More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_R0022 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_R0022  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.786941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0080  tRNA-Lys  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000242401  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0001  tRNA-Lys  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000658326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0098  tRNA-Lys  98.59 
 
 		 76 bp  133  6e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000573413  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0100  tRNA-Lys  98.59 
 
 		 76 bp  133  6e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000556304  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0051  tRNA-Lys  97.18 
 
 		 76 bp  125  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111029  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0093  tRNA-Lys  97.18 
 
 		 76 bp  125  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.8722200000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0036  tRNA-Lys  97.18 
 
 		 76 bp  125  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000127196  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0034  tRNA-Lys  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000195804  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0064  tRNA-Lys  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0329997  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0039  tRNA-Lys  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000395559  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0018  tRNA-Lys  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0351719  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0061  tRNA-Lys  94.37 
 
 		 76 bp  109  9.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000182131  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0008  tRNA-Lys  94.37 
 
 		 76 bp  109  9.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00012117  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0023  tRNA-Lys  96.23 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169137  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0047  tRNA-Lys  96.23 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112802  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0048  tRNA-Lys  96.23 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000002395  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0040  tRNA-Lys  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0016  tRNA-Lys  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0352775  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0036  tRNA-Lys  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000293435  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0001  tRNA-Lys  90.14 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000136938  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0047  tRNA-Lys  90.14 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000815703  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0021  tRNA-Lys  90.14 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0049  tRNA-Lys  90.14 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000000660852  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0107  tRNA-Lys  94.34 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000354885  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0108  tRNA-Lys  94.34 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000399155  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0011  tRNA-Lys  90.62 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0043  tRNA-Lys  90.62 
 
 		 73 bp  79.8  0.00000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000745541  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0044  tRNA-Lys  97.67 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00224472  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0026  tRNA-Lys  97.67 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000388812  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0029  tRNA-Lys  88.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0067  tRNA-Lys  88.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0804329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2312  tRNA-Lys  92.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2619  tRNA-Lys  92.45 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0471247  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2626  tRNA-Lys  92.45 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2305  tRNA-Lys  92.45 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000831031  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0016  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.27479e-28 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0007  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000068563  normal  0.189185 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0014  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.4767600000000005e-29 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0016  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000347926  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0014  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000321021  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0005  tRNA-Lys  95.35 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000194874  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0015  tRNA-Thr  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0084  tRNA-Lys  95.35 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00872406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0016  tRNA-Thr  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0485613 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0082  tRNA-Lys  87.32 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000538289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0042  tRNA-Lys  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000326877  unclonable  0.000000000331306 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0043  tRNA-Lys  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000129549  unclonable  0.000000000302545 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0023  tRNA-Lys  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0024  tRNA-Lys  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0042  tRNA-Lys  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118118  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0024  tRNA-Lys  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0025  tRNA-Lys  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0026  tRNA-Thr  90.74 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0427282  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t0452  tRNA-Asn  95.24 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.133298 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1563  tRNA-Asn  95.24 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1796  tRNA-Asn  95.24 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.3013000000000006e-24 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1802  tRNA-Asn  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000154266 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0407  tRNA-Asn  95.24 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000764097  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0408  tRNA-Asn  95.24 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000000233964  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0020  tRNA-Lys  97.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00467445  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0014  tRNA-Asn  95.12 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000102189  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0100  tRNA-Lys  97.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113325  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5728  tRNA-Lys  97.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000897911  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  97.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000645959  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5662  tRNA-Lys  97.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000864801  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5690  tRNA-Lys  97.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000246969  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5716  tRNA-Lys  97.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0824235  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5735a  tRNA-Lys  97.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0302849  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0096  tRNA-Lys  97.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000250387  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0048  tRNA-Lys  97.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000535943  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  97.3 
 
 		 79 bp  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000021981  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  97.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000539479  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  97.3 
 
 		 79 bp  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00313762  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Lys-4  tRNA-Lys  97.3 
 
 		 79 bp  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000455274  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0012  tRNA-Asn  95.12 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  97.3 
 
 		 79 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000316756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  97.3 
 
 		 79 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000759811  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  97.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000000525379  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Lys-4  tRNA-Lys  97.3 
 
 		 79 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000187971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Lys-5  tRNA-Lys  97.3 
 
 		 79 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000712241  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0005  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0039  tRNA-Lys  97.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000453984  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0097  tRNA-Lys  97.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00156576  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5833  tRNA-Lys  97.3 
 
 		 78 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00233495  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  97.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000787215  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  97.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000045502  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  97.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-4  tRNA-Lys  97.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.067054  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-5  tRNA-Lys  97.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00169345  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0051  tRNA-Thr  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.124425  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0152  tRNA-Lys  97.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000001938  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0856  tRNA-Lys  97.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000473646  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5654  tRNA-Lys  97.3 
 
 		 78 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000664356  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5018  tRNA-Lys  97.3 
 
 		 78 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00214823  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0127  tRNA-Lys  97.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.615577  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5635  tRNA-Lys  97.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.112483  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5803  tRNA-Lys  97.3 
 
 		 78 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0081474  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5670  tRNA-Lys  97.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000995233  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5656  tRNA-Lys  97.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000763421  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>