47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_1901 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009707  JJD26997_1901  integral membrane protein  100 
 
 
298 aa  584  1e-166  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1529  integral membrane protein  91.95 
 
 
298 aa  527  1e-149  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1715  integral membrane protein  92.95 
 
 
298 aa  528  1e-149  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3809  integral membrane protein  36.08 
 
 
298 aa  157  2e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.770617  normal  0.329241 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1950  hypothetical protein  28.29 
 
 
296 aa  123  3e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.24178  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0036  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.47 
 
 
298 aa  122  9.999999999999999e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  24.41 
 
 
305 aa  65.5  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.83 
 
 
292 aa  62  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0097  hypothetical protein  24.41 
 
 
304 aa  62  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.112407  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2630  hypothetical protein  23 
 
 
309 aa  58.5  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.815333 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  22.37 
 
 
289 aa  57  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5288  hypothetical protein  23.33 
 
 
314 aa  55.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2926  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.56 
 
 
305 aa  54.7  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  24.83 
 
 
341 aa  53.1  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0672  hypothetical protein  23.1 
 
 
325 aa  53.1  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.176077  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  23.15 
 
 
309 aa  52.4  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6116  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.14 
 
 
330 aa  50.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.51682  normal  0.0433001 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  22.83 
 
 
309 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4191  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.71 
 
 
298 aa  49.3  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.168223  normal  0.0221146 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.11 
 
 
292 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  22.19 
 
 
309 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0216  hypothetical protein  25.26 
 
 
296 aa  47  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.685922  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2674  hypothetical protein  20.75 
 
 
301 aa  46.6  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  23.91 
 
 
303 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4168  permeases of the drug/metabolite transporter (DMT)  22.36 
 
 
311 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.48 
 
 
291 aa  45.8  0.0009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000531  permease  27.71 
 
 
308 aa  45.4  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  20.45 
 
 
315 aa  45.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  23.29 
 
 
311 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  22.9 
 
 
303 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  23.91 
 
 
303 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  23.23 
 
 
303 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0792  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.63 
 
 
296 aa  43.9  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.90814  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  21.22 
 
 
302 aa  43.9  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0904  hypothetical protein  25.17 
 
 
296 aa  44.3  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  23.23 
 
 
303 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0337  hypothetical protein  23.26 
 
 
279 aa  43.5  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.595745  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  22.56 
 
 
303 aa  43.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  23.57 
 
 
303 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  26.37 
 
 
293 aa  43.1  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0367  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.86 
 
 
293 aa  43.1  0.006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2231  hypothetical protein  28.7 
 
 
302 aa  42.7  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556701  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2110  hypothetical protein  29.09 
 
 
302 aa  42.7  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244484  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2217  hypothetical protein  29.57 
 
 
302 aa  42.7  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207326  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29710  hypothetical protein  23.03 
 
 
310 aa  42.7  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299323  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5521  hypothetical protein  28.7 
 
 
297 aa  42.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459565  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  23.57 
 
 
303 aa  42.4  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>