22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4206 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_2490  hypothetical protein  66.73 
 
 		 498 aa  689    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4206  hypothetical protein  100 
 
 		 499 aa  1023    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1410  reverse transcriptase  42.66 
 
 		 505 aa  386  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.657461  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0969  hypothetical protein  29.73 
 
 		 510 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.670646 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0574  hypothetical protein  29.91 
 
 		 527 aa  93.2  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0384  hypothetical protein  38.17 
 
 		 533 aa  90.1  9e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.686449  normal  0.193753 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0549  hypothetical protein, putative phage gene  36.36 
 
 		 530 aa  84.7  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.444707  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2910  hypothetical protein  31.65 
 
 		 670 aa  82.8  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00903666 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0552  hypothetical protein  32.12 
 
 		 512 aa  80.9  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3026  hypothetical protein  31.47 
 
 		 672 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2087  hypothetical protein  24.04 
 
 		 533 aa  72.8  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.298307  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1305  hypothetical protein  31.82 
 
 		 673 aa  70.9  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0182944  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1469  hypothetical protein  24.59 
 
 		 543 aa  70.5  0.00000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0521715  normal  0.76039 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1069  hypothetical protein  26.21 
 
 		 331 aa  70.1  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0900877 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1153  hypothetical protein  31.85 
 
 		 557 aa  68.2  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0573  putative DNA-binding protein  30.13 
 
 		 667 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000329347  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4255  hypothetical protein  32.81 
 
 		 558 aa  67.8  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.669454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3925  hypothetical protein  26.47 
 
 		 555 aa  50.1  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.363945  hitchhiker  0.000094767 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2677  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  31.33 
 
 		 447 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2214  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  33.71 
 
 		 364 aa  47.8  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1235  hypothetical protein  26.09 
 
 		 311 aa  47  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.192457 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2459  CRISPR-associated protein Cas1  28.09 
 
 		 727 aa  44.7  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.670262  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>