More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3890 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_3890  aldo/keto reductase  100 
 
 
319 aa  640    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.872462  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4281  aldo/keto reductase  88.33 
 
 
317 aa  565  1e-160  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.198466  hitchhiker  0.0048015 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0069  aldo/keto reductase  67.09 
 
 
323 aa  418  1e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4073  aldo/keto reductase  66.45 
 
 
311 aa  398  9.999999999999999e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.492904 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0458  aldo/keto reductase  63.26 
 
 
317 aa  391  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4777  aldo/keto reductase  63.21 
 
 
321 aa  387  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1876  aldo/keto reductase  62.58 
 
 
317 aa  384  1e-105  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0609138 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1649  aldo/keto reductase  60.44 
 
 
325 aa  374  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.328017  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10970  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  59.38 
 
 
327 aa  372  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6159  aldo/keto reductase  62.94 
 
 
317 aa  370  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.145044  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1641  aldo/keto reductase  58.62 
 
 
325 aa  362  6e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000385668 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6154  aldo/keto reductase  59.37 
 
 
316 aa  358  5e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.775736  normal  0.411679 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5072  aldo/keto reductase  58.73 
 
 
325 aa  352  7e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.156563  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1691  aldo/keto reductase  59.06 
 
 
336 aa  349  3e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0210969 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13010  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  59.75 
 
 
324 aa  329  4e-89  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118581  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4815  aldo/keto reductase  52.23 
 
 
313 aa  317  1e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3931  aldo/keto reductase  52.55 
 
 
313 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.726041  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4128  aldo/keto reductase  51.27 
 
 
313 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2442  aldo/keto reductase  53.23 
 
 
309 aa  311  9e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1288  aldo/keto reductase  51.59 
 
 
313 aa  311  9e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0410  aldo/keto reductase  51.89 
 
 
320 aa  291  1e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.213987  normal  0.0921299 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3670  aldo/keto reductase  46.45 
 
 
311 aa  253  3e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  43.08 
 
 
325 aa  247  1e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0968  aldo/keto reductase  46.27 
 
 
349 aa  247  2e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00511053 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0432  aldo/keto reductase  48.96 
 
 
343 aa  243  1.9999999999999999e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.320892  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1556  aldo/keto reductase  45.18 
 
 
349 aa  243  3e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206898  normal  0.568157 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6197  aldo/keto reductase  42.45 
 
 
339 aa  239  2.9999999999999997e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135033  normal  0.610455 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0554  aldo/keto reductase  43.65 
 
 
341 aa  237  2e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.243293 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3416  aldo/keto reductase  45.21 
 
 
348 aa  235  9e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0585  aldo/keto reductase  45.08 
 
 
344 aa  234  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2528  aldo/keto reductase  45.14 
 
 
343 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0603  aldo/keto reductase  42.81 
 
 
345 aa  230  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.512451  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  46.08 
 
 
352 aa  230  2e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4612  aldo/keto reductase  42.72 
 
 
340 aa  231  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.593922  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6213  aldo/keto reductase  44.41 
 
 
344 aa  229  3e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.344018 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0195  aldo/keto reductase  41.69 
 
 
338 aa  229  6e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2735  aldo/keto reductase  41.8 
 
 
344 aa  228  8e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1417  aldo/keto reductase  41.3 
 
 
349 aa  228  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.479026  normal  0.0673448 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  42.06 
 
 
335 aa  228  1e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7154  aldo/keto reductase  39.51 
 
 
347 aa  228  1e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3784  aldo/keto reductase  43.31 
 
 
342 aa  227  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00710905  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2808  aldo/keto reductase  42.41 
 
 
344 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.191746  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2549  aldo/keto reductase  41.8 
 
 
344 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.943239 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4305  aldo/keto reductase  43.73 
 
 
342 aa  225  6e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0836372  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3505  aldo/keto reductase  44.55 
 
 
344 aa  225  7e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24760  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  41.74 
 
 
323 aa  224  1e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0580627  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4075  aldo/keto reductase  43.12 
 
 
342 aa  223  3e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.48002  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4151  aldo/keto reductase  43.12 
 
 
342 aa  223  3e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3663  aldo/keto reductase  44.14 
 
 
344 aa  223  4e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3852  aldo/keto reductase  42.68 
 
 
389 aa  223  4e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.697779  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4232  aldo/keto reductase  43.46 
 
 
345 aa  223  4.9999999999999996e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1763  aldo/keto reductase  42.52 
 
 
341 aa  222  6e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3074  aldo/keto reductase  42.03 
 
 
333 aa  222  6e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00558733  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2303  aldo/keto reductase  43.79 
 
 
344 aa  222  7e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3487  aldo/keto reductase  45.08 
 
 
341 aa  222  8e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1278  aldo/keto reductase  42.5 
 
 
332 aa  221  9e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3284  aldo/keto reductase  43.52 
 
 
343 aa  221  9.999999999999999e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4161  aldo/keto reductase  42.77 
 
 
344 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4145  aldo/keto reductase  41.18 
 
 
332 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2439  putative aldo/keto reductase  43.49 
 
 
341 aa  220  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608138  decreased coverage  0.000840189 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4309  aldo/keto reductase  42.46 
 
 
344 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17774  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3594  aldo/keto reductase  43.96 
 
 
344 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3193  aldo/keto reductase  42.03 
 
 
333 aa  219  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4856  aldo/keto reductase  41.36 
 
 
343 aa  219  5e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0072  aldo/keto reductase  40.61 
 
 
342 aa  219  6e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3155  aldo/keto reductase  44.79 
 
 
353 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2911  aldo/keto reductase  40.87 
 
 
343 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187668  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5670  aldo/keto reductase  41.93 
 
 
343 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300824  normal  0.0449862 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3087  aldo/keto reductase  43.3 
 
 
333 aa  217  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000843919  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0108  aldo/keto reductase  42.53 
 
 
334 aa  217  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00484238 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0867  putative aldo/keto reductase  42.52 
 
 
349 aa  217  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1764  aldo/keto reductase  41.69 
 
 
354 aa  218  2e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5658  aldo/keto reductase  41.93 
 
 
343 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590758  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0266  aldo/keto reductase  43.03 
 
 
344 aa  217  2e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.305848  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6594  aldo/keto reductase  41.93 
 
 
343 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688437  hitchhiker  0.0000922081 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5984  aldo/keto reductase  44.22 
 
 
368 aa  216  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4175  aldo/keto reductase  43.09 
 
 
345 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530522  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4826  aldo/keto reductase  43.09 
 
 
345 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3340  aldo/keto reductase  43.09 
 
 
345 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1975  aldo/keto reductase  40.94 
 
 
332 aa  216  5e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3210  aldo/keto reductase  41.18 
 
 
342 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0255002 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0110  aldo/keto reductase  41.81 
 
 
325 aa  216  5.9999999999999996e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.199403 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2813  aldo/keto reductase  42.94 
 
 
349 aa  214  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00980112  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1755  aldo/keto reductase  40.98 
 
 
323 aa  214  9.999999999999999e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000557671 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2484  aldo/keto reductase  43.45 
 
 
352 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.797379  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1004  K+ channel beta subunit  40.99 
 
 
334 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0098418  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0033  aldo/keto reductase  43.06 
 
 
339 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4803  aldo/keto reductase  41.59 
 
 
329 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0042  aldo/keto reductase  43.06 
 
 
339 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00274786 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0023  aldo/keto reductase  43.06 
 
 
339 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1459  aldo/keto reductase  41.18 
 
 
350 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2358  aldo/keto reductase  38.8 
 
 
331 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0956157 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6073  aldo/keto reductase  41.38 
 
 
328 aa  213  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114042  normal  0.744467 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2324  aldo/keto reductase  42.48 
 
 
326 aa  212  7e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.7501  hitchhiker  0.00552953 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0155  aldo/keto reductase  41.49 
 
 
329 aa  212  7e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0460  aldo/keto reductase  40.85 
 
 
349 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0913  aldo/keto reductase  41.18 
 
 
352 aa  212  7.999999999999999e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.287018 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7100  aldo/keto reductase  39.14 
 
 
331 aa  211  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.9082  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1954  aldo/keto reductase  44.63 
 
 
349 aa  211  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.464115  normal  0.0603236 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3340  aldo/keto reductase  39.01 
 
 
343 aa  211  2e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.958054  normal  0.0837708 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>