30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2241 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2241  hypothetical protein  100 
 
 		 349 aa  731    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.235594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2384  hypothetical protein  56.47 
 
 		 335 aa  391  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.728607 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2096  hypothetical protein  48.55 
 
 		 340 aa  341  1e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0262717  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0876  protein of unknown function DUF227  50.15 
 
 		 332 aa  319  3.9999999999999996e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.620129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4225  hypothetical protein  46.24 
 
 		 333 aa  316  4e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.265608 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2009  hypothetical protein  45.95 
 
 		 359 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.741438  normal  0.129044 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1286  hypothetical protein  46.06 
 
 		 320 aa  296  3e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00430498  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3627  hypothetical protein  42.82 
 
 		 329 aa  281  9e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001235  hypothetical protein  43.45 
 
 		 332 aa  278  1e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.676733  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3439  hypothetical protein  43.2 
 
 		 339 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05102  hypothetical protein  41.72 
 
 		 328 aa  264  1e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02343  hypothetical protein  38.98 
 
 		 364 aa  225  8e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.445961  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50054  predicted protein  29.65 
 
 		 352 aa  99.4  9e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.702034  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03770  conserved hypothetical protein  22.95 
 
 		 414 aa  65.9  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4330  hypothetical protein  26.63 
 
 		 350 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2016  aminoglycoside phosphotransferase  25.45 
 
 		 367 aa  52  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1766  hypothetical protein  28.14 
 
 		 384 aa  50.8  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00135853  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3433  aminoglycoside phosphotransferase  36.23 
 
 		 359 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0252368  normal  0.972006 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0367  aminoglycoside phosphotransferase  25.63 
 
 		 362 aa  47  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2523  aminoglycoside phosphotransferase  31.11 
 
 		 359 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238738  normal  0.0936723 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0625  hypothetical protein  25 
 
 		 345 aa  45.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2557  aminoglycoside phosphotransferase  25.13 
 
 		 667 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.898182  normal  0.739218 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2531  aminoglycoside phosphotransferase  31.11 
 
 		 359 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  0.606959 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2512  aminoglycoside phosphotransferase  25.13 
 
 		 667 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2486  aminoglycoside phosphotransferase  31.11 
 
 		 359 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3155  hypothetical protein  34.21 
 
 		 678 aa  45.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3102  aminoglycoside phosphotransferase  31.25 
 
 		 365 aa  45.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2549  hypothetical protein  26.55 
 
 		 667 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.616235 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3374  aminoglycoside phosphotransferase  32.98 
 
 		 661 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116531 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2246  hypothetical protein  34.69 
 
 		 346 aa  42.7  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>