42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_R0004 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_R0004  tRNA-Lys  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0005  tRNA-Lys  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0006  tRNA-Lys  98.31 
 
 		 74 bp  109  9.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.507736 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0057  tRNA-Lys  98.25 
 
 		 74 bp  105  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0035  tRNA-Lys  98.25 
 
 		 74 bp  105  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0028  tRNA-Lys  92 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000102441  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0017  tRNA-Thr  91.49 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.545272  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0028  tRNA-Thr  91.49 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0029  tRNA-Thr  91.49 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00440397  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0045  tRNA-Thr  91.49 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0032  tRNA-Thr  91.49 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0007  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.40291  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0055  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0034  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0039  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0042  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0035  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0038  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.944323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0011  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.312587  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0014  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.247268  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0026  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0144424  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0023  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0236487  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0002  tRNA-Lys  96.88 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0260065  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0031  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0058  tRNA-Lys  87.27 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0051  tRNA-Asn  96.67 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0051  tRNA-Asn  96.67 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0073  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0043  tRNA-Met  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.22018 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0034  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.336319  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0027  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0016  tRNA-Met  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000169837  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0013  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000629989  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0016  tRNA-Met  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000153982  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0010  tRNA-His  86.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0829  tRNA-Lys  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0407  tRNA-Lys  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.440416  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0021  tRNA-Lys  85.45 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00204065  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0036  tRNA-Met  85.45 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0017  tRNA-Arg  86 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0421283  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0012  tRNA-Lys  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.711012  normal  0.109612 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0016  tRNA-Lys  88 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0352775  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>