84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3728 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3728  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  256  7e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.04039  normal  0.0800584 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4078  hypothetical protein  81.89 
 
 		 127 aa  215  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000581683  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3371  hypothetical protein  80.95 
 
 		 127 aa  211  3.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.994357  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3269  hypothetical protein  77.95 
 
 		 127 aa  208  2e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3708  hypothetical protein  77.95 
 
 		 127 aa  207  5e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0849  hypothetical protein  77.17 
 
 		 127 aa  204  5e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3173  hypothetical protein  76.38 
 
 		 127 aa  203  7e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1010  hypothetical protein  75.59 
 
 		 127 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1022  hypothetical protein  75.59 
 
 		 127 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.833543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3353  hypothetical protein  74.8 
 
 		 127 aa  197  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3004  hypothetical protein  74.8 
 
 		 127 aa  197  5e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.182987  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0988  hypothetical protein  74.8 
 
 		 127 aa  196  9e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0906  hypothetical protein  68.5 
 
 		 127 aa  181  3e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2866  hypothetical protein  68.5 
 
 		 127 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0720  hypothetical protein  71.93 
 
 		 128 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0936  hypothetical protein  69.72 
 
 		 127 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000828174  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2164  hypothetical protein  56.45 
 
 		 128 aa  148  2e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2191  hypothetical protein  56.45 
 
 		 128 aa  148  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1222  hypothetical protein  58.4 
 
 		 128 aa  145  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1621  hypothetical protein  47.06 
 
 		 133 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.183989  normal  0.047816 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2496  membrane protein-like protein  48.28 
 
 		 130 aa  103  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.040419  normal  0.199912 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4503  membrane protein-like protein  39.68 
 
 		 123 aa  87  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.151573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1964  membrane protein-like  39.06 
 
 		 123 aa  84  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0756  hypothetical protein  45.67 
 
 		 129 aa  83.6  8e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3491  membrane protein-like protein  39.06 
 
 		 123 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.314493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3444  membrane protein-like protein  38.89 
 
 		 123 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.579203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4079  membrane protein-like protein  38.89 
 
 		 123 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4287  membrane protein-like  38.89 
 
 		 123 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3977  membrane protein-like protein  39.06 
 
 		 123 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.109107  normal  0.438253 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1928  transmembrane protein  37.98 
 
 		 123 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.696294  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0661  hypothetical protein  37.98 
 
 		 152 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.850631  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0752  hypothetical protein  38.84 
 
 		 243 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2042  hypothetical protein  38.84 
 
 		 243 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0788  hypothetical protein  37.01 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.784909 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2271  membrane protein-like  35.2 
 
 		 159 aa  71.6  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0734  putative transmembrane protein  40.71 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106149  normal  0.720932 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1679  membrane protein-like protein  35.59 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.384201 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0493  hypothetical protein  37.4 
 
 		 128 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1132  hypothetical protein  40.18 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.202391  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0804  hypothetical protein  39.82 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0294  membrane protein-like protein  42.97 
 
 		 123 aa  70.1  0.000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0321  membrane protein-like protein  38.4 
 
 		 123 aa  70.1  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0441228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5021  hypothetical protein  37.4 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850985 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1356  hypothetical protein  32.81 
 
 		 135 aa  67  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0636538 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5274  hypothetical protein  38.84 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4972  hypothetical protein  35.04 
 
 		 128 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07020  hypothetical protein  35.9 
 
 		 128 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0831  transmembrane protein  37.1 
 
 		 128 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.212434  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2000  hypothetical protein  36.94 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2333  membrane protein-like protein  35.88 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.632219  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4845  hypothetical protein  34.96 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.126737  normal  0.62859 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0643  hypothetical protein  36.07 
 
 		 128 aa  62  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2432  hypothetical protein  35.61 
 
 		 128 aa  62  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.687414  normal  0.0885444 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02203  hypothetical protein  32.03 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0816  hypothetical protein  38.98 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0838282 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0450  membrane protein-like protein  35.83 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4798  hypothetical protein  35.04 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467764 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0927  hypothetical protein  33.86 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1826  hypothetical protein  31.45 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1852  hypothetical protein  31.45 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0380  hypothetical protein  34.51 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2325  membrane protein-like protein  37.62 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540964 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3416  hypothetical protein  33.33 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2647  hypothetical protein  36.15 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00167697 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2531  hypothetical protein  38.95 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.247104  normal  0.592717 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1027  hypothetical protein  33.33 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  hitchhiker  0.00407266  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0464  hypothetical protein  32.35 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11791  hypothetical protein  32.35 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.469395  normal  0.0438894 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2744  hypothetical protein  35 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.200077 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0546  hypothetical protein  36.27 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00496628  normal  0.323074 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11071  hypothetical protein  32.46 
 
 		 134 aa  51.6  0.000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11061  hypothetical protein  32.46 
 
 		 134 aa  50.4  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0277619  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2308  hypothetical protein  32.79 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.868044 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4900  membrane protein-like protein  38.14 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0182  hypothetical protein  33.33 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0523  hypothetical protein  29.69 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2347  membrane protein-like protein  38.21 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1510  membrane protein-like protein  38.21 
 
 		 131 aa  47.8  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0276  hypothetical protein  32.35 
 
 		 133 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.440842 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2005  hypothetical protein  35.96 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0651  hypothetical protein  32.99 
 
 		 132 aa  45.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2885  hypothetical protein  30 
 
 		 129 aa  45.4  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.241636  normal  0.197361 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11021  hypothetical protein  30.3 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2571  putative transmembrane protein  28.23 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0175942  hitchhiker  0.0000688239 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>