170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2767 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2767  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 390 aa  798    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.645356  normal  0.0391357 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1873  glycosyl transferase family protein  53.87 
 
 		 376 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.597248  hitchhiker  0.00000310641 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1809  glycosyl transferase family protein  41.38 
 
 		 408 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.747407  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1507  glycosyl transferase family protein  48.07 
 
 		 392 aa  263  4e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05584  hypothetical protein  32.5 
 
 		 317 aa  159  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001604  glycosyl transferase family 3  32.38 
 
 		 317 aa  157  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0848  hypothetical protein  30.53 
 
 		 334 aa  155  1e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3401  hypothetical protein  31 
 
 		 334 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.51245 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1161  hypothetical protein  31.85 
 
 		 327 aa  145  2e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.18822  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30360  hypothetical protein  32.95 
 
 		 327 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3602  hypothetical protein  32.47 
 
 		 333 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393373 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1665  hypothetical protein  33.33 
 
 		 332 aa  140  4.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2599  hypothetical protein  32.18 
 
 		 327 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.733501  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3997  hypothetical protein  29.95 
 
 		 333 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.937914  hitchhiker  0.00618755 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1836  hypothetical protein  29.95 
 
 		 333 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000267985 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2381  hypothetical protein  30.83 
 
 		 331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148789  normal  0.0161209 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28160  hypothetical protein  32.5 
 
 		 328 aa  132  6.999999999999999e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3579  hypothetical protein  31.42 
 
 		 333 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50188 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3172  hypothetical protein  31.03 
 
 		 333 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.102896  normal  0.287439 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3342  glycosyl transferase, putative  30.65 
 
 		 333 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.534413  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2530  hypothetical protein  29.64 
 
 		 361 aa  124  4e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03656  hypothetical protein  30.04 
 
 		 331 aa  122  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2812  glycosyl transferase family protein  32.41 
 
 		 337 aa  113  7.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3046  hypothetical protein  34.45 
 
 		 319 aa  97.1  5e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0326711  normal  0.877697 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1670  hypothetical protein  32.83 
 
 		 323 aa  93.6  6e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0478591  normal  0.302071 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2358  Anthranilate phosphoribosyltransferase  29.95 
 
 		 346 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0253  glycosyl transferase family protein  27.3 
 
 		 336 aa  84.3  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.186746 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3794  hypothetical protein  27.83 
 
 		 491 aa  84  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.516461  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0234  glycosyl transferase family protein  27.3 
 
 		 336 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2842  glycosyl transferase family protein  29.15 
 
 		 309 aa  75.9  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1003  glycosyl transferase family protein  27.98 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4280  hypothetical protein  27.65 
 
 		 506 aa  73.6  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2331  glycosyl transferase family protein  28.64 
 
 		 309 aa  72.8  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0852797  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3531  glycosyl transferase family protein  24.71 
 
 		 301 aa  70.9  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.447147  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2293  glycosyl transferase family protein  24.8 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.129801  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2882  glycosyl transferase family protein  23.94 
 
 		 304 aa  69.3  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2104  glycosyl transferase family protein  28.78 
 
 		 308 aa  69.3  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0754859  normal  0.466514 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3296  glycosyl transferase family protein  25.56 
 
 		 304 aa  68.6  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0655575  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1403  glycosyl transferase family protein  25.39 
 
 		 301 aa  68.9  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.508618 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1934  anthranilate phosphoribosyltransferase  30.29 
 
 		 332 aa  67  0.0000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0378  glycosyl transferase family protein  28.44 
 
 		 339 aa  66.6  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0274  glycosyl transferase family protein  28.29 
 
 		 329 aa  66.2  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.226663 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01237  bifunctional indole-3-glycerol-phosphate synthase/anthranilate phosphoribosyltransferase  29.33 
 
 		 531 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2385  anthranilate phosphoribosyltransferase  29.33 
 
 		 531 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.101159  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01247  hypothetical protein  29.33 
 
 		 531 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1372  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  29.33 
 
 		 531 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1462  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  29.33 
 
 		 531 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0572778  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2364  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  29.33 
 
 		 531 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000426482 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1488  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  29.33 
 
 		 531 aa  64.7  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1869  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  29.33 
 
 		 531 aa  64.7  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000144467 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1914  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  28.85 
 
 		 531 aa  63.5  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000009579 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1856  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  28.85 
 
 		 531 aa  63.9  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.436165 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1851  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  28.85 
 
 		 531 aa  63.9  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.468374  hitchhiker  0.00404515 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1604  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  29.86 
 
 		 531 aa  63.9  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.262187  hitchhiker  0.00317716 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1422  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  28.85 
 
 		 531 aa  63.5  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0327  glycosyl transferase family protein  28.04 
 
 		 336 aa  63.5  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3280  glycosyl transferase family protein  25.38 
 
 		 301 aa  62.8  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1895  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  29.69 
 
 		 531 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000854588 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2205  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  28.51 
 
 		 531 aa  62.8  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0147074 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2690  glycosyl transferase family protein  27.04 
 
 		 309 aa  62  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.335373 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0815  glycosyl transferase family protein  24.81 
 
 		 329 aa  61.2  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0303571  hitchhiker  0.00126727 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0575  glycosyl transferase family protein  27.88 
 
 		 323 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.596232  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2871  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 		 332 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4143  glycosyl transferase family protein  27.88 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3133  glycosyl transferase family protein  28.92 
 
 		 326 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2729  glycosyl transferase family protein  28.24 
 
 		 332 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0102  glycosyl transferase family protein  28.92 
 
 		 326 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1487  glycosyl transferase family protein  28.92 
 
 		 326 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0555  glycosyl transferase family protein  28.92 
 
 		 326 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0570  glycosyl transferase family protein  28.92 
 
 		 326 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2916  glycosyl transferase family protein  28.92 
 
 		 326 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2669  anthranilate phosphoribosyltransferase  29.33 
 
 		 332 aa  59.3  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000027862 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2005  anthranilate phosphoribosyltransferase  27.88 
 
 		 355 aa  58.5  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.615298  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0461  glycosyl transferase family protein  27.94 
 
 		 354 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2369  glycosyl transferase family protein  26.89 
 
 		 316 aa  58.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0738  glycosyl transferase family protein  28.92 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1290  glycosyl transferase family protein  23.7 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.127601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2174  anthranilate phosphoribosyltransferase  28.96 
 
 		 332 aa  57.8  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.580096  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0711  anthranilate phosphoribosyltransferase  25.5 
 
 		 338 aa  57.4  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0993387 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2197  glycosyl transferase family protein  28.29 
 
 		 324 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2811  glycosyl transferase family protein  28.29 
 
 		 324 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2822  glycosyl transferase family protein  28.29 
 
 		 324 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0873  anthranilate phosphoribosyltransferase  25.12 
 
 		 345 aa  57.4  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2304  anthranilate phosphoribosyltransferase  27.4 
 
 		 332 aa  56.6  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2494  glycosyl transferase family protein  26.79 
 
 		 322 aa  57  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3098  anthranilate phosphoribosyltransferase  25 
 
 		 338 aa  56.6  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.813177 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2001  anthranilate phosphoribosyltransferase  25.5 
 
 		 338 aa  56.2  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481302  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0490  glycosyl transferase family protein  28.29 
 
 		 369 aa  55.8  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1539  anthranilate phosphoribosyltransferase  25.85 
 
 		 341 aa  55.1  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2320  glycosyl transferase family protein  27.48 
 
 		 318 aa  55.1  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.101648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1281  anthranilate phosphoribosyltransferase  26.58 
 
 		 336 aa  55.1  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.850857  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6141  glycosyl transferase family protein  27.8 
 
 		 324 aa  54.3  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1558  anthranilate phosphoribosyltransferase  24.02 
 
 		 335 aa  54.7  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.145507  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0692  anthranilate phosphoribosyltransferase  26.92 
 
 		 336 aa  54.7  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2882  glycosyl transferase family protein  22.57 
 
 		 322 aa  54.3  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1580  glycosyl transferase family protein  24.64 
 
 		 322 aa  52.4  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1253  anthranilate phosphoribosyltransferase  24.58 
 
 		 341 aa  51.6  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0188  anthranilate phosphoribosyltransferase  23.9 
 
 		 336 aa  52  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1140  anthranilate phosphoribosyltransferase  25 
 
 		 340 aa  51.2  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.493316 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0374  anthranilate phosphoribosyltransferase  24.88 
 
 		 337 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.250133 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>