20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_R0034 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_R0034  tRNA-Lys  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.336319  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0006  tRNA-Lys  90.54 
 
 
74 bp  91.7  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0021  tRNA-Lys  97.96 
 
 
74 bp  89.7  8e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00204065  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0073  tRNA-Lys  92.19 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0027  tRNA-Lys  93.1 
 
 
77 bp  83.8  0.000000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0007  tRNA-Lys  90.54 
 
 
73 bp  83.8  0.000000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.40291  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0058  tRNA-Lys  95.92 
 
 
74 bp  81.8  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0055  tRNA-Lys  86.49 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0053  tRNA-Lys  91.84 
 
 
74 bp  65.9  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.231894  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0031  tRNA-Lys  91.84 
 
 
74 bp  65.9  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0006  tRNA-Lys  87.93 
 
 
74 bp  60  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.507736 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0047  tRNA-Lys  83.78 
 
 
74 bp  52  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.271132  normal  0.595667 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0028  tRNA-Lys  86.89 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.903037  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0005  tRNA-Lys  85.96 
 
 
74 bp  50.1  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0004  tRNA-Lys  85.96 
 
 
74 bp  50.1  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0002  tRNA-Lys  93.94 
 
 
88 bp  50.1  0.00007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0260065  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0048  tRNA-Lys  96.3 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.048263  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0057  tRNA-Lys  84.48 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0022  tRNA-Lys  86.96 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134574 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0035  tRNA-Lys  84.48 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>