19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_R0058 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_R0058  tRNA-Lys  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0021  tRNA-Lys  98.65 
 
 		 74 bp  139  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00204065  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0053  tRNA-Lys  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.231894  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0031  tRNA-Lys  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0007  tRNA-Lys  91.89 
 
 		 73 bp  91.7  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.40291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0034  tRNA-Lys  95.92 
 
 		 74 bp  81.8  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.336319  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0040  tRNA-Lys  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00746142 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0055  tRNA-Lys  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0073  tRNA-Lys  93.62 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0006  tRNA-Lys  89.29 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.507736 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0027  tRNA-Lys  93.18 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0006  tRNA-Lys  87.1 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0035  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0005  tRNA-Lys  87.27 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0004  tRNA-Lys  87.27 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0002  tRNA-Lys  93.94 
 
 		 88 bp  50.1  0.00007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0260065  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0057  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0047  tRNA-Lys  96.3 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.271132  normal  0.595667 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0028  tRNA-Lys  88.37 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000102441  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>