More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_R0016 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_R0016  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0352775  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0036  tRNA-Lys  94.74 
 
 
76 bp  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000293435  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0044  tRNA-Lys  93.24 
 
 
76 bp  107  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00224472  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0020  tRNA-Lys  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00467445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0173  tRNA-Lys  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0567172 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5653  tRNA-Lys  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000242267  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5690  tRNA-Lys  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000246969  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5716  tRNA-Lys  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0824235  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5735a  tRNA-Lys  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0302849  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0096  tRNA-Lys  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000250387  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  92.11 
 
 
79 bp  103  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000021981  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  92.11 
 
 
79 bp  103  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00313762  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Lys-4  tRNA-Lys  92.11 
 
 
79 bp  103  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000455274  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Lys-5  tRNA-Lys  92.11 
 
 
79 bp  103  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106689  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  92.11 
 
 
79 bp  103  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240794  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  92.11 
 
 
79 bp  103  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000772108  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  92.11 
 
 
79 bp  103  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-4  tRNA-Lys  92.11 
 
 
79 bp  103  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-6  tRNA-Lys  92.11 
 
 
79 bp  103  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000899771  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  92.11 
 
 
79 bp  103  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000316756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  92.11 
 
 
79 bp  103  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000759811  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Lys-4  tRNA-Lys  92.11 
 
 
79 bp  103  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000187971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Lys-5  tRNA-Lys  92.11 
 
 
79 bp  103  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000712241  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0856  tRNA-Lys  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000473646  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000787215  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-4  tRNA-Lys  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.067054  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-5  tRNA-Lys  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00169345  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0029  tRNA-Lys  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140728  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5635  tRNA-Lys  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.112483  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5018  tRNA-Lys  92.11 
 
 
78 bp  103  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00214823  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0123  tRNA-Lys  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0178168  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5654  tRNA-Lys  92.11 
 
 
78 bp  103  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000664356  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5576  tRNA-Lys  92.11 
 
 
78 bp  103  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.5317200000000003e-28 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0026  tRNA-Lys  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000388812  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0039  tRNA-Lys  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000453984  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0148  tRNA-Lys  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000555298  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5833  tRNA-Lys  92.11 
 
 
78 bp  103  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00233495  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5803  tRNA-Lys  92.11 
 
 
78 bp  103  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0081474  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5728  tRNA-Lys  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000897911  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4987  tRNA-Lys  92.11 
 
 
78 bp  103  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0781  tRNA-Lys  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.66086e-30 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0097  tRNA-Lys  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00156576  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0194  tRNA-Lys  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000250761  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0275  tRNA-Lys  91.89 
 
 
76 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5670  tRNA-Lys  91.89 
 
 
76 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000995233  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  91.89 
 
 
76 bp  99.6  9e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000539479  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-5  tRNA-Lys  91.89 
 
 
76 bp  99.6  9e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.30826e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  91.89 
 
 
76 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000000525379  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0047  tRNA-Lys  91.89 
 
 
76 bp  99.6  9e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112802  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0297  tRNA-Lys  91.89 
 
 
76 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000294732  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0084  tRNA-Lys  91.89 
 
 
76 bp  99.6  9e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00872406  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0023  tRNA-Lys  91.89 
 
 
76 bp  99.6  9e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169137  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0048  tRNA-Lys  91.89 
 
 
76 bp  99.6  9e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000002395  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0005  tRNA-Lys  91.89 
 
 
76 bp  99.6  9e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000194874  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5662  tRNA-Lys  91.78 
 
 
73 bp  97.6  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000864801  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0048  tRNA-Lys  91.78 
 
 
73 bp  97.6  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000535943  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  91.78 
 
 
73 bp  97.6  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000045502  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5656  tRNA-Lys  91.78 
 
 
76 bp  97.6  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000763421  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0039  tRNA-Lys  90.79 
 
 
76 bp  95.6  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.595409  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0042  tRNA-Lys  90.79 
 
 
76 bp  95.6  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118118  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4575  tRNA-Lys  90.79 
 
 
76 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000569223  normal  0.0806914 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0033  tRNA-Lys  90.79 
 
 
76 bp  95.6  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0059  tRNA-Lys  90.79 
 
 
76 bp  95.6  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5142  tRNA-Lys  90.79 
 
 
76 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000365086  normal  0.814719 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0020  tRNA-Lys  90.79 
 
 
76 bp  95.6  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0111108  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5342  tRNA-Lys  90.79 
 
 
78 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000164653  hitchhiker  0.0000000000098497 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0093  tRNA-Lys  90.79 
 
 
76 bp  95.6  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.8722200000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0228  tRNA-Lys  90.79 
 
 
78 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000829583  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0051  tRNA-Lys  90.79 
 
 
76 bp  95.6  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111029  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0016  tRNA-Lys  90.79 
 
 
76 bp  95.6  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0100  tRNA-Lys  90.79 
 
 
76 bp  95.6  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113325  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0152  tRNA-Lys  90.79 
 
 
76 bp  95.6  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000001938  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0127  tRNA-Lys  90.79 
 
 
76 bp  95.6  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.615577  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0036  tRNA-Lys  90.79 
 
 
76 bp  95.6  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000127196  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0057  tRNA-Lys  90.54 
 
 
76 bp  91.7  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000681091  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5046  tRNA-Lys  90.54 
 
 
76 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000244729  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0100  tRNA-Lys  94.83 
 
 
76 bp  91.7  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000556304  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0098  tRNA-Lys  94.83 
 
 
76 bp  91.7  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000573413  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0022  tRNA-Lys  90.54 
 
 
76 bp  91.7  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00514969  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0080  tRNA-Lys  94.83 
 
 
76 bp  91.7  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000242401  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0077  tRNA-Lys  90.41 
 
 
73 bp  89.7  9e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0047  tRNA-Lys  90.41 
 
 
73 bp  89.7  9e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000113586  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0049  tRNA-Lys  90.41 
 
 
73 bp  89.7  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000206578  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0022  tRNA-Lys  94.64 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.786941  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0038  tRNA-Thr  93.33 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.40901  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0108  tRNA-Lys  93.1 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000399155  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0040  tRNA-Lys  93.1 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0035    93.1 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00887484  normal  0.0895527 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0001  tRNA-Lys  93.1 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000658326  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0107  tRNA-Lys  93.1 
 
 
73 bp  83.8  0.000000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000354885  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2619  tRNA-Lys  90.91 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0471247  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2626  tRNA-Lys  90.91 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2305  tRNA-Lys  90.91 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000831031  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0049  tRNA-Lys  89.19 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000000660852  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0009  tRNA-Lys  89.19 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000161944  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0019  tRNA-Lys  89.04 
 
 
73 bp  81.8  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00557202  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0066  tRNA-Lys  89.04 
 
 
73 bp  81.8  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00163637  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0039  tRNA-Lys  89.04 
 
 
73 bp  81.8  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.163516  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0067  tRNA-Lys  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0804329  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>