45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0174 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0174  vitamin K epoxide reductase  100 
 
 
210 aa  416  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0188  vitamin K epoxide reductase  77.51 
 
 
211 aa  326  2.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000145856 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4978  membrane protein-like protein  59.24 
 
 
214 aa  229  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1549  Vitamin K epoxide reductase  52.38 
 
 
212 aa  209  2e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.558732  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2485  Vitamin K epoxide reductase  56.99 
 
 
214 aa  206  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0431155  normal  0.166182 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1942  vitamin K epoxide reductase  54.13 
 
 
218 aa  204  5e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1988  vitamin K epoxide reductase  54.13 
 
 
218 aa  204  5e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1922  vitamin K epoxide reductase  53.67 
 
 
218 aa  203  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.576276 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2164  vitamin K epoxide reductase  58.06 
 
 
211 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4201  vitamin K epoxide reductase  55.91 
 
 
211 aa  198  6e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.32434  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4709  Vitamin K epoxide reductase  52.13 
 
 
208 aa  197  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0358404  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25850  predicted membrane protein  55.61 
 
 
183 aa  196  3e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1717  Vitamin K epoxide reductase  58.93 
 
 
214 aa  194  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.109797  normal  0.967803 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1207  Vitamin K epoxide reductase  56.25 
 
 
220 aa  189  2.9999999999999997e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.825947  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12983  integral membrane protein  50.72 
 
 
210 aa  186  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4573  vitamin K epoxide reductase  53.85 
 
 
197 aa  180  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2772  Vitamin K epoxide reductase  55.61 
 
 
181 aa  179  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0263132  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2664  Vitamin K epoxide reductase  49.75 
 
 
201 aa  167  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2627  Vitamin K epoxide reductase  52.94 
 
 
190 aa  164  6.9999999999999995e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.116048  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2148  Vitamin K epoxide reductase  47.06 
 
 
223 aa  156  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000129835 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2394  vitamin K epoxide reductase  47.71 
 
 
223 aa  153  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.334872  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4428  vitamin K epoxide reductase  47.06 
 
 
223 aa  149  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2218  Vitamin K epoxide reductase  44.57 
 
 
198 aa  148  6e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1719  Vitamin K epoxide reductase  41.83 
 
 
241 aa  143  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03100  predicted membrane protein  46.94 
 
 
205 aa  139  3.9999999999999997e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13240  predicted membrane protein  38.51 
 
 
246 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10090  predicted membrane protein  40.23 
 
 
219 aa  124  1e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.222943  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17430  predicted membrane protein  37.79 
 
 
229 aa  117  9e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.720482  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0411  vitamin K epoxide reductase  37.85 
 
 
225 aa  115  5e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.411434  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0904  Vitamin K epoxide reductase  35.56 
 
 
215 aa  104  9e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25470  predicted membrane protein  39.16 
 
 
258 aa  100  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.169686  normal  0.191166 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1036  Vitamin K epoxide reductase  37.5 
 
 
247 aa  97.8  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.45013 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0848  Vitamin K epoxide reductase  37.14 
 
 
220 aa  97.4  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.040124  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0441  vitamin K epoxide reductase family protein  28.02 
 
 
216 aa  85.5  5e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000761314 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0106  hypothetical protein  36.15 
 
 
245 aa  72  0.000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.501997  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2066  vitamin K epoxide reductase  32.69 
 
 
164 aa  54.3  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.293571  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6023  Vitamin K epoxide reductase  35.11 
 
 
139 aa  52.4  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.375701  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0226  Vitamin K epoxide reductase  30.71 
 
 
142 aa  52  0.000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0468  Vitamin K epoxide reductase  31.65 
 
 
325 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0803  vitamin K epoxide reductase  30.21 
 
 
125 aa  46.6  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3639  Vitamin K epoxide reductase  32.97 
 
 
211 aa  46.2  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.958294  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0104  vitamin K epoxide reductase  27.1 
 
 
301 aa  45.4  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0519  vitamin K epoxide reductase  25.84 
 
 
390 aa  43.5  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.539324  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2089  thioredoxin domain-containing protein  28.36 
 
 
304 aa  43.9  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.576452  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5771  Vitamin K epoxide reductase  26.05 
 
 
151 aa  42.7  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.773243 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>