26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_R0027 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_R0027  tRNA-Lys  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0073  tRNA-Lys  94.37 
 
 
77 bp  109  9.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0034  tRNA-Lys  93.1 
 
 
74 bp  83.8  0.000000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.336319  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0021  tRNA-Lys  91.07 
 
 
74 bp  71.9  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00204065  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0007  tRNA-Lys  93.62 
 
 
73 bp  69.9  0.00000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.40291  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0058  tRNA-Lys  93.18 
 
 
74 bp  63.9  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0006  tRNA-Lys  88.14 
 
 
74 bp  61.9  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0006  tRNA-Lys  87.93 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.507736 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0038  tRNA-Lys  86.44 
 
 
74 bp  54  0.000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.944323  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0055  tRNA-Lys  86.44 
 
 
74 bp  54  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0014  tRNA-Lys  86.44 
 
 
74 bp  54  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.247268  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0011  tRNA-Lys  86.44 
 
 
74 bp  54  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.312587  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0035  tRNA-Lys  86.44 
 
 
74 bp  54  0.000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0042  tRNA-Lys  86.44 
 
 
74 bp  54  0.000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0039  tRNA-Lys  86.44 
 
 
74 bp  54  0.000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0034  tRNA-Lys  86.44 
 
 
77 bp  54  0.000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0031  tRNA-Lys  86.44 
 
 
74 bp  54  0.000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0026  tRNA-Lys  86.44 
 
 
74 bp  54  0.000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0144424  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0023  tRNA-Lys  86.44 
 
 
74 bp  54  0.000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0236487  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0005  tRNA-Lys  85.96 
 
 
74 bp  50.1  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0004  tRNA-Lys  85.96 
 
 
74 bp  50.1  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0035  tRNA-Lys  88.64 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0031  tRNA-Lys  85.71 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0053  tRNA-Lys  85.71 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.231894  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0057  tRNA-Lys  84.75 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0002  tRNA-Lys  89.74 
 
 
88 bp  46.1  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0260065  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>