49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_R0036 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_R0036  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0033  tRNA-Met  90.67 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.241393  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0017  tRNA-Met  90.67 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0044  tRNA-Met  90.67 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.55918  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0020  tRNA-Met  94.44 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0043  tRNA-Met  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.22018 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0029  tRNA-Met  97.62 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0016  tRNA-Met  89.06 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.562679  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0006  tRNA-Met  93.02 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0959756 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0042  tRNA-Met  93.02 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000224763  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0034  tRNA-Met  93.02 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000103036  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0008  tRNA-Met  93.02 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0024  tRNA-Ile  85.33 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0065  tRNA-Met  85.33 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.466048  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0012  tRNA-Ile  92.31 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00521238  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0052  tRNA-Met  85.33 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0016  tRNA-Met  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000169837  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0046  tRNA-Ile  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0047  tRNA-Ile  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0016  tRNA-Met  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000153982  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0041  tRNA-Met  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000000608957  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0051  tRNA-Ile  90.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0003  tRNA-Ile  88.89 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.472682  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0039  tRNA-Ile  88.89 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0003  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.300151 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0011  tRNA-Ile  88.89 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0014  tRNA-Ile  88.89 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0031  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.057517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0035  tRNA-Lys  83.82 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0057  tRNA-Lys  83.82 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0002  tRNA-OTHER  96.43 
 
 		 101 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.32778 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0004  tRNA-Lys  85.45 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0005  tRNA-Lys  85.45 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0017  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00199817  normal  0.0150591 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0018  tRNA-Ala  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0007  tRNA-Met  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0042  tRNA-Met  86.96 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0044  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.695473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0007  tRNA-Met  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0030  tRNA-Met  86 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0042  tRNA-Met  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.935118  normal  0.310323 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0012  tRNA-Ala  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.556924 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0008  tRNA-Ile  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0013  tRNA-Ala  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.6257 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0057  tRNA-Ile  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.381014  normal  0.359244 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0006  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.507736 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0051  tRNA-Met  86 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0332583 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0007  tRNA-Met  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.860787  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0049  tRNA-Ile  91.18 
 
 		 86 bp  44.1  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>