More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1636 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  100 
 
 
308 aa  627  1e-179  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.413607  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0307  ribose-phosphate pyrophosphokinase  75.97 
 
 
309 aa  491  9.999999999999999e-139  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.918252  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0896  ribose-phosphate pyrophosphokinase  74.68 
 
 
309 aa  477  1e-134  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00634031  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1474  ribose-phosphate pyrophosphokinase  73.79 
 
 
309 aa  480  1e-134  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0996  ribose-phosphate pyrophosphokinase  74.35 
 
 
309 aa  476  1e-133  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1270  ribose-phosphate pyrophosphokinase  73.7 
 
 
309 aa  476  1e-133  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0133436  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0925  ribose-phosphate pyrophosphokinase  74.35 
 
 
309 aa  476  1e-133  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0148542  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1256  ribose-phosphate pyrophosphokinase  70.97 
 
 
311 aa  466  9.999999999999999e-131  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1446  ribose-phosphate pyrophosphokinase  70.13 
 
 
309 aa  462  1e-129  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0807513  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1015  ribose-phosphate pyrophosphokinase  69.9 
 
 
309 aa  456  1e-127  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2004  phosphoribosyl pyrophosphate synthetase  57.23 
 
 
312 aa  364  1e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000613984  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2848  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.17 
 
 
314 aa  363  2e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000330674  hitchhiker  0.0000000000848542 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0743  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.84 
 
 
314 aa  362  6e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.549423  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1472  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.16 
 
 
316 aa  361  8e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0157862 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0661  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.19 
 
 
314 aa  360  1e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3682  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.81 
 
 
316 aa  361  1e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000078681  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1104  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.73 
 
 
313 aa  360  2e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2768  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.84 
 
 
316 aa  360  2e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0630543  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0944  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.73 
 
 
313 aa  359  3e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.494544  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1055  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.03 
 
 
310 aa  359  4e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.973686  normal  0.13758 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41520  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.09 
 
 
313 aa  357  9.999999999999999e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.684903  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0722  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.41 
 
 
313 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162348  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4753  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.68 
 
 
310 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00928462  normal  0.419726 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0527  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.79 
 
 
312 aa  356  2.9999999999999997e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0766  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57 
 
 
310 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4461  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57 
 
 
310 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.329466  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0756  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57 
 
 
310 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0820  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.33 
 
 
315 aa  355  5.999999999999999e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0240183  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2595  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.19 
 
 
314 aa  353  2e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00599255  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0996  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.73 
 
 
315 aa  352  4e-96  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1760  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.31 
 
 
314 aa  352  5e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000290937  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5320  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.81 
 
 
313 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.887978  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61770  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.81 
 
 
313 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.701218  hitchhiker  0.0074174 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01246  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.37 
 
 
311 aa  351  7e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.66 
 
 
313 aa  351  8.999999999999999e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2720  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.95 
 
 
320 aa  351  1e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000418106  normal  0.234705 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2862  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.95 
 
 
320 aa  351  1e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000366656  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004207  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.67 
 
 
314 aa  350  2e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000977539  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2813  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.31 
 
 
320 aa  348  5e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223011  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4133  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.98 
 
 
318 aa  348  5e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.266741  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2188  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.31 
 
 
320 aa  348  5e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0141666  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3173  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.41 
 
 
315 aa  348  5e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.283101  normal  0.911812 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0793  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.41 
 
 
315 aa  348  5e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000256168  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2802  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.31 
 
 
320 aa  348  5e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0348969  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0765  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.41 
 
 
315 aa  348  5e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.675099  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3550  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.59 
 
 
315 aa  348  7e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000537383 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0692  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.59 
 
 
315 aa  348  7e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3618  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.59 
 
 
315 aa  348  7e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.294091  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3741  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.59 
 
 
315 aa  348  7e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.473037 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0172  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.87 
 
 
315 aa  348  9e-95  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0093989 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3498  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.57 
 
 
320 aa  347  1e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000549461 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0786  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.4 
 
 
332 aa  347  1e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000113332  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0125  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.02 
 
 
321 aa  347  1e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0779969  normal  0.177896 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3837  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.1 
 
 
315 aa  346  2e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1293  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.02 
 
 
324 aa  347  2e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0513  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.31 
 
 
318 aa  347  2e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.127422  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0797  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.1 
 
 
315 aa  346  2e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.97766  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0911  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.59 
 
 
314 aa  346  3e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.613362  normal  0.368621 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1986  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.31 
 
 
315 aa  346  3e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.675824  normal  0.0111954 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0185  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.55 
 
 
315 aa  346  3e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.015709  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2812  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.45 
 
 
319 aa  346  3e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0585  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.66 
 
 
318 aa  345  4e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.60749  hitchhiker  0.00709586 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0315  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.66 
 
 
318 aa  345  4e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0515679  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6132  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.98 
 
 
320 aa  345  5e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000299156  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2627  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.52 
 
 
308 aa  345  5e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.98129  normal  0.818637 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2570  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.91 
 
 
315 aa  345  5e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00338227  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2068  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.99 
 
 
315 aa  344  8.999999999999999e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0476582  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2498  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.45 
 
 
319 aa  344  8.999999999999999e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2464  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.99 
 
 
315 aa  344  1e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.162098  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2184  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.99 
 
 
315 aa  344  1e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0421  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.92 
 
 
314 aa  344  1e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2070  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.99 
 
 
315 aa  344  1e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000481775  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1492  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.07 
 
 
317 aa  344  1e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.783372 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2118  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.97 
 
 
315 aa  343  2e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.092676  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3120  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.34 
 
 
318 aa  343  2e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.205277  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0753  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.34 
 
 
318 aa  343  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1502  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.34 
 
 
318 aa  343  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00100657  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0088  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.34 
 
 
318 aa  343  2e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0569  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.34 
 
 
318 aa  343  2e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00937686  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0585  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.34 
 
 
318 aa  343  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.882389  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2930  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.34 
 
 
318 aa  343  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.014212  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0046  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.25 
 
 
315 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1524  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.17 
 
 
313 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.152066  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3604  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.35 
 
 
315 aa  342  2.9999999999999997e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00259725  normal  0.154121 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2411  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.67 
 
 
315 aa  342  2.9999999999999997e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516491  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0100  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.52 
 
 
316 aa  342  5e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.100447  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21230  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.44 
 
 
314 aa  342  5e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002117  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0719  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.63 
 
 
315 aa  342  5e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0196966  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1852  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.67 
 
 
315 aa  342  5.999999999999999e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.220471  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5433  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.4 
 
 
319 aa  342  5.999999999999999e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3256  ribose-phosphate diphosphokinase  53.21 
 
 
313 aa  342  5.999999999999999e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.670875  normal  0.0151507 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0044  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.25 
 
 
315 aa  342  5.999999999999999e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0139  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.02 
 
 
321 aa  340  1e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0474  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.7 
 
 
318 aa  341  1e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393869  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0128  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.02 
 
 
321 aa  340  1e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0899  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.05 
 
 
324 aa  341  1e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.941259  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3463  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.63 
 
 
315 aa  340  2e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.281933  normal  0.770216 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.05 
 
 
325 aa  340  2e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.532932  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2365  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.63 
 
 
316 aa  340  2e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.870749  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0121  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.02 
 
 
321 aa  340  2e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.917582  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>