 
294 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3401  integral membrane protein  24.51 
 
 
294 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.531981  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0953  hypothetical protein  22.07 
 
 
310 aa  48.9  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100703  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3158  EamA family protein  24.02 
 
 
294 aa  48.9  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0097  hypothetical protein  22.15 
 
 
304 aa  48.5  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.112407  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2038  hypothetical protein  19.67 
 
 
301 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174012  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2431  hypothetical protein  23 
 
 
308 aa  48.9  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  21.14 
 
 
309 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>